Tác động của cấu trúc Polyproline II (PPII) lên entropi của trạng thái biến tính

Cấu trúc Polyproline II (PPII) được báo cáo là cấu trúc chiếm ưu thế trong trạng thái chưa gập của các peptide, ngay cả khi không có proline trong chuỗi. Trong nghiên cứu này, chúng tôi sử dụng nhiệt lượng kế titration isothermal (ITC) để điều tra định hướng PPII trong trạng thái chưa gập bằng cách nghiên cứu sự liên kết của miền SH3 của SEM‐5 với các biến thể của ligand peptide PPII tiềm năng của nó, Sos. Hệ thống thí nghiệm độc đáo ở chỗ nó cho phép tiếp cận trực tiếp với sự thay đổi entropi cấu hình của các axit amin thay thế. Kết quả cho thấy tập hợp biến tính có thể được phân loại bởi ít nhất hai trạng thái nhiệt động lực học khác nhau, cấu trúc PPII và một trạng thái chưa gập phù hợp với ý tưởng trước đây về trạng thái biến tính như một tập hợp ngẫu nhiên của các cấu trúc được xác định chủ yếu bởi sự va chạm của các hình cầu cứng. Xác suất của cấu trúc PPII trong các trạng thái biến tính cho Ala và Gly được phát hiện là đáng kể, ~30% và ~10% tương ứng, dẫn đến sự giảm mạnh trong entropi cấu hình của việc gập.