Oxford University Press (OUP)

Các gen trong gia đình ERF mã hóa các bộ điều hòa phiên mã với nhiều chức năng khác nhau liên quan đến các quá trình phát triển và sinh lý ở thực vật. Trong nghiên cứu này, một phân tích tính toán toàn diện đã xác định được 122 và 139 gen thuộc gia đình ERF ở cây Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) và gạo (Oryza sativa L. subsp. japonica), tương ứng. Bài báo trình bày một cái nhìn tổng quan hoàn chỉnh về gia đình gen này ở Arabidopsis, bao gồm cấu trúc gen, hệ thống phân loại, vị trí nhiễm sắc thể và các động thái bảo tồn. Thêm vào đó, một phân tích so sánh giữa các gen này ở Arabidopsis và gạo được thực hiện. Kết quả của các phân tích này cho thấy các gia đình ERF ở Arabidopsis và gạo được chia thành 12 và 15 nhóm, tương ứng, và một số nhóm trong số này được chia thành các tiểu nhóm. Dựa trên quan sát rằng 11 nhóm trong số này có mặt ở cả Arabidopsis và gạo, chúng tôi kết luận rằng sự đa dạng chức năng chính trong gia đình ERF đã diễn ra trước sự phân tách giữa thực vật một lá mầm và thực vật hai lá mầm. Ngược lại, một số nhóm/tiểu nhóm thì đặc trưng cho các loài cụ thể. Chúng tôi thảo luận về mối quan hệ giữa cấu trúc và chức năng của các protein trong gia đình ERF dựa trên các kết quả này và thông tin đã được công bố. Hơn nữa, chúng tôi kết luận rằng sự mở rộng của gia đình ERF ở thực vật có thể là do quá trình sao chép nhiễm sắc thể/phân đoạn và sao chép chuỗi, cũng như quá trình dịch chuyển cổ xưa hơn và định vị. Những kết quả này sẽ hữu ích cho các phân tích chức năng tương lai của các gen thuộc gia đình ERF.