thumbnail

Genome Biology

SCIE-ISI

  1474-760X

 

 

Cơ quản chủ quản:  BMC

Lĩnh vực:
Biotechnology & Applied MicrobiologyGenetics & Heredity

Các bài báo tiêu biểu

Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2
- 2014
Michael I. Love, Wolfgang Huber, Simon Anders
Model-based Analysis of ChIP-Seq (MACS)
Tập 9 Số 9 - 2008
Yong Zhang, Tao Liu, Clifford A. Meyer, Jérôme Eeckhoute, David S. Johnson, B Bernstein, Chad Nusbaum, R Myers, Myles Brown, Wei Li, X. Shirley Liu
DAVID: Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery
Tập 4 Số 5 - 2003
Glynn Dennis, Brad T. Sherman, Douglas A Hosack, Jun Yang, Wei Gao, H. Clifford Lane, Richard A. Lempicki
Ghi nhãn cấu trúc gen eukaryote tự động bằng EVidenceModeler và Chương trình lắp ghép các căn chỉnh đã cắt ghép Dịch bởi AI
Tập 9 Số 1
Brian J. Haas, Steven L. Salzberg, Wei Zhu, Mihaela Pertea, Jonathan Allen, Joshua Orvis, Owen White, C. Robin Buell, Jennifer R. Wortman
Tóm tắtEVidenceModeler (EVM) được trình bày như một công cụ ghi nhãn cấu trúc gen eukaryote tự động, báo cáo các cấu trúc gen eukaryote dưới dạng sự đồng thuận có trọng số của tất cả các bằng chứng hiện có. Khi được kết hợp với Chương trình lắp ghép các căn chỉnh đã cắt ghép (PASA), EVM tạo ra một hệ thống ghi nhãn toàn diện và có thể cấu hình để dự đoán các gen mã...... hiện toàn bộ
A survey of best practices for RNA-seq data analysis
Tập 17 Số 1 - 2016
Ana Conesa, Pedro Madrigal, Sonia Tarazona, David Gomez-Cabrero, Alejandra Cervera, Andrew McPherson, Michał Wojciech Szcześniak, Daniel J. Gaffney, Laura L. Elo, Xuegong Zhang, A Mortazavi
HiC-Pro: an optimized and flexible pipeline for Hi-C data processing
Tập 16 Số 1 - 2015
Nicolas Servant, Nelle Varoquaux, Bryan R. Lajoie, Éric Viara, Chong Jian Chen, Jean-Philippe Vert, Edith Heard, Job Dekker, Emmanuel Barillot
Expression profiling of mammalian microRNAs uncovers a subset of brain-expressed microRNAs with possible roles in murine and human neuronal differentiation
Tập 5 Số 3
Lorenzo F. Sempere, Sarah J. Freemantle, Ian Pitha, Eric G. Moss, Ethan Dmitrovsky, Victor Ambros
Đánh giá các thuật toán chấm điểm off-target và on-target và tích hợp vào công cụ lựa chọn RNA hướng dẫn CRISPOR Dịch bởi AI
Tập 17 Số 1 - 2016
Maximilian Haeussler, Kai Shi, Hélène Eckert, Alexis Eschstruth, Joffrey Mianné, Jean Renaud, Sylvie Schneider‐Maunoury, Alena Shkumatava, Lydia Teboul, J. H. Kent, Jean‐Stéphane Joly, Jean‐Paul Concordet
Tóm tắt Giới thiệu Thành công của công nghệ chỉnh sửa gen CRISPR/Cas9 phụ thuộc vào việc lựa chọn trình tự RNA hướng dẫn, điều này được hỗ trợ bởi nhiều trang web khác nhau. Mặc dù tầm quan trọng và sự phổ biến của các thuật toán này, nhưng vẫn chưa rõ mức độ đồng thuận giữa các dự đoán của chúng...... hiện toàn bộ
BioGPS: an extensible and customizable portal for querying and organizing gene annotation resources
Tập 10 Số 11 - 2009
Chunlei Wu, Camilo Alberto Madariaga Orozco, Jason Boyer, Marc Leglise, James Goodale, Serge Batalov, Christopher L Hodge, J. Haase, Jeff Janes, Jon W. Huss, Andrew I. Su