Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology

Công bố khoa học tiêu biểu

* Dữ liệu chỉ mang tính chất tham khảo

Sắp xếp:  
A Shrinkage Approach to Large-Scale Covariance Matrix Estimation and Implications for Functional Genomics
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 4 Số 1 - 2005
Juliane Schäfer, Korbinian Strimmer
Inferring large-scale covariance matrices from sparse genomic data is an ubiquitous problem in bioinformatics. Clearly, the widely used standard covariance and correlation estimators are ill-suited for this purpose. As statistically efficient and computationally fast alternative we propose a novel shrinkage covariance estimator that exploits the Ledoit-Wolf (2003) lemma for analytic calculation of... hiện toàn bộ
Sparse Canonical Correlation Analysis with Application to Genomic Data Integration
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 8 Số 1 - Trang 1-34 - 2009
Elena Parkhomenko, David Tritchler, Joseph Beyene
Error Distribution for Gene Expression Data
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 4 Số 1 - 2005
Elizabeth Purdom, Susan Holmes
We present a new instance of Laplace's second Law of Errors and show how it can be used in the analysis of data from microarray experiments. This error distribution is shown to fit microarray expression data much better than a normal distribution. The use of this distribution in a parametric bootstrap leads to more powerful tests as we show that the t-test is conservative in this setting. We propo... hiện toàn bộ
A Bayesian framework for identifying consistent patterns of microbial abundance between body sites
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 18 Số 6 - 2019
Richard Meier, Jeffrey Thompson, Mei Chung, Naisi Zhao, Karl T. Kelsey, Dominique S. Michaud, Devin C. Koestler
Abstract Recent studies have found that the microbiome in both gut and mouth are associated with diseases of the gut, including cancer. If resident microbes could be found to exhibit consistent patterns between the mouth and gut, disease status could potentially be assessed non-invasively through profiling of oral samples. Currently, there exists no generally applicable method to test for such ass... hiện toàn bộ
Sparse Partial Least Squares Classification for High Dimensional Data
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 9 Số 1 - 2010
Dongjun Chung, Sündüz Keleş
Extensions of Sparse Canonical Correlation Analysis with Applications to Genomic Data
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 8 Số 1 - Trang 1-27 - 2009
Daniela Witten, Robert Tibshirani
Quantifying the Association between Gene Expressions and DNA-Markers by Penalized Canonical Correlation Analysis
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 7 Số 1 - 2008
Sandra Waaijenborg, Philip C. De Witt Hamer, Aeilko H. Zwinderman
A Sparse PLS for Variable Selection when Integrating Omics Data
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 7 Số 1 - 2008
Kim‐Anh Lê Cao, Debra Rossouw, Christian P. Robert, Philippe Besse
TopKLists: a comprehensive R package for statistical inference, stochastic aggregation, and visualization of multiple omics ranked lists
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 14 Số 3 - 2015
Michael G. Schimek, Eva Budínská, Karl Kugler, Vendula Švendová, Jie Ding, Shili Lin
AbstractHigh-throughput sequencing techniques are increasingly affordable and produce massive amounts of data. Together with other high-throughput technologies, such as microarrays, there are an enormous amount of resources in databases. The collection of these valuable data has been routine for more than a decade. Despite different technologies, many experiments share the same goal. For instance,... hiện toàn bộ
Mô hình tuyến tính và phương pháp Bayes thực nghiệm để đánh giá sự biểu hiện khác biệt trong các thí nghiệm vi mạch Dịch bởi AI
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology - Tập 3 Số 1 - Trang 1-25 - 2004
Gordon K. Smyth
Vấn đề xác định các gen được biểu hiện khác biệt trong các thí nghiệm vi mạch được thiết kế đã được xem xét. Lonnstedt và Speed (2002) đã đưa ra một biểu thức cho tỷ lệ hậu nghiệm của sự biểu hiện khác biệt trong một thí nghiệm hai màu được lặp lại bằng cách sử dụng một mô hình tham số phân cấp đơn giản. Mục đích của bài báo này là phát triển mô hình phân cấp của Lonnstedt và Speed (2002) thành mộ... hiện toàn bộ
Tổng số: 14   
  • 1
  • 2