Đột Biến Một Nucleotide cho Genomics Chức Năng Ở Thực Vật

Annual Review of Plant Biology - Tập 54 Số 1 - Trang 375-401 - 2003
Steven Henikoff1,2, Luca Comai1,3
1Department of Botany, University of Washington, Seattle, Washington, 98195
2Howard Hughes Medical Institute, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Washington 98109, USA. [email protected]
3Howard Hughes Medical Institute, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Washington 98109

Tóm tắt

Trong kỷ nguyên genomics hiện nay, các chiến lược gen đảo mạnh mẽ là cần thiết để làm sáng tỏ chức năng của gen và protein trong ngữ cảnh của một tổ chức hoàn chỉnh. Tuy nhiên, phần lớn các kỹ thuật hiện tại thiếu tính tổng quát và tiềm năng sản xuất cao của các phương pháp genomics mô tả, chẳng hạn như những phương pháp dựa trên sự lai ghép microarray. Ví dụ, trong nghiên cứu thực vật, các phương pháp đột biến chèn hiệu quả và các phương pháp biến đổi gen bị hạn chế ở một số loài nhất định hoặc không hiệu quả. May mắn thay, các thay đổi nucleotide đơn lẻ có thể được gây ra trong bất kỳ loại thực vật nào bằng cách sử dụng các tác nhân đột biến hóa học truyền thống, và đã có nhiều tiến bộ trong việc phát hiện các thay đổi này một cách hiệu quả. Bởi vì việc thay thế cơ sở trong protein cung cấp các chuỗi alen, chứ không chỉ là các knockout, chiến lược này có thể mang lại những hiểu biết tinh tế hơn về chức năng của protein. Ở đây, chúng tôi xem xét những tiến bộ gần đây đã đạt được trong sàng lọc cả bộ gen cho các đột biến điểm và sự biến đổi tự nhiên trong thực vật. Tính khả thi tổng quát của nó dẫn đến kỳ vọng rằng việc đột biến truyền thống theo sau là phát hiện với quy mô lớn sẽ ngày càng trở nên quan trọng cho genomics chức năng của thực vật.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Ashburner M, 1990, Drosophila, A Laboratory Handbook.

Ashburner M, 1999, Genetics, 153, 179, 10.1093/genetics/153.1.179

10.1104/pp.900036

10.1046/j.1365-313X.1993.04020403.x

10.1016/S0960-9822(02)00665-6

Bechtold N, 1998, Methods Mol. Biol., 82, 259

Bentley A, 2000, Genetics, 156, 1169, 10.1093/genetics/156.3.1169

10.1016/S1369-5266(00)00144-8

10.1016/S1369-5266(00)00145-X

10.1002/humu.27

10.1073/pnas.97.3.956

10.1016/S1367-5931(00)00171-X

10.1073/pnas.060034297

10.1104/pp.126.2.480

10.1023/A:1013722224489

10.1104/pp.124.4.1483

10.1038/ng767

10.1093/hmg/8.10.1893

10.1002/bies.1094

10.1126/science.1068275

10.1101/gad.1013902

10.1093/nar/19.23.6565

10.1023/A:1005774705893

10.1038/ng0997-119

10.1038/35093585

10.1016/0027-5107(82)90129-4

10.1089/153623102760092760

10.1093/oxfordjournals.molbev.a003774

10.1146/annurev.genom.2.1.235

10.1016/S1360-1385(01)02226-9

10.1002/1522-2683(200205)23:10<1499::AID-ELPS1499>3.0.CO;2-X

10.1046/j.1365-313x.2001.01084.x

10.1126/science.1059745

10.1104/pp.123.3.795

10.1126/science.1063051

10.1038/74542

10.1104/pp.123.2.439

10.1046/j.1365-313x.1997.12061465.x

10.1002/elps.11501301103

10.1007/BF02984195

10.1038/nbt0802-785

10.1016/S0168-9525(02)02820-2

10.1101/gr.176601

10.1101/gr.212802

Nickerson DA, 2001, Methods Mol. Biol., 175, 29

10.1093/nar/25.14.2745

10.1038/ng813

10.1093/nar/26.20.4597

10.1385/CBB:32:1-3:165

10.1006/geno.2002.6784

10.1016/S1369-5266(02)00240-6

10.1142/9789814439701_0002

10.1104/pp.123.2.427

10.1126/science.288.5473.2013

10.1016/S0076-6879(02)53071-8

Rozen S, 2000, Methods Mol. Biol., 132, 365

10.1016/S1369-5266(00)00150-3

Schuch W, 1991, Symp. Soc. Exp. Biol., 45, 117

Stadler LJ, 1932, Proc. Congr. Genet., 6th, 1, 274

10.1073/pnas.76.3.1035

10.1104/pp.126.4.1527

Till BJ, Colbert T, Tompa R, Enns L, Codomo C, et al. 2002. High-throughput TILLING for functional genomics. InPlant Functional Genomics: Methods and Protocols, ed. E Grotewald. Totowa, NJ: Humana. In press

10.1101/gr.7.10.996

Vaucheret H, 2001, J. Cell Sci., 114, 3083, 10.1242/jcs.114.17.3083

10.1016/S0378-1119(01)00532-7

10.1073/pnas.95.23.13959

10.1126/science.1071762

10.1007/s004380000421

10.1021/bi992376z

10.1126/science.1068037

10.1016/0165-1161(95)90006-3