Địa lý vi sinh vật của đất Anh

Wiley - Tập 13 Số 6 - Trang 1642-1654 - 2011
Robert I. Griffiths1, Bruce Thomson1, Philip James1,2, Thomas Bell3, Mark Bailey1, Andrew S. Whiteley1
1Centre for Ecology & Hydrology, Maclean Building, Benson Lane, Crowmarsh Gifford, Wallingford, Oxfordshire, OX10 8BB, UK
2School of Biology, Ridley Building, University of Newcastle Upon Tyne, Newcastle Upon Tyne NE1 7RU, UK
3Department of Zoology, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3PS, UK

Tóm tắt

Tóm tắtMặc dù đã nhận thức được tầm quan trọng của vi khuẩn đất đối với chức năng của hệ sinh thái trên cạn, nhưng vẫn còn ít sự đồng thuận về các yếu tố điều chỉnh đa dạng sinh học dưới lòng đất. Ở đây, chúng tôi trình bày một đánh giá không gian đa quy mô về hồ sơ cộng đồng vi khuẩn đất trên toàn Vương quốc Anh (> 1000 lõi đất) và cho thấy bản đồ phân bố vi khuẩn trên quy mô cảnh quan đầu tiên ở cấp quốc gia. Độ đa dạng vi khuẩn và sự khác biệt cộng đồng, được đánh giá bằng phương pháp polime hóa chiều dài đoạn phân mảnh hạn chế, được liên kết chặt chẽ nhất với độ pH của đất, cung cấp một xác nhận quy mô lớn về vai trò của pH trong việc cấu trúc các ngành vi khuẩn. Tuy nhiên, trong khi đa dạng α có mối liên quan tích cực với pH, thì điều ngược lại với đa dạng β (biến thiên giữa các mẫu trong đa dạng α). Đa dạng β được tìm thấy là lớn nhất trong các loại đất axit, tương ứng với sự không đồng nhất môi trường lớn hơn. Phân tích các thư viện bản sao cho thấy các ảnh hưởng của pH chủ yếu thể hiện ở cấp độ các nhóm phân loại vi khuẩn rộng, với các loại đất axit được chi phối bởi một vài ngành (đặc biệt là nhóm 1 Acidobacteria và Alphaproteobacteria). Chúng tôi cũng ghi nhận sự tương quan đáng kể giữa các cộng đồng vi khuẩn và hầu hết các biến số môi trường khác được đo (hóa học đất, đặc điểm trên mặt đất và các biến khí hậu), cùng với sự tương quan không gian đáng kể ở khoảng cách gần. Cụ thể, các cộng đồng vi khuẩn và thực vật có mối liên hệ chặt chẽ với nhau, cho thấy không có bằng chứng mạnh mẽ rằng vi khuẩn đất bị thúc đẩy bởi các quy trình sinh thái khác với những quy định cho các sinh vật cao hơn. Chúng tôi kết luận rằng các khảo sát quy mô rộng hữu ích trong việc xác định các sinh quyển đất rõ rệt bao gồm các cộng đồng lặp lại của các ngành chiếm ưu thế. Tất cả những kết quả này cung cấp một khuôn khổ sinh thái cơ sở để theo đuổi nghiên cứu trong tương lai về chức năng vi sinh vật đất, cũng như các đánh giá dựa trên sinh quyển rõ ràng hơn về các yếu tố điều khiển sinh thái địa phương của đa dạng sinh học vi khuẩn.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1111/j.1574-6976.2000.tb00557.x

10.1016/j.soilbio.2009.08.010

10.1038/ismej.2008.58

10.1128/AEM.65.4.1731-1737.1999

10.1128/AEM.02383-06

10.1128/AEM.00514-07

Brussaard L., 1997, Biodiversity and Ecosystem Functioning in Soil, Ambio, 26, 563

10.1128/AEM.66.12.5448-5456.2000

10.1111/j.1462-2920.2010.02277.x

10.1890/0012-9658(2002)083[1105:MRTANT]2.0.CO;2

10.1111/j.1758-2229.2009.00040.x

10.1128/AEM.03006-05

10.1128/AEM.65.4.1662-1669.1999

Emmett B.A. Frogbrook Z.L. Chamberlain P.M. Griffiths R.I. Pickup R. Poskitt J. et al. (2008)Countryside Survey Technical Report No. 3/07: Soils Manual. Swindon UK:NERC/Centre for Ecology & Hydrology 180pp.

10.1073/pnas.0507535103

10.1890/05-1839

10.1016/S0301-4797(02)00174-3

10.1038/ismej.2008.55

10.1126/science.1112665

10.1038/35012228

10.1016/j.tree.2006.06.012

10.1128/AEM.66.12.5488-5491.2000

10.1111/j.1574-6941.2003.tb01043.x

10.1016/j.apsoil.2006.03.007

10.1016/S0301-4797(02)00179-2

10.1073/pnas.0808254105

10.1073/pnas.0808254105

10.1098/rspb.2003.2549

10.1111/j.1574-6968.1989.tb03486.x

10.1002/hyp.5930

10.1038/ismej.2009.47

10.1038/ismej.2008.127

10.1016/j.soilbio.2005.08.006

10.1007/BF02106205

10.2307/3545743

10.1016/j.soilbio.2008.05.021

10.1128/AEM.00335-09

Legendre P., 1998, Numerical Ecology

10.1890/07-0272.1

10.1128/AEM.01996-06

10.1038/nrmicro1341

Oksanen J. Blanchet F.G. Kindt R. Legendre P. O'Hara R.G. Simpson G.L. et al. (2009)Vegan: community ecology package. R package version 1.16‐33[WWW document]. URLhttp://R‐Forge.R‐project.org/projects/vegan/.

10.1016/j.cageo.2004.03.012

10.1016/j.soilbio.2008.03.020

10.1038/nrmicro1643

R Core Development Team(2005)R: a language and environment for statistical computing.R Foundation for Statistical Computing.Vienna Austria. ISBN 3‐900051‐07‐0 [WWW document]. URLhttp://www.R‐project.org.

10.1073/pnas.0610671104

10.1038/ismej.2007.53

10.1128/AEM.02775-08

10.1038/ismej.2010.58

10.1046/j.1462-2920.2002.00352.x

10.1128/AEM.72.3.1852-1857.2006

10.1128/AEM.01541-09

10.1016/S0301-4797(02)00177-9

10.1128/AEM.67.5.2284-2291.2001

10.1111/j.1600-0587.2009.06105.x

10.1007/s00248-009-9575-z

10.1111/j.1462-2920.2008.01678.x

10.1128/AEM.00062-07

10.2307/1943563

Thông tin
Thông tin xuất bản

Wiley

Tập 13 Số 6

1642-1654

Thông tin tác giả