The evolution of RNAi as a defence against viruses and transposable elements

10.1126/science.1069132

10.1016/S0966-842X(00)01830-8

10.1038/35030124

10.1073/pnas.95.22.13079

10.1128/MCB.24.15.6742-6750.2004

10.1126/science.1146484

10.1016/S0092-8674(04)00045-5

10.1016/j.molcel.2008.06.002

10.1038/nature02874

10.1038/nbt1359

10.1016/j.cub.2007.08.039

10.1371/journal.pbio.0050310

10.1094/MPMI-19-0614

10.1128/JVI.01933-06

10.1073/pnas.0508192102

10.1038/nature05241

10.1093/emboj/17.22.6739

10.1073/pnas.0706701104

10.1146/annurev.cellbio.23.090506.123406

10.3201/eid1309.061162

10.1128/JVI.02136-07

10.1016/j.devcel.2007.03.001

10.1016/j.gde.2006.02.012

10.1007/s00294-006-0078-x

10.1038/nrg2179

10.1101/gad.1201204

10.1146/annurev.ge.23.120189.001343

10.1038/371215a0

10.4161/fly.5606

10.1016/j.cub.2008.05.006

10.1038/385781a0

10.1099/vir.0.83471-0

10.1038/ni1352

10.1038/nature07007

10.1016/j.molcel.2008.06.003

10.1098/rspb.1979.0081

10.1126/science.1128214

10.1038/nature04336

10.1101/gad.1316805

10.1016/j.cell.2007.07.039

10.1242/dev.02070

10.1038/ng2081

Dunoyer P. & Voinnet O. 2008 Mixing and matching: the essence of plant systemic silencing? Trends Genet. 24 151–154. (doi:10.1016/j.tig.2008.01.005).

10.1126/science.1087117

10.1016/j.cell.2007.05.056

10.1038/ni1335

10.1126/science.1157396

10.1038/nbt1107-1231

10.1038/nature05992

10.1038/nature05914

10.1007/s00430-007-0070-1

10.1093/nar/gkm952

10.1261/rna.581907

10.1093/emboj/21.3.398

10.1038/nbt1369

10.2307/3544435

10.1128/EC.00356-07

10.1101/gad.1567007

10.1101/gr.6249707

10.1093/emboj/cdg431

10.1186/gb-2008-9-2-210

10.1016/j.cub.2007.06.030

Hughes A.L, 1991, Circumsporozoite protein genes of malaria parasites (Plasmodium spp.)—evidence for positive selection on immunogenic regions, Genetics, 127, 345, 10.1093/genetics/127.2.345

10.1016/S0960-9822(99)80334-0

10.1038/nrm2321

10.1128/JVI.02339-06

10.1261/rna.901908

10.1128/JVI.74.2.710-720.2000

10.1016/j.cub.2007.01.050

10.1126/science.1113329

10.1146/annurev.genet.41.110306.130216

10.1016/S0092-8674(00)81614-1

10.1016/S1534-5807(03)00025-X

10.1038/nri888

10.1016/j.febslet.2005.08.069

10.1038/nature06938

10.1073/pnas.0406983101

10.1016/S0092-8674(00)81645-1

10.1073/pnas.91.4.1285

10.1242/dev.006486

10.1126/science.1108784

10.1099/0022-1317-78-9-2379

10.1146/annurev.micro.60.080805.142205

Li W.H, 1985, New method for estimating synonymous and nonsynonymous rates of nucleotide substitution considering the relative likelihood of nucleotide and codon changes, Mol. Biol. Evol, 2, 150

10.1093/emboj/18.10.2683

10.1126/science.1070948

10.1073/pnas.0701920104

10.1105/tpc.5.12.1749

10.1038/nri2252

10.1038/ng.73

10.1073/pnas.0404940101

10.1038/nature03870

10.1046/j.1365-313X.2003.01785.x

10.1038/nbt1352

10.1016/j.tig.2007.04.004

10.1016/j.cub.2007.07.014

10.1016/j.pbi.2007.06.007

10.1038/351652a0

McTaggart S.J, The components of the Daphnia pulex immune system as revealed by complete genome sequencing, BMC Genomics

10.1016/S0092-8674(00)80412-2

10.1038/nature02873

10.1534/genetics.106.068106

10.1261/rna.541307

10.1073/pnas.0604627103

10.1128/JVI.79.12.7812-7818.2005

10.1186/1471-2148-8-92

10.1016/j.cub.2008.05.035

10.1016/j.cub.2006.01.065

10.1101/gad.1210204

10.1038/nature07015

10.1016/j.immuni.2007.05.014

10.1126/science.1132839

10.1016/j.devcel.2007.03.022

10.1038/nature06205

10.1128/JVI.01980-06

10.1126/science.1096781

10.1038/nmeth746

10.1016/j.tcb.2006.12.007

10.1126/science.276.5318.1558

10.1098/rstb.2006.1845

10.1016/j.cell.2006.10.040

10.1101/gr.6597907

10.1038/nrmicro1473

Schlenke T.A, 2003, Natural selection drives Drosophila immune system evolution, Genetics, 164, 1471, 10.1093/genetics/164.4.1471

10.1073/pnas.0507123102

10.1104/pp.105.063537

10.1073/pnas.0702500104

10.1016/S0092-8674(02)00639-6

10.1038/nature02107

10.1126/science.1136699

10.1186/1471-2148-7-33

10.1128/JVI.01804-07

10.1038/nrg2072

10.1038/4151022a

10.1126/science.1140956

10.1038/nature03576

10.1016/S0092-8674(00)81644-X

10.1073/pnas.0605298103

10.1038/nchembio848

10.1016/j.cell.2007.05.057

10.1186/gb-2008-9-1-r10

10.1128/JVI.79.4.2517-2527.2005

10.1126/science.1129333

10.1101/gad.1399806

10.1128/JVI.00985-06

10.1099/vir.0.82402-0

10.1128/JVI.01664-07

10.1101/gad.1482006

10.1128/JVI.78.17.9487-9498.2004

10.1016/j.tig.2004.04.011

10.1126/science.1125694

10.1016/j.tplants.2006.01.003

10.1038/nature06908

10.1038/nature05260

10.1261/rna.542107

10.1093/nar/gki220

10.1038/nature03957

10.1016/j.pbi.2007.07.004

10.1073/pnas.0611282104

10.1038/ng1202-569

10.1016/j.cell.2006.09.033

10.1111/j.1462-5822.2006.00688.x

10.1016/j.cell.2007.02.016

10.1073/pnas.1630797100

10.1111/j.1365-313X.2006.02697.x

10.1101/gad.1495506