Tác động của cấu trúc Polyproline II (PPII) lên entropi của trạng thái biến tính

Protein Science - Tập 12 Số 3 - Trang 447-457 - 2003
Josephine C. Ferreon1, Vincent J. Hilser2
1Department of Human Biological Chemistry and Genetics, University of Texas Medical Branch at Galveston, Galveston, Texas 77555, USA.
2Sealy Center for Structural Biology, University of Texas Medical Branch at Galveston, 301 University, Galveston, TX 77555, USA; fax: (409) 747‐6816.

Tóm tắt

Tóm tắtCấu trúc Polyproline II (PPII) được báo cáo là cấu trúc chiếm ưu thế trong trạng thái chưa gập của các peptide, ngay cả khi không có proline trong chuỗi. Trong nghiên cứu này, chúng tôi sử dụng nhiệt lượng kế titration isothermal (ITC) để điều tra định hướng PPII trong trạng thái chưa gập bằng cách nghiên cứu sự liên kết của miền SH3 của SEM‐5 với các biến thể của ligand peptide PPII tiềm năng của nó, Sos. Hệ thống thí nghiệm độc đáo ở chỗ nó cho phép tiếp cận trực tiếp với sự thay đổi entropi cấu hình của các axit amin thay thế. Kết quả cho thấy tập hợp biến tính có thể được phân loại bởi ít nhất hai trạng thái nhiệt động lực học khác nhau, cấu trúc PPII và một trạng thái chưa gập phù hợp với ý tưởng trước đây về trạng thái biến tính như một tập hợp ngẫu nhiên của các cấu trúc được xác định chủ yếu bởi sự va chạm của các hình cầu cứng. Xác suất của cấu trúc PPII trong các trạng thái biến tính cho Ala và Gly được phát hiện là đáng kể, ~30% và ~10% tương ứng, dẫn đến sự giảm mạnh trong entropi cấu hình của việc gập.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1006/jmbi.1994.1016

10.1002/(SICI)1097-0134(19981101)33:2<218::AID-PROT6>3.0.CO;2-E

10.1002/(SICI)1097-0134(199606)25:2<143::AID-PROT1>3.0.CO;2-J

10.1016/0301-4622(88)80019-X

10.1002/bip.360311409

10.1021/bi00859a010

10.1016/0003-2697(89)90602-7

10.1006/jmbi.1995.0501

10.1038/13273

10.1146/annurev.physchem.47.1.135

10.1021/bi011043a

10.1002/ijch.197400018

10.1002/prot.340200108

10.1038/372375a0

10.1016/0022-2836(91)90721-H

10.1110/ps.0217402

10.1002/pro.5560060809

10.1016/S0065-3233(08)60402-7

10.1006/jmbi.1998.1770

10.1110/ps.4550102

10.1073/pnas.112193999

10.1002/(SICI)1097-0134(19990901)36:4<400::AID-PROT3>3.0.CO;2-B

10.1002/bip.1968.360060911

10.1002/bip.1972.360111109

10.1021/bi961314v

10.1016/0003-2697(89)90213-3

10.1021/bi00250a004

10.1006/jmbi.1996.0886

Woody R.W., 1992, Circular dichroism and conformation of unordered polypeptides, Adv. Biophys. Chem., 2, 37

Thông tin
Thông tin xuất bản

Protein Science

Tập 12 Số 3

447-457

Thông tin tác giả