Thiết lập phương pháp multiplex PCR để phát hiện đồng thời hai trình tự mục tiêu của Chlamydia trachomatis

Academia Journal of Biology - Tập 39 Số 1 - Trang 108-114 - 2016
Nguyen Nam Thang1, Bui Duc Do, Nguyen Thi Hoa, Tran Thi Hoa, Phan Ngoc Quang, Bui Huong Dung, Dong Van Quyen

Tóm tắt

PCR là một kỹ thuật thường được áp dụng trong việc sàng lọc các nhiễm trùng đường sinh dục do Chlamydia trachomatis (CT) gây ra. Vì một số chủng CT có thể không có plasmid, nên kỹ thuật PCR sử dụng trình tự DNA plasmid làm mục tiêu có thể dẫn đến kết quả âm tính giả. Nghiên cứu này đã phát triển một bài kiểm tra multiplex PCR (mPCR) có khả năng phát hiện cả trình tự DNA plasmid và gen omp1 của CT nhằm tránh những kết quả âm tính giả này. Ban đầu, 7 cặp mồi đã được thiết kế dựa trên trình tự DNA plasmid và gen omp1 của CT. Sau khi được thử nghiệm ở các điều kiện khác nhau, hai cặp mồi CTM-F1R1 và CTP-F1R2 cuối cùng đã được chọn để sử dụng trong bài kiểm tra mPCR có thể đồng thời phát hiện các trình tự cụ thể trên DNA plasmid (434 bp) và trên gen omp1 (153 bp). CT có thể được phát hiện bằng mPCR nếu có 5 hoặc nhiều hơn các bản sao của gen omp1 và/hoặc 5 hoặc nhiều hơn các bản sao của plasmid trong các mẫu nghi ngờ. Bài kiểm tra đã được thực hiện trên 128 mẫu bông lấy từ cổ tử cung và kết quả sau đó đã được so sánh với kết quả của 2 bài kiểm tra PCR khác. Độ nhạy, độ đặc hiệu, giá trị dự đoán dương tính, giá trị dự đoán âm tính của bài kiểm tra mPCR đều đạt 100%. Hơn nữa, bài kiểm tra này có thể loại trừ các kết quả âm tính giả của các chủng CT không chứa plasmid. Do đó, bài kiểm tra đã được phát triển có thể được áp dụng trong chẩn đoán và/hoặc sàng lọc CT trong cộng đồng.

Từ khóa

#Chlamydia trachomatis #multiplex PCR #omp1 #plasmid