Tổng hợp và Hoạt động Chống Mycobacterium của Một Số Dẫn Xuất Heterocyclic Mới Giàu Nitrogen và Nghiên Cứu Đ docking và DFT Của Chúng

Russian Journal of Bioorganic Chemistry - Tập 50 - Trang 147-161 - 2024
Raghavendra Hegde1, Itte Pushpavathi1, Talavara Venkatesh2, O. Nagaraja1, S. Ravi Kumar3
1Department of P.G. Studies and Research in Industrial Chemistry, Jnana Sahyadri, Kuvempu University, Shankaraghatta, Shivamogga, Karnataka, India
2Department of P.G. Studies and Research in Chemistry, Jnana Sahyadri, Kuvempu University, Shankaraghatta, Shivamogga, Karnataka, India
3Department of P.G. Studies and Research in Biotechnology, Jnana Sahyadri, Kuvempu University, Shankaraghatta, Shivamogga, Karnataka, India

Tóm tắt

Mục tiêu: Tổng hợp các dẫn xuất heterocyclic giàu nitrogen; hoạt động chống lao, phân tích docking phân tử, ADME-T và các nghiên cứu tính toán. Phương pháp: Tổng hợp được thực hiện bằng phương pháp truyền thống; cấu trúc của các hợp chất được tổng hợp được xác nhận bằng nhiều phương pháp quang phổ khác nhau; đánh giá hoạt động chống lao được thực hiện bằng phương pháp Microplate Alamar Blue assay (MABA); Phân tích docking phân tử được thực hiện bằng công cụ ChemBioDraw (một phần của bộ phần mềm ChemBioOffice Ultra 14.0) và ADME được thực hiện bằng chương trình web Swiss ADME; các nghiên cứu DFT được thực hiện bằng phương pháp DFT (B3LYP) với sự hỗ trợ của bộ cơ sở 6-311++G(d,p) trong phần mềm Gaussian 09. Kết quả: Các kết quả hoạt động cho thấy rằng các hợp chất (IIIc) và (IIIe) thể hiện hoạt động xuất sắc với giá trị MIC là 1.6 μg/mL, gần với các tiêu chuẩn tham chiếu của rifampicin và streptomycin, trong khi các hợp chất còn lại có hiệu quả giảm. Thảo luận: Những kết quả này cho thấy hoạt động bị ảnh hưởng bởi lõi pyrimidine và cụm indole của (IIIc) và (IIIe) cho thấy hiệu quả rất hiệu quả so với các tiêu chuẩn tham chiếu tương ứng. Kết luận: Dựa trên các phát hiện về hoạt động chống lao, phân tích docking phân tử in-silico và hồ sơ ADME, các loại thuốc mà chúng tôi tổng hợp đáp ứng tất cả năm tiêu chí, bao gồm hấp thụ GI cao, không có rào cản máu-não và khả năng thẩm thấu da tối thiểu. Các hợp chất (IIIa) và (IIIb) cho thấy khoảng cách năng lượng nhỏ hơn trong phân tích DFT, cho thấy rằng chúng đã phản ứng hóa học hơn so với các hợp chất khác. Do đó, các hợp chất này đã thể hiện hoạt động chống lao tăng cao.

Từ khóa

#Tổng hợp #Dẫn xuất heterocyclic #Hoạt động chống lao #Phân tích docking phân tử #Nghiên cứu DFT

Tài liệu tham khảo

Kerru, N., Bhaskaruni, S.V., Gummidi, L., Maddila, S.N., Maddila, S., and Jonnalagadda, S.B., Synth. Commun., 2019, vol. 49, pp. 2437–2459. https://doi.org/10.1039/d0ob00350f Arora, P., Arora, V., Lamb, H., and Wadhwa, D., Int. J. Pharma Sci. Res., 2012, vol. 3, pp. 2947–2954. https://doi.org/10.13040/IJPSR.0975-8232.3(9).2947-54 Karan, R., Bhatia, R., and Rawal, R.K., Solid State Synth. Method., 2021, pp. 159–188. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-819720-2.00010-2 Thorat, B.R., Mali, S.N., Wavhal, S.S., Bhagat, D.S., Borade, R.M., Chapolikar, A., and Shinde, P., Comb. Chem. High Throughput. Screen., 2023, vol. 26, pp. 1108–1140. https://doi.org/10.2174/1386207325666220720105845 Venkatesh, T., Upendranath, K., and Nayaka, Y.A., J. Solid State Electrochem., 2021, vol. 25, pp. 1237–1244. https://doi.org/10.1007/s10008-020-04892-9 Appaturi, J.N., Ratti, R., Phoon, B.L., Batagarawa, S.M., Din, I.U., Selvaraj, M., and Ramalingam, R.J., Dalton Trans., 2021, vol. 50, pp. 4445–4469. https://doi.org/10.1039/D1DT00456E Kumar, P. and Dwivedi, N., Acc. Chem. Res., 2013, vol. 46, pp. 289–299. https://doi.org/10.1021/ar300135u Kumari, A., and Singh, R.K., Bioorg. Chem., 2019, vol. 89, Article ID: 103021. https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2019.103021 Li, X., Li, He., Huoji, C., Wanqing, W., and Huanfeng, J., J. Org. Chem., 2013, vol. 78, pp. 3636–3646. https://doi.org/10.1021/jo400162d Santos, C.M., Freitas, M., and Fernandes, E., Eur. J. Med. Chem., 2018, vol. 157, pp. 1460–1479. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2018.07.073 Kalaria, P.N., Karad, S.C., and Raval, D.K., Eur. J. Med. Chem., 2018, vol. 158, pp. 917–936. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2018.08.040 Blakemore, D.C., Castro, L., Churcher, I., Rees, D.C., Thomas, A.W., Wilson, D.M., and Wood, A., Nat. Chem., 2018, vol. 10, pp. 383–394. https://doi.org/10.1038/s41557-018-0021-z Kerru, N., Singh, P., Koorbanally, N., Raj, R., and Kumar, V., Eur. J. Med. Chem., 2017, vol. 142, pp. 179–212. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2017.07.033 Eftekhari-Sis, B., Zirak, M., and Akbari, A., Chem. Rev., 2013, vol. 113, pp. 2958–3043. https://doi.org/10.1021/cr300176g Kerru, N., Maddila, S., and Jonnalagadda, S.B., Curr. Org. Chem., 2019, vol. 23, pp. 3154–3190. https://doi.org/10.2174/1385272823666191202105820 Ju, Y. and Varma, R.S., J. Org. Chem., 2006, vol. 71, pp. 135–141. https://doi.org/10.1021/jo051878h Zárate-Zárate, D., Aguilar, R., Hernández-Benitez, R.I., Labarrios, E.M., Delgado, F., and Tamariz, J., Tetrahedron, 2015, vol. 71, pp. 6961–6978. https://doi.org/10.1016/j.tet.2015.07.010 Leeson, P.D. and Springthorpe, B., Nat. Rev. Drug Discov., 2007, vol. 6, pp. 881–890. https://doi.org/10.1038/nrd2445 Husseiny, E.M., Abulkhair, H.S., El-Dydamony, N.M., and Anwer, K.E., Bioorg. Chem., 2023, vol. 133, Article ID: 106397. https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2023.106397 Zhang, B. and Studer, A., Chem. Soc. Rev., 2015, vol. 44, pp. 3505–3521. https://doi.org/10.1039/C5CS00083A Malysheva, S., Kuimov, V., Belovezhets, L., Belogorlova, N., Borovskaya, M., and Borovskii, G., Bioorg. Chem., 2023, vol. 132, Article ID: 106363. Chaudhari, K., Surana, S., Jain, P., and Patel, H.M., Eur. J. Med. Chem., 2016, vol. 124, pp. 160–185. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2016.08.034 Al-Rooqi, M.M., Mughal, E.U., Raja, Q.A., Obaid, R.J., Sadiq, A., Naeem, N., and Ahmed, S.A., J. Mol. Struct., 2022, vol. 1268, Article ID: 133719. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2022.133719 Akhtar, J., Khan, A.A., Ali, Z., Haider, R., and Yar, M.S., Eur. J. Med. Chem., 2017, vol. 125, pp. 143–189. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2016.09.023 Ma, X., Lv, X., and Zhang, J., Eur. J. Med. Chem., 2018, vol. 143, pp. 449–463. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2017.11.049 Kaur, R., Dahiya, L., and Kumar, M., Eur. J. Med. Chem., 2017, vol. 141, pp. 473–505. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2017.09.029 Patel, R.V., Keum, Y.S., and Park, S.W., Eur. J. Med. Chem., 2015, vol. 97, pp. 649–663. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2014.07.005 Reddy, G.M., Camilo Jr, A., and Garcia, J.R., Bioorg. Chem., 2021, vol. 106, Article ID: 104465. https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2020.104465 Nibin Joy, M., Bodke, Y.D., Telkar, S., and Bakulev, V.A., J. Mex. Chem., 2020, vol. 64, pp. 53–73. https://doi.org/10.29356/jmcs.v64i1.1116 Reddy, G.M., and Camilo, Jr, A., Sustain Chem. Pharm., 2020. vol. 17, Article ID: 100303. https://doi.org/10.1016/j.scp.2020.100303 Martins, P., Jesus, J., Santos, S., Raposo, L.R., Roma-Rodrigues, C., Baptista, P.V., and Fernandes, A.R., Molecules, 2015, vol. 20, pp. 16852–16891. https://doi.org/10.3390/molecules200916852 Rishikesan, R., Karuvalam, R.P., Muthipeedika, N.J., Sajith, A.M., Eeda, K.R., Pakkath, R., and Muralidharan, A., J. Chem. Sci., 2021, vol. 133, pp. 1–12. https://doi.org/10.1007/s12039-020-01872-4 Bird, C.W. and Katritzky, A.R., Eds., Pergamon Press, Oxford, 1984, vol. 8. Young, A.M., Audus, K.L., Proudfoot, J., and Yazdanian, M., J. Pharm. Sci., 2006, vol. 95, pp. 717–725. https://doi.org/10.1002/jps.20526 Wei, C.X., Bian, M., and Gong, G.H., Molecules, 2015, vol. 20, pp. 5528–5553. https://doi.org/10.3390/molecules20045528 Thanikachalam, P.V., Maurya, R.K., Garg, V., and Monga, V., Eur. J. Med. Chem., 2019, vol. 180, pp. 562– 612. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2019.07.019 Jhun, B.W., Koh, W.J., An, T.J., Kim, J.W., Choi, E.Y., Jang, S.H., Park, and Y.B., Tuberc. Respir Dis., 2020, vol. 83, pp. 42–50. https://doi.org/10.4046/trd.2019.0065 Khera, M.K., Cliffe, I.A., Mathur, T., and Prakash, O., Bioorg. Med. Chem., 2011, vol. 21, pp. 2887–2889. https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2011.03.075 Salo-Ahen, O.M., Alanko, I., Bhadane, R., Bonvin, A.M., Honorato, R.V., Hossain, S., and Vanmeert, M., Processes, 2020, vol. 9, p. 71. https://doi.org/10.3390/pr9010071 Kufareva, I. and Abagyan, R., Homol. Modell.: Method. Protocol., 2012, pp. 231–257. https://doi.org/10.1007/978-1-61779-588-6_10 Cabrera-Pérez, M.Á., Nam, N.H., Castillo-Garit, J.A., Rasulev, B., Le-Thi-Thu, H., and Casañola-Martin, G.M., Curr. Top Med. Chem., 2018, vol. 18, pp. 2209–2229. https://doi.org/10.2174/1568026619666181130140350 Honorio, K.M., Moda, T.L., Andricopulo, A.D., Med. Chem., 2013, vol. 9, pp. 163–176. https://doi.org/10.2174/1573406411309020002 Wang, Y., Xing, J., Xu, Y., Zhou, N., Peng, J., Xiong, Z., and Jiang, H., Q. Rev. Biophys., 2015, vol. 48, pp. 488–515. https://doi.org/10.1017/S0033583515000190 Gombar, V.K., Silver, I.S., and Zhao, Z., Curr. Top. Med. Chem., 2003, vol. 3, pp. 1205–1225. https://doi.org/10.2174/1568026033452014 Nagaraja, O., Bodke, Y.D., Pushpavathi, I., and Kumar, S.R., Heliyon, 2020, vol. 6, Article ID: e04245. https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2020.e04245 Sukanya, S.H., Venkatesh, T., Rao, S.A., and Pandith, A., J. Mol. Struct., 2022, vol. 1267, Article ID: 133587. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2022.133587 Manjunatha, B., Bodke, Y.D., Nagaraja, O., and Navaneethgowda, P.V., New J. Chem., 2022, vol. 46, pp. 5393–5404. https://doi.org/10.1039/D1NJ04751E Ahmad, G., Rasool, N., Mubarik, A., Zahoor, A.F., Hashmi, M.A., Zubair, M., and Haider, S., Molecules, 2021, vol. 26, Article ID: 7309. https://doi.org/10.3390/molecules26237309 Naeem, N., Shehzad, R.A., Ans, M., Akhter, M.S., and Iqbal, J., Energy Technol., 2022, vol. 10, Article ID: 2100838. https://doi.org/10.1002/ente.202100838 Miar, M., Shiroudi, A., Pourshamsian, K., Oliaey, A.R., and Hatamjafari, F., J. Chem. Res., 2021, vol. 45, pp. 147–158. https://doi.org/10.1177/1747519820932091 Albayati, M.R., Kansız, S., Dege, N., Kaya, S., Marzouki, R., Lgaz, H., and Chung, I.M., J. Mol. Struct., 2020, vol. 1205, Article ID: 127654. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2019.127654 Venkatesh, T., Upendranath, K., and Manjanna, J., Chem. Data Collect., 2022, vol. 40, Article ID: 100886. https://doi.org/10.1016/j.cdc.2022.100886 Nagaraja, O., Bodke, Y.D., Thippeswamy, B., Venkatesh, T., and Manjunatha, B., J. Mol. Struct., 2022, vol. 1269, Article ID: 133759. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2022.133759 Khedr, M.A., Pillay, M., Chandrashekharappa, S., Chopra, D., Aldhubiab, B.E., Attimarad, M., and Venugopala, K.N., J. Biomol. Struct., 2018, vol. 36, pp. 2163–2178. https://doi.org/10.1080/07391102.2017.1345325 Sukanya, S.H., Venkatesh, T., Kumar, R., and Bodke, Y.D., Chem. Data Collect., 2021, vol. 33, Article ID: 100713. https://doi.org/10.1016/j.cdc.2021.100713 Nagaraja, O., Bodke, Y.D., Kenchappa, R., and Kumar, S.R., Chem. Data Collect., 2020, vol. 27, Article ID: 100369. https://doi.org/10.1016/j.cdc.2020.100369 Venkatesh, T., Bodke, Y.D., Nagaraj, K., and Kumar, S.R., Med. Chem., 2018, vol. 8, Article ID: 1000488. https://doi.org/10.4172/2161-0444.1000488 Kenchappa, R., Bodke, Y.D., Telkar, S., Sindhe, M.A., and Giridhar, M., Russ. J. Gen. Chem., 2016, vol. 86, pp. 2827–2836. https://doi.org/10.1134/S107036321612046X Shukla, R. and Tripathi, T., Curr. Comput. Aided Drug Des., 2020, pp. 133–161. https://doi.org/10.1007/978-981-15-6815-2_7 Kumar, Y., Singh, H., and Patel, C.N., J. Infect. Public Health, 2020, vol. 13, pp. 1210–1223. https://doi.org/10.1016/j.jiph.2020.06.016 Daina, A., Michielin, O., and Zoete, V., Sci. Rep., 2017, vol. 7, Article ID: 42717. https://doi.org/10.1038/srep42717 Mishra, S. and Dahima, R., J. Drug Deliv., 2019, vol. 9, pp. 366–369. https://doi.org/10.22270/jddt.v9i2-s.2710 Bhal, S.K., Kassam, K., Peirson, I.G., and Pearl, G.M., Mol. Pharmaceutics., 2007, vol. 4, pp. 556–560. https://doi.org/10.1021/mp0700209 Maliehe, T.S., Tsilo, P.H., and Shandu, J.S., Pharmacogn. J., 2020, vol. 12, pp. 1357–1362. https://doi.org/10.5530/pj.2020.12.187 Janakirama Rao, A.S., Mudduraj Urs, V.T., Devanna, J.N., Mahadevappa, P., and Kumaran, R.C., Lett. Drug Des. Discov., 2021, vol. 18, pp. 445–453. https://doi.org/10.2174/1570180817999201104120815 Sukanya, S.H., Venkatesh, T., Rao, S.A., and Joy, M.N., J. Mol. Struct., 2022, vol. 1247, Article ID: 131324. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2021.131324 Nath, A., Kumer, A., Zaben, F., and Khan, M.W., BJBAS, 2021. vol. 10, pp. 1–13. https://doi.org/10.1186/s43088-021-00117-8 Rashid, M., Bioorg. Chem., 2020, vol. 96, Article ID: 103576. https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2020.103576 Matada, M.N., Jathi, K., Malingappa, P., and Pushpavathi, I., Chem. Data Collect., 2020, vol. 25, Article ID: 100314. https://doi.org/10.1016/j.cdc.2019.100314 Maliyappa, M.R., Keshavayya, J., Mahanthappa, M., Shivaraj, Y., and Basavarajappa, K.V., J. Mol. Struct., 2020, vol. 1199, Article ID: 126959. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2019.126959