MÔ HÌNH HÓA CÁC MẠNG GEN PROKARYOTIC

Annual Reviews - Tập 27 Số 1 - Trang 199-224 - 1998
Harley H. McAdams1, Adam P. Arkin2
1Department of Developmental Biology, Beckman Center, Stanford University School of Medicine, California 94305, USA.
2Department of Developmental Biology, Beckman Center, Stanford University School of Medicine, Stanford, California 94305

Tóm tắt

▪ Tóm tắt  Các phương pháp sinh hóa và di truyền đã xác định được các cơ chế phân tử của nhiều phản ứng di truyền, đặc biệt là ở vi khuẩn. Hiện nay, cần có một sự hiểu biết chi tiết tương đương về cách các nhóm gene và các phản ứng protein liên quan tương tác để tổ chức các chức năng tế bào suốt chu kỳ tế bào, để thực hiện sự phát triển tế bào đã được lập trình sẵn, hoặc để thay đổi linh hoạt các quy trình và cấu trúc của tế bào theo phản ứng với các tín hiệu môi trường. Các mô phỏng sử dụng các mô hình phân tử thực tế về các cơ chế di truyền và các mạng truyền tín hiệu là cần thiết để phân tích hành vi động của các hệ thống đa gene, để dự đoán hành vi của các mạch đột biến, và để xác định các nguyên tắc thiết kế có thể áp dụng cho việc thiết kế các mạch điều hòa di truyền. Khi các quy tắc thiết kế cơ bản cho các mạch điều hòa được hiểu rõ, sẽ dễ dàng hơn nhiều để nhận ra các mô thức mạch chung, xác định các chức năng của các protein riêng lẻ trong việc điều hòa, và thiết kế lại các mạch cho các chức năng được thay đổi.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1016/0010-4809(71)90047-4

Achs MJ, 1977, Am. J. Physiol., 232, R164

10.1016/S0006-3495(94)80516-8

10.1038/43199

10.1038/376307a0

10.1091/mbc.4.5.469

10.1146/annurev.bi.63.070194.002223

10.1111/j.1365-2958.1995.mmi_18020201.x

10.1016/0009-2509(95)00306-1

Collado-Vides J, 1991, Microb. Rev., 55, 371, 10.1128/mr.55.3.371-394.1991

10.1016/S0959-437X(96)80081-5

10.1016/S0092-8674(00)80502-4

10.1146/annurev.mi.47.100193.001215

10.1099/13500872-141-6-1271

10.1126/science.2943018

Echols H, Guarneros G. 1983. Control of integration and excision. InLambda II, ed. R Hendrix, JW Roberts, FW Stahl, RA Weisberg, pp. 75–92. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Lab. Press

10.1046/j.1365-2443.1997.d01-311.x

Ehlde M, 1995, Comp. Applic. Biosci., 11, 201

10.1002/(SICI)1097-0290(19970720)55:2<375::AID-BIT15>3.0.CO;2-G

Errington J, 1993, Microbiol. Rev., 57, 1, 10.1128/mr.57.1.1-33.1993

10.1126/science.276.5313.718

Finlay BB, 1997, Microbiol. Mol. Biol. Rev., 61, 136

10.1111/j.1365-2958.1992.tb01432.x

10.1016/S0959-437X(05)80133-9

10.1146/annurev.cellbio.12.1.221

10.1021/j100540a008

10.1016/0378-4371(92)90283-V

Gober JW, 1995, Microb. Rev., 59, 31, 10.1128/mr.59.1.31-47.1995

10.1073/pnas.88.20.9107

10.1017/CBO9780511608193

10.1111/j.1365-2958.1995.tb02386.x

10.1146/annurev.ge.18.120184.002215

10.1016/S0966-842X(97)01002-0

10.1111/j.1574-6968.1993.tb05873.x

10.1146/annurev.ge.29.120195.002401

10.1002/bies.950171112

10.1038/43072

10.1126/science.2683079

10.1016/S0006-3495(95)80232-8

10.1016/0079-6107(78)90017-2

10.1146/annurev.ge.14.120180.002151

10.1111/j.1365-2958.1996.tb02501.x

10.1016/0092-8674(92)90468-R

10.1016/0303-2647(90)90001-H

Jacob F, Monod J. 1962. Elements of regulatory circuits in bacteria. Presented at Symp. Biol. Organiz. Cell. Supercell Lev., Varenna, Italy, pp. 1–24. New York: Academic

Jacob F, Monod J. 1962. Genetic repression, allosteric inhibition, and cellular differentiation. Presented at Symp. Cytodifferent. Macromol. Synth., Asilomar, California, pp. 30–64. New York: Academic

Jacob F, Monod J. 1962. On the regulation of gene activity. Symp. Cell. Regul. Mech. pp. 193–209. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Lab. Press

Kacser H, Burns JA. 1973. The control of flux. Presented at Symp. Soc. Exper. Biol. Rate Control Biol. Proc. pp. 65–104. Cambridge: Cambridge Univ. Press

10.1096/fasebj.10.2.8641557

10.1146/annurev.mi.46.100192.001001

10.1046/j.1365-2958.1997.4251782.x

Koster JG, 1990, Biomed. Biochim. Acta, 49, 855

10.1073/pnas.94.17.9153

10.1016/0092-8674(94)90289-5

10.1016/0169-2607(92)90102-D

10.1073/pnas.93.13.6382

10.1016/S0006-3495(92)81824-6

10.1016/0092-8674(93)90271-Q

10.1016/0022-2836(80)90302-2

10.1073/pnas.94.3.814

10.1126/science.7624793

10.1126/science.1962208

10.1063/1.1724926

Mendes P, 1993, Comp. Applic. Biosci., 9, 563

10.1016/0022-2836(80)90303-4

10.1016/0022-2836(80)90304-6

10.1093/dnares/4.2.161

Monod J, 1962, General conclusions: teleonomic mechanisms in cellular metabolism, growth, and differentiation.

Neidhardt FC, Savageau MA. 1996. Regulation beyond the operon. InEscherichia coli and Salmonella typhimurium: Cellular and molecular biology, pp. 1310–24. Washington, DC: Am. Soc. Microbiol.

10.1126/science.1825521

Novak B, 1993, J. Cell Sci., 106, 1153, 10.1242/jcs.106.4.1153

Obeyesekere MN, 1995, Oncogene, 11, 1199

10.1016/0006-291X(92)90658-8

10.1016/S0022-5193(05)80145-6

Ptashne M, 1992, A Genetic Switch: Phage λ and Higher Organisms.

10.1016/S0092-8674(00)80995-2

10.1016/S0022-5193(05)80111-0

10.1016/S0070-2153(08)60712-7

10.1016/S0074-7696(08)60269-7

Sauro HM, 1993, Comp. Applic. Biosci., 9, 441

10.1016/S0022-5193(05)80367-4

10.1126/science.276.5313.712

10.1016/0022-2836(85)90086-5

10.1002/cplx.6130010612

10.1016/0025-5564(89)90064-3

10.1016/0025-5564(89)90065-5

10.1073/pnas.94.14.7263

10.1126/science.1904627

10.1126/science.276.5313.707

10.1073/pnas.94.4.1194

10.1016/S0022-5193(05)80144-4

10.1016/0092-8240(94)00037-D

10.1016/0022-5193(73)90247-6

10.1016/S0022-5193(05)80350-9

10.1111/j.1432-1033.1976.tb11108.x

10.1016/0092-8240(94)00036-C

10.1073/pnas.88.16.7328

10.1016/0968-0004(96)10011-6

Van Kampen NG. 1992. Stochastic Processes in Physics and Chemistry, p. 460. Amsterdam: North-Holland

10.1016/0962-8924(96)10018-0

10.1016/S0167-7799(00)88955-6

Westerhoff HV, 1990, Biomed. Biochim. Acta, 49, 839

Wuensche A, Lesser MJ. 1992. The global dynamics of cellular automata. InSFI Studies in the Sciences of Complexity. Reading, MA: Addison-Wesley

10.1016/S0968-0004(97)01036-0

10.1046/j.1365-2443.1996.28028.x

Thông tin
Thông tin xuất bản

Annual Reviews

Tập 27 Số 1

199-224

Thông tin tác giả