Tổng hợp, đặc trưng, nghiên cứu sinh học và mô hình docking phân tử của (Z)-N-Substituted-4-(Pyridin-2-yl)-6-(1H-Pyrrolo[2,3-b]Pyridin-4-yl)Pyrimidin-2-Amine

Russian Journal of Bioorganic Chemistry - Tập 48 Số 5 - Trang 1068-1075 - 2022
Arshad, M.1, Akhter, M. S.2
1Department of Basic Sciences, College of Medicine, Al-Dawadmi, Saudi Arabia
2Department of Chemistry, College of Science, University of Bahrain, Bahrain

Tóm tắt

Một loạt mười lăm hợp chất (Z)-N-substituted-4-(pyridin-2-yl)-6-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)pyrimidin-2-amine đã được thiết kế, sàng lọc tính toán và tổng hợp. Cấu trúc của các hợp chất (I–XV) được xác định bằng các phương pháp quang phổ như FT-IR, NMR (1H và 13C), và phổ khối. Các hợp chất này đã được thử nghiệm khả năng kháng khuẩn và nấm, cho thấy tiềm năng kháng khuẩn và kháng nấm đáng kể. Các hợp chất cũng được nghiên cứu về độ độc với tế bào dựa trên phần trăm sống sót của tế bào đối với tế bào HepG2 và được phát hiện trong khoảng 70-80% lên đến 100 µM. Mô hình docking phân tử cũng đã được thực hiện để quan sát sự hình thành liên kết H và độ gắn kết với thụ thể GlcN-6P, và quan sát thấy chỉ có các dư lượng axit amin như GLU315, SER316, ASP474, ALA520, và ASN522 có khả năng hình thành liên kết H với các hợp chất với độ gắn kết (–8.5 đến –6.7 kcal/mol).

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=S.N.T. Dighe, A. Collet; citation_volume=199; citation_publication_date=2020; citation_pages=112326-112334; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2020.112326; citation_id=CR1 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=R. Zanni, M. Galvez-Llompart, J. Machuca, R. Garcia-Domenech, E. Recacha, A. Pascual, J. M. Rodriguez-Martinez, J. Galvez; citation_volume=137; citation_publication_date=2017; citation_pages=233-246; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2017.05.055; citation_id=CR2 citation_journal_title=Science; citation_author=H.C. Neu; citation_volume=257; citation_publication_date=1992; citation_pages=1064-1073; citation_doi=10.1126/science.257.5073.1064; citation_id=CR3 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=F. Pandolfi, F. D’Acierno, M. Bortolami, D. De Vita, F. Gallo, A. De Meo, R R. Santo, D. Costi, G. Simonetti, L. Scipione; citation_volume=65; citation_publication_date=2019; citation_pages=93-106; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2019.01.012; citation_id=CR4 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=R. Pingaew, P. Mandi, V. Prachayasittikul, S. Prachayasittikul, S. Ruchirawat, V. Prachayasittikul; citation_volume=143; citation_publication_date=2018; citation_pages=1604-1615; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2017.10.057; citation_id=CR5 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=W. Li, W. Shuai, H. Sun, F. Xu, Y. Bi, J. Xu, C. Ma, H. Yao, Z. Zhu, S. Xu; citation_volume=163; citation_publication_date=2019; citation_pages=428-442; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2018.11.070; citation_id=CR6 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=M.P. Fortes, P.B.N.D. Silva, T.G.D. Silva, T. S. Kaufman, G.C.G. Militão, C.C. Silveira; citation_volume=118; citation_publication_date=2016; citation_pages=21-26; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2016.04.039; citation_id=CR7 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=S. Gupta, P. Maurya, A. Upadhyay, P. Kushwaha, S. Krishna, M.I. Siddiqi, K.V. Sashidhara, D. B-anerjee; citation_volume=143; citation_publication_date=2018; citation_pages=1981-1996; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2017.11.015; citation_id=CR8 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=R. Singla, K.B. Gupta, S. Upadhyay, M. Dhiman, V. Jaitak; citation_volume=146; citation_publication_date=2018; citation_pages=206-219; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2018.01.051; citation_id=CR9 citation_journal_title=Mini-Rev. Med. Chem.; citation_author=P.S. Thokchom, M.S. Okram; citation_volume=18; citation_publication_date=2018; citation_pages=9-25; citation_doi=10.2174/1389557517666170807123201; citation_id=CR10 citation_journal_title=J. Mol. Struct.; citation_author=E. Zarenezhad, M. Farjama, A. Iraji; citation_volume=1230; citation_publication_date=2021; citation_pages=129833-129839; citation_doi=10.1016/j.molstruc.2020.129833; citation_id=CR11 citation_journal_title=Arab. J. Chem.; citation_author=A. Balupuri, P.K. Balasubramanian, S. Joo-Cho; citation_volume=13; citation_publication_date=2020; citation_pages=1052-1078; citation_doi=10.1016/j.arabjc.2017.09.009; citation_id=CR12 citation_journal_title=Arab. J. Chem.; citation_author=C.M. Bhalgat, M.I. Ali, B. Ramesh, G. Ramu; citation_volume=7; citation_publication_date=2014; citation_pages=986-983; citation_doi=10.1016/j.arabjc.2010.12.021; citation_id=CR13 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=S.S. Maurya, A. Bahuguna, S.I. Khan, D. Kumar, R. Kholiya, D.S. Rawat; citation_volume=162; citation_publication_date=2019; citation_pages=277-289; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2018.11.021; citation_id=CR14 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=P. Liu, Y. Yang, Y. Tang, T. Yang, Z. Sang, Z. Liu, T. Zhang, Y. Luo; citation_volume=163; citation_publication_date=2019; citation_pages=169-182; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2018.11.054; citation_id=CR15 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_title=Wang, X., Jiang, T., and Proud, C.G; citation_author=X. Jin, J. Merrett, S. Tong, B. Flower, J. Xie, R. Yu, S. Tian, L. Gao, J. Zhao; citation_volume=162; citation_publication_date=2019; citation_pages=735-751; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2018.10.070; citation_id=CR16 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=R. Chopra, K. Chibale, K. Singh; citation_volume=148; citation_publication_date=2018; citation_pages=39-53; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2018.02.021; citation_id=CR17 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=W. Tuo, M. Bollier, N. Leleu-Chavain, L. Lemaire, A. Barczyk, X. Dezitter, F. Klupsch, F. Szczepanski, J. Spencer, P. Chavatte, R. Millet; citation_volume=146; citation_publication_date=2018; citation_pages=68-78; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2018.01.034; citation_id=CR18 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=S. Federico, E. Margiotta, V. Salmaso, G. Pastorin, S. Kachler, K.-N. Klotz, S. Moro, G. Spalluto; citation_volume=157; citation_publication_date=2018; citation_pages=837-851; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2018.08.042; citation_id=CR19 citation_journal_title=ACS Med. Chem. Lett.; citation_author=Z.H. Li, X.Q. Liu, P.F. Geng, F.Z. Suo, J.L. Ma, B. Yu, T.Q. Zhao, Z.Q. Zhou, C.X. Huang, Y.C. Zheng, H.M. Liu; citation_volume=8; citation_publication_date=2017; citation_pages=384-389; citation_doi=10.1021/acsmedchemlett.6b00423; citation_id=CR20 citation_journal_title=Bioorg. Med. Chem. Lett.; citation_author=X. Zhang, X. Li, D. Li, G. Qu, J. Wang, P.M. Loiseau, X. Fan; citation_volume=19; citation_publication_date=2009; citation_pages=6280-6283; citation_doi=10.1016/j.bmcl.2009.09.101; citation_id=CR21 citation_journal_title=Saudi Pharm. J.; citation_author=R.V. Antre, A. Cendilkumar, D. Goli, G.S. Andhale, R.J. Oswal; citation_volume=19; citation_publication_date=2011; citation_pages=233-243; citation_doi=10.1016/j.jsps.2011.05.006; citation_id=CR22 citation_journal_title=Bioorg. Chem.; citation_author=Y. Fang, L. Xiong, J. Hu, S. Zhang, S. Xie, L. Tu, Y. Wan, Y. Jin, X. Li, S. Hu, Z. Yang; citation_volume=86; citation_publication_date=2019; citation_pages=103-111; citation_doi=10.1016/j.bioorg.2019.01.032; citation_id=CR23 citation_journal_title=Bioorg. Med. Chem. Lett.; citation_author=A. Molinari, A. Lucia-Fallacara, S. Di-Maria, C. Zamperini, F. Poggialini, F. Musumeci, S. Schenone, A. Angelucci, A. Colapietro, E. Crespan, M. Kissova, G. Maga, M. Botta; citation_volume=28; citation_publication_date=2018; citation_pages=3454-3457; citation_doi=10.1016/j.bmcl.2018.09.024; citation_id=CR24 citation_journal_title=Bioorg. Med. Chem. Lett.; citation_author=M.R. Bhosle, A.R. Deshmukh, S. Pal, A.K. Srivastava, R.A. Mane; citation_volume=25; citation_publication_date=2015; citation_pages=2442-2446; citation_doi=10.1016/j.bmcl.2015.03.068; citation_id=CR25 citation_journal_title=Bioorg. Med. Chem. Lett.; citation_author=K.J. Alzahrani, E.S. Matyugina, A.L. Khandazhinskaya, S.N. Kochetkov, K.L.S. Radtke, H.P. de Koning; citation_volume=27; citation_publication_date=2017; citation_pages=3081-3086; citation_doi=10.1016/j.bmcl.2017.05.052; citation_id=CR26 citation_journal_title=Bioorg. Med. Chem. Lett.; citation_author=J.-K. Jiang, X. Huang, K. Shamim, P.R. Patel, A. Lee, A.Q. Wang, K. Nguyen, G. Tawa, G.D. Cuny, P.B. Yu, W. Zheng, X. Xu, P. Sanderson, W. Huang; citation_volume=28; citation_publication_date=2018; citation_pages=3356-3362; citation_doi=10.1016/j.bmcl.2018.09.006; citation_id=CR27 citation_journal_title=Int. J. Parasitol. Drugs Drug Resist.; citation_author=K.J.H. Alzahrani, J.A.M. Ali, A.A. Eze, W.L. Looi, D.N.A. Tagoe, D.J. Creek, M.P. Barrett, H.P. de Koning; citation_volume=7; citation_publication_date=2017; citation_pages=206-226; citation_doi=10.1016/j.ijpddr.2017.04.003; citation_id=CR28 citation_journal_title=Bioorg. Chem.; citation_author=W. Sun, S. Hu, S. Fang, H. Yan; citation_volume=78; citation_publication_date=2019; citation_pages=103232-103239; citation_doi=10.1016/j.bioorg.2019.103232; citation_id=CR29 citation_journal_title=Chem. Engineer. J.; citation_author=G. Li, X. Zhang, J. Huang, T. Li, S. Yang, Y. Wang, J. Jiang, B. Xia, M. Chen, W. Dong; citation_volume=435; citation_publication_date=2022; citation_pages=134766; citation_doi=10.1016/j.cej.2022.134766; citation_id=CR30 citation_journal_title=Appl. Sci.; citation_title= SN ; citation_author=M. Arshad; citation_volume=2; citation_publication_date=2020; citation_pages=467-475; citation_doi=10.1007/s42452-020-2243-0; citation_id=CR31 citation_journal_title=J. Iran. Chem. Soc.; citation_author=M. Arshad; citation_volume=17; citation_publication_date=2020; citation_pages=1305-1315; citation_doi=10.1007/s13738-020-01855-9; citation_id=CR32 citation_journal_title=J. Iran. Chem. Soc.; citation_author=M. Arshad, M.S. Khan, SAA. Nami; citation_volume=18; citation_publication_date=2021; citation_pages=2397-2406; citation_doi=10.1007/s13738-021-02200-4; citation_id=CR33 citation_journal_title=Russ. J. Bioorg. Chem.; citation_author=M. Arshad; citation_volume=46; citation_publication_date=2020; citation_pages=599-611; citation_doi=10.1134/S1068162020040056; citation_id=CR34 citation_journal_title=Chem. Data Collect.; citation_author=M. Arshad, D. Ahmad, R. Akhter; citation_volume=28; citation_publication_date=2020; citation_pages=100405-10415; citation_doi=10.1016/j.cdc.2020.100405; citation_id=CR35 citation_journal_title=J. Iran. Chem. Soc.; citation_author=M. Arshad, M.S. Khan, SAA. Nami, S. I. Ahmad, M. Kashif, A. Anjum; citation_volume=18; citation_publication_date=2021; citation_pages=1713-1727; citation_doi=10.1007/s13738-020-02144-1; citation_id=CR36 citation_journal_title=Asian Pac. J. Trop. Biomed.; citation_author=E.A. Alodeani, M. Arshad, M.A. Izhari; citation_volume=5; citation_publication_date=2015; citation_pages=676-683; citation_doi=10.1016/j.apjtb.2015.04.010; citation_id=CR37 citation_journal_title=Appl. Sci.; citation_title= SN ; citation_author=M. Arshad, M.S. Khan, S.A.A. Nami; citation_volume=1; citation_publication_date=2019; citation_pages=548-556; citation_doi=10.1007/s42452-019-0571-8; citation_id=CR38 citation_journal_title=Appl. Chem; citation_title= Biointerface Res. ; citation_author=T. Chaban, V. Horishny, M. Arshad, Z. Chulovska, L. Kostyshyn, I. Drapak, V. Matiychuk; citation_volume=11; citation_publication_date=2021; citation_pages=12434-12446; citation_doi=10.33263/BRIAC114.1243412446; citation_id=CR39 citation_journal_title=Eur. Chem. Bull.; citation_author=T. Chaban, M. Arshad, L. Kostyshyn, I. Drapak, V. Matiychuk; citation_volume=10; citation_publication_date=2021; citation_pages=230-236; citation_doi=10.17628/ECB.2021.10.230-236; citation_id=CR40 Arshad, M., Beg, M.A., Bhat, A.R., and Athar, F., Indian J. Chem. (Section B), 2021, vol. 2021, pp. 1636–1651. http://nopr.niscair.res.in/handle/123456789/58610 citation_journal_title=J. Health Sci.; citation_title= Asian Pac. ; citation_author=E.A. Alodeani, M.A. Izhari, M. Arshad; citation_volume=2; citation_publication_date=2015; citation_pages=41-47; citation_doi=10.21276/apjhs.2015.2.2.8; citation_id=CR42 citation_journal_title=Chem. Biodiv; citation_author=A.R. Bhat, M. Arshad, E.J. Lee, S. Pokharel, I. Choi, F. Athar; citation_volume=10; citation_publication_date=2013; citation_pages=2267-2277; citation_doi=10.1002/cbdv.201300009; citation_id=CR43 citation_journal_title=Chin. Chem. Lett.; citation_author=M. Arshad, A.R. Bhat, K.K. Hoi, I. Choi, F. Athar; citation_volume=28; citation_publication_date=2017; citation_pages=1559-1565; citation_doi=10.1016/j.cclet.2016.12.037; citation_id=CR44 citation_journal_title=Eur. J. Med. Chem.; citation_author=M. Arshad, A.R. Bhat, S. Pokharel, J.-E. Kim, E. J. Lee, F. Athar, I. Choi; citation_volume=71; citation_publication_date=2014; citation_pages=229-236; citation_doi=10.1016/j.ejmech.2013.11.008; citation_id=CR45 citation_journal_title=Il Farmaco; citation_author=S. Rollas, N. Gulerman, H. Erdeniz; citation_volume=57; citation_publication_date=2002; citation_pages=171-174; citation_doi=10.1016/s0014-827x(01)01192-2; citation_id=CR46 citation_journal_title=Int. J. Pharm. Sci. Res.; citation_author=M. Arshad; citation_volume=5; citation_publication_date=2014; citation_pages=1024-1037; citation_doi=10.13040/IJPSR.0975-8232.5(4).1000-13; citation_id=CR47 citation_journal_title=Russ. J. Gen. Chem.; citation_author=M. Arshad, M.S. Khan, S.A.A. Nami, D. Ahmad; citation_volume=88; citation_publication_date=2018; citation_pages=2154-2162; citation_doi=10.1134/S1070363218100213; citation_id=CR48 citation_journal_title=Russ. J. Gen. Chem.; citation_author=M. Arshad; citation_volume=88; citation_publication_date=2018; citation_pages=1886-1891; citation_doi=10.1134/S1070363218090207; citation_id=CR49 citation_journal_title=J. Photochem. Photobiol. B: Biology; citation_title=Laxmi, Arshad, M., Nami S.A.A., and Nishat, N; citation_author=A. Kareem; citation_volume=160; citation_publication_date=2016; citation_pages=163-171; citation_doi=10.1016/j.jphotobiol.2016.03.030; citation_id=CR50 citation_journal_title=J. Photochem. Photobiol. B: Biology; citation_author=N.E. Iram, M.S. Khan, R. Jolly, M. Arshad, M. Alam, P. Alam, R.H. Khan, F. Firdaus; citation_volume=153; citation_publication_date=2015; citation_pages=20-32; citation_doi=10.1016/j.jphotobiol.2015.09.001; citation_id=CR51 citation_journal_title=Polymer. Adv. Technol.; citation_author=S.A.A. Nami, M. Arshad, M.S. Khan, M. Alam, D-U. Lee, S. Park, N. Sarikavakli; citation_volume=26; citation_publication_date=2015; citation_pages=1627-1638; citation_doi=10.1002/pat.3591; citation_id=CR52 citation_journal_title=Int. J. Env. Sci. Technol.; citation_author=R. Bushra, M. Shahadat, M.A. Khan, R. Adnan, M. Arshad, M. Rafatullah, M. Naushad; citation_volume=12; citation_publication_date=2015; citation_pages=3635-3642; citation_doi=10.1007/s13762-014-0726-5; citation_id=CR53 citation_journal_title=Polymer. Adv. Technol.; citation_author=S.A.A. Nami, M.S. Khan, M. Arshad, M.A. Raza, I. Khan; citation_volume=28; citation_publication_date=2017; citation_pages=10-19; citation_doi=10.1002/pat.3846; citation_id=CR54 Khan, Z.K., Proceedings of the International Workshop UNIDO-CDRI, 1997, p. 210. Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically Approved Standard, 11th ed. CLSI document M7-A7. Wayne, Pennsylvania, USA, 2006, pp. 1–49. https://clsi.org/media/ 1928/m07ed11_sample.pdf citation_journal_title=Antioxid. Redox Signal.; citation_author=M.K. Gupta, T.V. Neelakantan, M. Sanghamitra, RK. Tyagi, A. Dinda, S. Maulik, C.K. Mukhopadhyay, S.K. Goswami; citation_volume=8; citation_publication_date=2006; citation_pages=1081-1093; citation_doi=10.1089/ars.2006.8.1081; citation_id=CR57 citation_journal_title=J. Immunol. Methods; citation_author=T. Mosmann; citation_volume=65; citation_publication_date=1983; citation_pages=55; citation_doi=10.1016/0022-1759(83)90303-4; citation_id=CR58 citation_journal_title=J. Mol. Biol.; citation_author=S. Mouilleron, M.A. Badet-Denisot, B. Golinelli-Pimpaneau; citation_volume=377; citation_publication_date=2008; citation_pages=1174-1185; citation_doi=10.1016/j.jmb.2008.01.077; citation_id=CR59 citation_journal_title=J. Comput. Chem.; citation_author=O. Trott, A.J. Olson; citation_volume=31; citation_publication_date=2010; citation_pages=455-461; citation_id=CR60