Sự tự liên kết của cyclotide kalata B2 trong dung dịch được điều hướng bởi các tương tác kỵ nước

Biopolymers - Tập 100 Số 5 - Trang 453-460 - 2013
K. Johan Rosengren1,2, Norelle L. Daly1, Peta J. Harvey1, David J. Craik1
1Institute for Molecular Bioscience, The University of Queensland, Brisbane, QLD 4072, Australia
2School of Biomedical Sciences, The University of Queensland, Brisbane, QLD 4072, Australia

Tóm tắt

TÓM TẮTCyclotide là một họ protein phòng thủ thực vật nhỏ có dạng vòng từ đầu đến đuôi. Ngoài việc có xương sống vòng, cyclotide bao gồm ba liên kết disulfide có một cấu trúc nút thắt, tạo ra một cấu trúc được gia cố chéo cao, cung cấp sự ổn định hóa học và proteolytic đặc biệt. Nhiều hoạt tính sinh học đã được liên kết với cyclotide, bao gồm tính độc hại với côn trùng, kháng khuẩn, kháng virus và độc tế bào, và những hoạt động này có liên quan đến khả năng nhắm mục tiêu và làm gián đoạn các màng sinh học. Kalata B2 và một phần ít hơn là kalata B1, được tách chiết từ Oldenlandia affinis, tự kết hợp thành tetramer và octamer trong các đệm nước, và sự oligomer hóa này được gợi ý là có liên quan đến khả năng của chúng trong việc tạo thành lỗ ở màng. Ở đây chúng tôi chứng minh bằng phân tích phổ NMR dung dịch rằng sự oligomer hóa của kalata B2 phụ thuộc vào nồng độ và liên quan đến việc đóng gói các dư lượng kỵ nước thường được lộ ra trên bề mặt của kalata B2 vào một lõi kỵ nước đa phân tử. Thú vị là, bề mặt kỵ nước đã được "qiến" có trước đây đã được chỉ ra là chịu trách nhiệm cho khả năng của kalata B2 trong việc chèn vào các màng. Do đó, dường như không có khả năng rằng các oligomer được quan sát trong dung dịch nước liên quan đến bất kỳ trạng thái đa phân tử nào có mặt trong môi trường màng, và chịu trách nhiệm cho việc hình thành lỗ. Khả năng tự liên kết có thể cung cấp một cơ chế để ngăn chặn độc tính tự phát khi được bảo quản ở nồng độ cao trong các khoang tế bào nội bào. © 2013 Wiley Periodicals, Inc. Biopolymers (Pept Sci) 100: 453–460, 2013.

Từ khóa

#cyclotide #kalata B2 #tự liên kết #tương tác kỵ nước #ổn định hóa học

Tài liệu tham khảo

10.1126/science.1125248

10.1128/JB.185.14.4011-4021.2003

10.1074/jbc.R111.300129

10.1126/science.286.5439.498

10.1006/jmbi.1999.3383

10.1002/bip.21424

10.1074/jbc.M211147200

10.1074/jbc.M308771200

10.1021/bi049711q

10.1039/b616856f

10.1074/jbc.M900021200

10.1016/j.addr.2009.05.003

10.1517/17460441.2012.661554

10.1016/j.bpj.2009.06.032

10.1111/j.1600-0773.1973.tb01541.x

10.1021/np50114a002

10.4161/cbt.1.4.9

Schöpke T., 1993, Sci Pharm, 61, 145

10.1021/ja00099a064

10.1074/jbc.M501737200

10.1021/np0499719

10.1073/pnas.96.16.8913

10.1093/jac/dkq220

10.1021/jf800302f

10.1021/bi800223y

10.1073/pnas.191366898

10.1021/bi047837h

10.1016/j.tplants.2009.03.003

10.1002/cbic.201100450

10.1016/j.jinorgbio.2008.01.018

10.1111/j.1742-4658.2006.05282.x

10.1016/j.ab.2004.10.028

10.1074/jbc.M111.253393

10.1074/jbc.M112.372011

10.1074/jbc.M112.421198

10.1016/j.bbamem.2011.07.004

10.1074/jbc.M109.003384

10.1073/pnas.0710338104

10.1074/jbc.M709303200

10.1002/cbic.200900342

10.1002/bip.20886

10.1128/AAC.00925-06

10.1074/jbc.M109.089854

10.1074/jbc.M306826200

Keller R. L. J., 2004, Computer Aided Resonance Assignment Tutorial

Koradi R., 1996, J Mol Graph, 14, 29

10.1074/jbc.M604992200

10.1074/jbc.M112.347823

10.3732/ajb.1100382

Gran L., 1973, Lloydia, 36, 174

10.1111/cbdd.12055

10.1182/blood-2011-06-359141

Thông tin
Thông tin xuất bản

Biopolymers

Tập 100 Số 5

453-460

Thông tin tác giả