Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Chiến lược nhanh chóng và hiệu quả để kiểm soát sự lây lan của SARS-CoV-2 Omicron: phân tích các đợt bùng phát ở cấp thành phố
Tóm tắt
Biến thể coronavirus gây hội chứng hô hấp cấp tính nặng 2 (SARS-CoV-2) Omicron (B.1.1.529) có khả năng lây truyền cao với khả năng thoát miễn dịch tiềm tàng. Do đó, các biện pháp kiểm soát đang được tối ưu hóa liên tục để bảo vệ chống lại các đợt bùng phát bệnh coronavirus 2019 (COVID-19) trên diện rộng. Nghiên cứu này nhằm khám phá mối quan hệ giữa cường độ của các biện pháp kiểm soát phản ứng đối với các biến thể SARS-CoV-2 khác nhau và mức độ kiểm soát bùng phát ở cấp thành phố. Một nghiên cứu hồi cứu đã được tiến hành tại 49 thành phố có đợt bùng phát COVID-19 trong khoảng thời gian từ tháng 1 năm 2020 đến tháng 6 năm 2022. Dữ liệu dịch tễ học về COVID-19 được trích xuất từ Ủy ban Y tế Quốc gia, Cộng hòa Nhân dân Trung Hoa, và dữ liệu di chuyển dân số được lấy từ dữ liệu di cư Baidu do nền tảng Baidu cung cấp. Kiểm soát bùng phát được định lượng bằng cách tính toán mức độ phát triển lây nhiễm và số tái sinh thay đổi theo thời gian ($${R}_{t}$$). Cường độ phản ứng bùng phát được định lượng bằng cách tính toán phần giảm trong sự di chuyển của dân số trong khoảng thời gian bùng phát. Phân tích tương quan và hồi quy về cường độ của các biện pháp kiểm soát và mức độ kiểm soát bùng phát cho biến thể Omicron và các biến thể không phải Omicron đã được thực hiện. Tổng cộng có 65 đợt bùng phát đã xảy ra ở 49 thành phố tại Trung Quốc từ tháng 1 năm 2020 đến tháng 6 năm 2022. Trong số đó, 66,2% là đợt bùng phát Omicron và 33,8% là đợt bùng phát không phải Omicron. Cường độ của các biện pháp kiểm soát có tương quan tích cực với mức độ kiểm soát bùng phát (r = 0.351, P = 0.03). Mức độ giảm trong di chuyển của dân số có tương quan nghịch với giá trị Rt (r = − 0.612, P < 0.01). Do đó, dưới cùng một cường độ biện pháp kiểm soát, số ca nhiễm Omicron mới hàng ngày là gấp 6.04 lần so với các biến thể không phải Omicron và giá trị Rt của các đợt bùng phát Omicron cao gấp 2.6 lần so với các biến thể không phải Omicron. Ngoài ra, thời gian của các đợt bùng phát không phải biến thể Omicron ngắn hơn so với các đợt bùng phát do biến thể Omicron gây ra (23.0 ± 10.7, 32.9 ± 16.3, t = 2.243, P = 0.031). Các biện pháp kiểm soát cường độ lớn hơn liên quan đến việc kiểm soát bùng phát hiệu quả hơn. Do đó, để đối phó với biến thể Omicron, cần thực hiện các biện pháp quản lý để hạn chế sự di chuyển của dân số nhằm kiểm soát sự lây lan của nó nhanh chóng, đặc biệt trong trường hợp lây truyền trong cộng đồng diễn ra rộng rãi. Nhanh hơn so với những gì cần thiết cho các biến thể không phải Omicron, và các biện pháp kiểm soát quyết đoán cần được áp dụng và điều chỉnh một cách linh hoạt theo tình hình dịch bệnh đang phát triển.
Từ khóa
#SARS-CoV-2 #Omicron #biện pháp kiểm soát #bùng phát #dịch tễ học #lây truyềnTài liệu tham khảo
Wang L, Wang S, Zhang X, Jia Z. Impact of regions with COVID-19 cases on COVID-zero regions by population mobility—worldwide, 2021. China CDC Wkly. 2022;4:79–82.
Sachs JD, Karim SSA, Aknin L, Allen J, Brosbøl K, Colombo F, et al. The Lancet Commission on lessons for the future from the COVID-19 pandemic. Lancet. 2022;400:1224–80.
Wang X, Cai Y, Zhang B, Zhang X, Wang L, Yan X, et al. Cost-effectiveness analysis on COVID-19 surveillance strategy of large-scale sports competition. Infect Dis Poverty. 2022;11:32.
Larkin HD. Global COVID-19 death toll may be triple the reported deaths. JAMA. 2022;327:1438.
Guan D, Wang D, Hallegatte S, Davis SJ, Huo J, Li S, et al. Global supply-chain effects of COVID-19 control measures. Nat Hum Behav. 2020;4:577–87.
Polonsky JA, Bhatia S, Fraser K, Hamlet A, Skarp J, Stopard IJ, et al. Feasibility, acceptability, and effectiveness of non-pharmaceutical interventions against infectious diseases among crisis-affected populations: a scoping review. Infect Dis Poverty. 2022;11:14.
Barouch DH. Covid-19 vaccines—immunity, variants, boosters. N Engl J Med. 2022;387:1011–20.
Guo Q, Ruhan A, Liang L, Zhao X, Deng A, Hu Y, et al. An imported case of BA.2 lineage of Omicron variant COVID-19—Guangdong Province, China, December 28, 2021. China CDC Wkly. 2022;4:98–9.
Hu T, Zhang M, Deng A, Zhang Y, Li B, Li Y, et al. Comparison of Omicron and Delta variant infection COVID-19 cases—Guangdong Province, China, 2022. China CDC Wkly. 2022;4:385–8.
Young M, Crook H, Scott J, Edison P. Covid-19: virology, variants, and vaccines. BMJ Med. 2022;1: e000040.
Planas D, Saunders N, Maes P, Guivel-Benhassine F, Planchais C, Buchrieser J, et al. Considerable escape of SARS-CoV-2 Omicron to antibody neutralization. Nature. 2022;602:671–5.
Bilinski A, Emanuel EJ. COVID-19 and excess all-cause mortality in the US and 18 comparison countries. JAMA. 2020;324:2100–2.
Jørgensen SB, Nygård K, Kacelnik O, Telle K. Secondary attack rates for Omicron and Delta variants of SARS-CoV-2 in Norwegian households. JAMA. 2022;327:1610–1.
Zheng B, Zhu W, Pan J, Wang W. Patterns of human social contact and mask wearing in high-risk groups in China. Infect Dis Poverty. 2022;11:69.
Pan J, Zhu W, Tian J, Liu Z, Xu A, Yao Y, et al. Vaccination as an alternative to non-drug interventions to prevent local resurgence of COVID-19. Infect Dis Poverty. 2022;11:36.
Puhach O, Adea K, Hulo N, Sattonnet P, Genecand C, Iten A, et al. Infectious viral load in unvaccinated and vaccinated individuals infected with ancestral, Delta or Omicron SARS-CoV-2. Nat Med. 2022;28:1491–500.
Bar-On YM, Goldberg Y, Mandel M, Bodenheimer O, Amir O, Freedman L, et al. Protection by a fourth dose of BNT162b2 against Omicron in Israel. N Engl J Med. 2022;386:1712–20.
Arbel R, Wolff Sagy Y, Hoshen M, Battat E, Lavie G, Sergienko R, et al. Nirmatrelvir use and severe Covid-19 outcomes during the Omicron surge. N Engl J Med. 2022;387:790–8.
Davies NG, Kucharski AJ, Eggo RM, Gimma A, Edmunds WJ, Centre for the Mathematical Modelling of Infectious Diseases COVID-19 working group. Effects of non-pharmaceutical interventions on COVID-19 cases, deaths, and demand for hospital services in the UK: a modelling study. Lancet Public Health. 2020;5:e375-85.
Huang Z, Xu S, Liu J, Wu L, Qiu J, Wang N, et al. Effectiveness of inactivated and Ad5-nCoV COVID-19 vaccines against SARS-CoV-2 Omicron BA.2 variant infection, severe illness, and death. BMC Med. 2022;20:400.
He G, Zeng F, Xiao J, Zhao J, Liu T, Hu J, et al. When and how to adjust non-pharmacological interventions concurrent with booster vaccinations against COVID-19—Guangdong, China, 2022. China CDC Wkly. 2022;4:199–206.
Zhou F, Hu TJ, Zhang XY, Lai K, Chen JH, Zhou XH. The association of intensity and duration of non-pharmacological interventions and implementation of vaccination with COVID-19 infection, death, and excess mortality: natural experiment in 22 European countries. J Infect Public Health. 2022;15:499–507.
Zu J, Li ML, Li ZF, Shen MW, Xiao YN, Ji FP. Transmission patterns of COVID-19 in the mainland of China and the efficacy of different control strategies: a data- and model-driven study. Infect Dis Poverty. 2020;9:83.
Chen M, Ai L, Huang D, Chen J, Feng T, Mei S, et al. Soaring asymptomatic infected individuals bring about barriers and difficulties for interruption of COVID-19 prevalence in China. Vector Borne Zoonotic Dis. 2021;21:777–84.
Zhang SX, Yang M, Zheng JX, Zhang BQ, Pan CH, Tian LG. Comprehensive strategies and measures to control COVID-19. Infect Dis Poverty. 2022;11:67.
Chen Z, Deng X, Fang L, Sun K, Wu Y, Che T, et al. Epidemiological characteristics and transmission dynamics of the outbreak caused by the SARS-CoV-2 Omicron variant in Shanghai, China: a descriptive study. Lancet Reg Health West Pac. 2022;29: 100592.
Ye L, Li WF, Shao J, Xu Z, Ju J, Xu H. Fighting Omicron epidemic in China: real-world big data from Fangcang shelter hospital during the outbreak in Shanghai 2022. J Infect. 2022;85:436–80.
Fan Y, Li X, Zhang L, Wan S, Zhang L, Zhou F. SARS-CoV-2 Omicron variant: recent progress and future perspectives. Signal Transduct Target Ther. 2022;7:141.
Sherratt K, Abbott S, Meakin SR, Hellewell J, Munday JD, Bosse N, et al. Exploring surveillance data biases when estimating the reproduction number: with insights into subpopulation transmission of COVID-19 in England. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2021;376:20200283.
Jin S, Dickens BL, Lim JT, Cook AR. EpiRegress: a method to estimate and predict the time-varying effective reproduction number. Viruses. 2022;14:1576.
Ganyani T, Kremer C, Chen D, Torneri A, Faes C, Wallinga J, et al. Estimating the generation interval for coronavirus disease (COVID-19) based on symptom onset data, March 2020. Euro Surveill. 2020;25:2000257.
Lauer SA, Grantz KH, Bi Q, Jones FK, Zheng Q, Meredith HR, et al. The incubation period of coronavirus disease 2019 (COVID-19) from publicly reported confirmed cases: estimation and application. Ann Intern Med. 2020;172:577–82.
Mefsin YM, Chen D, Bond HS, Lin Y, Cheung JK, Wong JY, et al. Epidemiology of infections with SARS-CoV-2 Omicron BA.2 variant, Hong Kong, January–March 2022. Emerg Infect Dis. 2022;28:1856–8.
Wu Y, Kang L, Guo Z, Liu J, Liu M, Liang W. Incubation period of COVID-19 caused by unique SARS-CoV-2 strains: a systematic review and meta-analysis. JAMA Netw Open. 2022;5: e2228008.
Yuan P, Tan Y, Yang L, Aruffo E, Ogden NH, Yang G, et al. Assessing the mechanism of citywide test-trace-isolate Zero-COVID policy and exit strategy of COVID-19 pandemic. Infect Dis Poverty. 2022;11:104.
Li X, Zhang Z, Lyu K, Xu D. Strengthening community defenses to prevent and control the spread of COVID-19 in China. China CDC Wkly. 2022;4:191–4.
Erikstrup C, Laksafoss AD, Gladov J, Kaspersen KA, Mikkelsen S, Hindhede L, et al. Seroprevalence and infection fatality rate of the SARS-CoV-2 Omicron variant in Denmark: a nationwide serosurveillance study. Lancet Reg Health Eur. 2022;21: 100479.
Wolter N, Jassat W, Walaza S, Welch R, Moultrie H, Groome M, et al. Early assessment of the clinical severity of the SARS-CoV-2 omicron variant in South Africa: a data linkage study. Lancet. 2022;399:437–46.
COVID-19 Excess Mortality Collaborators. Estimating excess mortality due to the COVID-19 pandemic: a systematic analysis of COVID-19-related mortality, 2020–21. Lancet. 2022;399:1513–36.
Ballering AV, van Zon SKR, Olde Hartman TC, Rosmalen JGM, Lifelines Corona Research Initiative. Persistence of somatic symptoms after COVID-19 in the Netherlands: an observational cohort study. Lancet. 2022;400:452–61.
Jain R, Dupas P. The effects of India’s COVID-19 lockdown on critical non-COVID health care and outcomes: evidence from dialysis patients. Soc Sci Med. 2022;296: 114762.
Zou H, Shu Y, Feng T. How Shenzhen, China avoided widespread community transmission: a potential model for successful prevention and control of COVID-19. Infect Dis Poverty. 2020;9:89.
Kong L, Duan M, Shi J, Hong J, Zhou X, Yang X, et al. Optimization of COVID-19 prevention and control measures during the Beijing 2022 Winter Olympics: a model-based study. Infect Dis Poverty. 2022;11:95.
Kucharski AJ, Klepac P, Conlan AJK, Kissler SM, Tang ML, Fry H, et al. Effectiveness of isolation, testing, contact tracing, and physical distancing on reducing transmission of SARS-CoV-2 in different settings: a mathematical modelling study. Lancet Infect Dis. 2020;20:1151–60.
Lefrançois T, Malvy D, Atlani-Duault L, Benamouzig D, Druais PL, Yazdanpanah Y, et al. After 2 years of the COVID-19 pandemic, translating One Health into action is urgent. Lancet. 2022. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(22)01840-2.
Han E, Tan MMJ, Turk E, Sridhar D, Leung GM, Shibuya K, et al. Lessons learnt from easing COVID-19 restrictions: an analysis of countries and regions in Asia Pacific and Europe. Lancet. 2020;396:1525–34.
Gandjour A. Cost-effectiveness of future lockdown policies against the COVID-19 pandemic. Health Serv Manage Res. 2022. https://doi.org/10.1177/09514848221080687.
Reddy KP, Shebl FM, Foote JHA, Harling G, Scott JA, Panella C, Fitzmaurice KP, et al. Cost-effectiveness of public health strategies for COVID-19 epidemic control in South Africa: a microsimulation modelling study. Lancet Glob Health. 2021;9:e120–29.
Nuñez MA, Pauchard A, Ricciardi A. Invasion science and the global spread of SARS-CoV-2. Trends Ecol Evol. 2020;35:642–5.
Fei SW, Gu SY, Chen FM, Zhou N, Cheng ZL, Xie Y, et al. Towards a global One Health index: a potential assessment tool for One Health performance. Infect Dis Poverty. 2022;11:57.
Li Q, Bergquist R, Grant L, Song JX, Feng XY, Zhou XN. Consideration of COVID-19 beyond the human-centred approach of prevention and control: the ONE-HEALTH perspective. Emerg Microb Infect. 2022;11:2520–8.
Zhang XX, Liu JS, Han LF, Simm G, Guo XK, Zhou XN. One Health: new evaluation framework launched. Nature. 2022;604(7907):625.