Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology
SCIE-ISI SCOPUS (2004-2023)
1544-6115
2194-6302
Đức
Cơ quản chủ quản: Walter de Gruyter GmbH
Lĩnh vực:
Computational MathematicsMolecular BiologyGeneticsStatistics and Probability
Các bài báo tiêu biểu
Mô hình tuyến tính và phương pháp Bayes thực nghiệm để đánh giá sự biểu hiện khác biệt trong các thí nghiệm vi mạch Dịch bởi AI Vấn đề xác định các gen được biểu hiện khác biệt trong các thí nghiệm vi mạch được thiết kế đã được xem xét. Lonnstedt và Speed (2002) đã đưa ra một biểu thức cho tỷ lệ hậu nghiệm của sự biểu hiện khác biệt trong một thí nghiệm hai màu được lặp lại bằng cách sử dụng một mô hình tham số phân cấp đơn giản. Mục đích của bài báo này là phát triển mô hình phân cấp của Lonnstedt và Speed (2002) ... ... hiện toàn bộ
Tập 3 Số 1 - Trang 1-25 - 2004
A General Framework for Weighted Gene Co-Expression Network AnalysisGene co-expression networks are increasingly used to explore the system-level functionality of genes. The network construction is conceptually straightforward: nodes represent genes and nodes are connected if the corresponding genes are significantly co-expressed across appropriately chosen tissue samples. In reality, it is tricky to define the connections between the nodes in such network... ... hiện toàn bộ
Tập 4 Số 1 - 2005
A Shrinkage Approach to Large-Scale Covariance Matrix Estimation and Implications for Functional GenomicsInferring large-scale covariance matrices from sparse genomic data is an ubiquitous problem in bioinformatics. Clearly, the widely used standard covariance and correlation estimators are ill-suited for this purpose. As statistically efficient and computationally fast alternative we propose a novel shrinkage covariance estimator that exploits the Ledoit-Wolf (2003) lemma for analytic calcul... ... hiện toàn bộ
Tập 4 Số 1 - 2005
Extensions of Sparse Canonical Correlation Analysis with Applications to Genomic Data
Tập 8 Số 1 - Trang 1-27 - 2009
Sparse Canonical Correlation Analysis with Application to Genomic Data Integration
Tập 8 Số 1 - Trang 1-34 - 2009
Random Forests for Genetic Association StudiesThe Random Forests (RF) algorithm has become a commonly used machine learning algorithm for genetic association studies. It is well suited for genetic applications since it is both computationally efficient and models genetic causal mechanisms well. With its growing ubiquity, there has been inconsistent and less than optimal use of RF in the literature. The purpose of this review is to bre... ... hiện toàn bộ
Tập 10 Số 1 - 2011
Quantifying the Association between Gene Expressions and DNA-Markers by Penalized Canonical Correlation Analysis
Tập 7 Số 1 - 2008
Error Distribution for Gene Expression DataWe present a new instance of Laplace's second Law of Errors and show how it can be used in the analysis of data from microarray experiments. This error distribution is shown to fit microarray expression data much better than a normal distribution. The use of this distribution in a parametric bootstrap leads to more powerful tests as we show that the t-test is conservative in this setting. ... ... hiện toàn bộ
Tập 4 Số 1 - 2005