Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Biến thể đơn nucleotide trong vùng không dịch mã 3′ của LPP là yếu tố nguy cơ cho ung thư phổi: một nghiên cứu bệnh-chứng
Tóm tắt
Các biến thể đơn nucleotide (SNPs) trong vùng không dịch mã 3′ (UTR) của các gen liên quan đến sự bám dính và di chuyển của tế bào có thể ảnh hưởng đến sự gắn kết của miRNA và có khả năng ảnh hưởng đến nguy cơ ung thư. Nghiên cứu hiện tại nhằm mục đích sàng lọc các SNP trong vùng 3′ UTR của các gen liên quan đến ung thư và điều tra sự đóng góp của chúng vào mẫn cảm với ung thư phổi. Bảy SNP đã được chọn và phân tích kiểu gen trong một nghiên cứu bệnh-chứng (322 bệnh nhân ung thư phổi và 384 người đối chứng) trong quần thể người Hán ở Trung Quốc. Tỷ lệ kh Odds (OR) và khoảng tin cậy 95% (CIs) được tính toán bằng hồi quy logistic đã điều chỉnh theo độ tuổi và giới tính trong nhiều mô hình di truyền. Trong các phân tích phân tầng theo giới tính, ba SNP (rs1064607, rs3796283 và rs2378456) của gen LPP có liên quan đến nguy cơ cao hơn rõ rệt đối với ung thư phổi trong quần thể nam giới. Bên cạnh đó, SNP rs2378456 của LPP làm suy yếu nguy cơ ung thư phổi ở nữ giới. Biến thể rs1064607 của LPP có sự tương quan đáng kể với nguy cơ gia tăng ung thư phổi dạng tuyến. Hơn nữa, kiểu gen AA của biến thể rs9876 của TNS3 có liên quan đến di căn bạch huyết. Kết quả của chúng tôi cung cấp bằng chứng về ảnh hưởng của các biến thể LPP đến mẫn cảm với ung thư phổi ở quần thể người Trung Quốc.
Từ khóa
#Biến thể đơn nucleotide #ung thư phổi #vùng không dịch mã 3′ #LPP #TNS3.Tài liệu tham khảo
Bray F, Ferlay J, Soerjomataram I, Siegel RL, Torre LA, Jemal A. Global Cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin. 2018;68:394–424.
Chen W, Zheng R, Baade PD, Zhang S, Zeng H, Bray F, et al. Cancer statistics in China, 2015. CA Cancer J Clin. 2016;66:115–32.
Wood DE, Eapen GA, Ettinger DS, Hou L, Jackman D, Kazerooni E, et al. Lung cancer screening. Journal of the National Comprehensive Cancer Network. Jnccn. 2012;10:240–65.
Malhotra J, Malvezzi M, Negri E, La Vecchia C, Boffetta P. Risk factors for lung cancer worldwide. Eur Respir J. 2016;48:889–902.
Wang T, Chen T, Thakur A, Liang Y, Gao L, Zhang S, et al. Association of PSMA4 polymorphisms with lung cancer susceptibility and response to cisplatin-based chemotherapy in a Chinese Han population. Tumour Biol. 2015;17:564–9.
Xun X, Wang H, Yang H, Wang H, Wang B, Kang L, et al. CLPTM1L genetic polymorphisms and interaction with smoking and alcohol drinking in lung Cancer risk: a case–control study in the Han population from Northwest China. Medicine. 2014;93:e289.
Hu QY, Jin TB, Wang L, Zhang L, Geng T, Liang G, et al. Genetic variation in the TP63 gene is associated with lung cancer risk in the Han population. Tumor Biol. 2014;35:1863–6.
Yamaguchi H, Wyckoff J, Condeelis J. Cell migration in tumors. Curr Opin Cell Biol. 2005;17:559–64.
Leung CS, Yeung TL, Yip KP, Wong KK, Ho SY, Mangala LS, et al. Cancer-associated fibroblasts regulate endothelial adhesion protein LPP to promote ovarian cancer chemoresistance. J Clin Investig. 2017;128:589–606.
Ngan E, Northey JJ, Brown CM, Ursinisiegel J, Siegel PM. A complex containing LPP and alpha-Actinin mediates TGFbeta-induced migration and invasion of ErbB2-expressing breast cancer cells. J Cell Sci. 2013;126:1981–91.
Shinchi Y, Hieda M, Nishioka Y, Matsumoto A, Yokoyama Y, Kimura H, et al. SUV420H2 suppresses breast cancer cell invasion through down regulation of the SH2 domain-containing focal adhesion protein tensin-3. Exp Cell Res. 2015;334:90–9.
Nadolny C, Dong X. Liver receptor homolog-1 (LRH-1): a potential therapeutic target for cancer. Cancer Biol Ther. 2015;16:997–1004.
Vess A, Blache U, Leitner L, Kurz ARM, Ehrenpfordt A, Sixt M, et al. A dual phenotype of MDA-MB-468 cancer cells reveals mutual regulation of tensin3 and adhesion plasticity. Journal of cell science 2017;130:2172-84.
Zhang X, Gu D, Du M, Wang M, Cao C, Shen L, et al. Associations of NR5A2 gene polymorphisms with the clinicopathological characteristics and survival of gastric cancer. Int J Mol Sci. 2014;15:22902–17.
Li Z, Wong KY, Chan GC, Chim CSZ. Epigenetic silencing of LPP/miR-28 in multiple myeloma. J Clin Pathol. 2017;71:253–8.
Kertesz M, Iovino N, Unnerstall U, Gaul U, Segal E. The role of site accessibility in microRNA target recognition. Nat Genet. 2007;39:1278–84.
Pirooz HJ, Jafari N, Rastegari M, Fathi-Roudsari M, Tasharrofi N, Shokri G, et al. Functional SNP in microRNA-491-5p binding site of MMP9 3'-UTR affects Cancer susceptibility. J Cell Biochem. 2017;119:5126–34.
Van Itallie CM, Tietgens AJ, Aponte A, Fredriksson K, Fanning AS, Gucek M, et al. Biotin ligase tagging identifies proteins proximal to E-cadherin, including lipoma preferred partner, a regulator of epithelial cell-cell and cell-substrate adhesion. J Cell Sci. 2014;127:885–95.
Ngan E, Stoletov K, Smith HW, Common J, Muller WJ, Lewis JD, et al. LPP is a Src substrate required for invadopodia formation and efficient breast cancer lung metastasis. Nat Commun. 2017;8:15059.
Kuriyama S, Yoshida M, Yano S, Aiba N, Kohno T, Minamiya Y, et al. LPP inhibits collective cell migration during lung cancer dissemination. Oncogene. 2015;35:952–64.
Ji UK, Sun HK, Kwon KC, Park JW, Jin MK. Identification of novel candidate target genes, including EPHB3, MASP1 and SST at 3q26.2–q29 in squamous cell carcinoma of the lung. BMC Cancer. 2009;9:237.
Carter JA, Gorecki DC, Mein CA, Ljungberg B, Hafizi S. CpG dinucleotide-specific hypermethylation of the TNS3 gene promoter in human renal cell carcinoma. Epigenetics. 2013;8:739–47.
Qian X, Li G, Vass WC, Papageorge A, Walker RC, Asnaghi L, et al. The Tensin-3 protein, including its SH2 domain, is phosphorylated by Src and contributes to tumorigenesis and metastasis. Cancer Cell. 2009;16:246–58.
Ryan BM, Robles AI, Harris CC. Genetic variation in microRNA networks: the implications for cancer research. Nat Rev Cancer. 2010;10:389–402.
Chin LJ, Ratner E, Leng S, Zhai R, Nallur S, Babar I, et al. A SNP in a let-7 microRNA complementary site in the KRAS 3′ untranslated region increases non-small cell lung cancer risk. Cancer Res. 2008;68:8535–40.
Chen S, Li P, Li J, Wang Y, Du Y, Chen X, et al. MiR-144 inhibits proliferation and induces apoptosis and autophagy in lung Cancer cells by targeting TIGAR. Cell Physiol Biochem. 2015;35:997–1007.
Yanyan H, Chen DD, He JY, Liu XG, Zhu W, Zhang Y. Overexpression of members of the microRNA-183 family is a risk factor for lung cancer: a case control study. BMC Cancer. 2011;11:393.