Phân tích cDNA-AFLP làm sáng tỏ một regulon hrpG toàn bộ bộ gen trong mầm bệnh thực vật Xanthomonas campestris pv. vesicatoria

Molecular Microbiology - Tập 41 Số 6 - Trang 1271-1281 - 2001
Laurent D. Noël1, Frank Thieme1, Dirk Nennstiel2, Ulla Bonas3
1Institut für Genetik, Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, D-06099 Halle (Saale), Germany
2†Present address: Bayer-AG Zentrale Forschung, D-51368 Leverkusen, Germany.
3*For correspondence. E-mail: [email protected]; Tel. (+49) 345 552 6290; Fax: (+49) 345 552 7277.

Tóm tắt

Hệ thống tiết protein kiểu III Hrp là yếu tố cần thiết cho khả năng gây bệnh của mầm bệnh thực vật Gram âm Xanthomonas campestris pv. vesicatoria. Sự biểu hiện của cụm gen hrp được điều khiển bởi HrpG, một bộ điều chỉnh phản hồi hai thành phần, và HrpX, một chất kích hoạt phiên mã kiểu AraC. Sử dụng kỹ thuật cDNA-AFLP, 30 đoạn cDNA được kích thích bởi hrpG (hgi) và năm đoạn cDNA chịu áp lực bởi hrpG (hgr) đã được xác định, cấu định một regulon hrpG lớn trong X. campestris pv. vesicatoria. Sự biểu hiện của hầu hết các gen trong regulon hrpG phụ thuộc vào hrpX. Bảy đoạn cDNA ảnh hưởng đến cụm gen hrp đã biết và các vùng lân cận. Tất cả các gen khác có vẻ như được phân bố trên nhiễm sắc thể và plasmid bản địa. Phân tích trình tự đã xác định được các gen mã hóa cho các protease ngoại bào dự kiến, một bộ điều chỉnh phiên mã dự kiến và XopJ và XopB (Xanthomonas protein ngoại vi), là đồng dạng của YopJ từ các loài Yersinia và protein bất khả năng gây bệnh AvrPphD của Pseudomonas syringae tương ứng. XopB được tiết ra bởi hệ thống tiết kiểu III Hrp. Phân tích các đột biến xóa trong một số gen hgi đã tiết lộ một locus virulence mới. Nghiên cứu này cho thấy rằng cDNA-AFLP là một công cụ mạnh mẽ để nghiên cứu transcriptome prokaryote và xác định các gen cung cấp khả năng gây bệnh cho Xanthomonas và các protein tác động dự kiến.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Aiba H., 1981, Evidence of two functional gal promoters in intact Escherichia coli cells, J Biol Chem, 256, 11905, 10.1016/S0021-9258(19)68491-7

10.1093/emboj/19.10.2304

10.1073/pnas.97.9.4856

10.1002/j.1460-2075.1994.tb06292.x

10.1006/pmpp.2000.0315

10.1094/MPMI.2000.13.9.911

Ausubel F.M., 1996, Current Protocols in Molecular Biology.

10.1046/j.1365-313X.1996.9050745.x

10.1046/j.1365-2958.1996.5731077.x

10.1094/MPMI-4-081

Canteros B.J.(1990)Diversity of plasmids and plasmid‐encoded phenotypic traits inXanthomonas campestrispv.vesicatoria.FL:University of Florida pp.182

10.1146/annurev.micro.54.1.735

10.1128/MMBR.62.4.1315-1352.1998

10.1002/j.1460-2075.1984.tb02298.x

10.1099/00221287-146-1-165

10.1073/pnas.77.12.7347

10.1046/j.1464-6722.2001.00077.x

10.1094/MPMI-8-0845

10.1094/MPMI-5-390

10.1073/pnas.76.4.1648

10.1126/science.284.5418.1322

10.1046/j.1365-2958.2000.01870.x

10.1046/j.1365-2958.1998.01019.x

10.1073/pnas.96.19.10875

10.1016/B978-0-12-509002-5.50017-3

10.1128/jb.175.18.5899-5906.1993

10.1094/MPMI-3-041

10.1126/science.290.5496.1594

10.1007/s001220051477

10.1046/j.1462-2920.1999.00040.x

10.1073/pnas.96.16.9368

10.1046/j.1365-2958.2000.02173.x

10.1128/jb.174.3.815-823.1992

10.1007/BF00327195

10.1128/JB.178.12.3462-3469.1996

10.1094/MPMI-9-0704

10.1128/JB.181.21.6828-6831.1999

10.1094/MPMI-6-616

10.1016/S1369-5266(00)00082-0

10.1046/j.1365-2958.2000.01902.x

10.1128/JB.182.7.1844-1853.2000

Thông tin
Thông tin xuất bản

Molecular Microbiology

Tập 41 Số 6

1271-1281

Thông tin tác giả