PCR định lượng thời gian thực.

Genome Research - Tập 6 Số 10 - Trang 986-994 - 1996
Chris Heid1, Junko Stevens1, Kenneth J. Livak1, P. Williams1
11BioAnalytical Technology Department, Genentech, Inc., South San Francisco, California 94080; 2Applied BioSystems Division of Perkin Elmer Corp., Foster City, California 94404

Tóm tắt

Chúng tôi đã phát triển một phương pháp PCR định lượng "thời gian thực" mới. Phương pháp này đo sự tích lũy của sản phẩm PCR qua một đầu dò fluorogenic gắn nhãn kép (tức là, đầu dò TaqMan). Phương pháp này cung cấp phép đo định lượng số lượng bản sao gene rất chính xác và nghiêm ngặt. Không giống như các phương pháp PCR định lượng khác, PCR thời gian thực không yêu cầu xử lý mẫu sau PCR, ngăn ngừa sự lây nhiễm tiềm ẩn qua lại của sản phẩm PCR và dẫn đến các xét nghiệm nhanh hơn và hiệu suất cao hơn. Phương pháp PCR định lượng thời gian thực có một phạm vi động rất lớn trong việc xác định phân tử mục tiêu bắt đầu (ít nhất là năm bậc độ lớn). PCR định lượng thời gian thực cực kỳ chính xác và ít tốn công sức hơn các phương pháp PCR định lượng hiện tại.

Từ khóa

#PCR định lượng thời gian thực #đầu dò TaqMan #gen bản sao #nhiễm tiềm ẩn #phương pháp định lượng #tốc độ cao #phạm vi động.

Tài liệu tham khảo

1995, Use of a fluorogenic probe in a PCR-based assay for the detection of Listeria monocytogenes., App. Environ. Microbiol., 61, 3724, 10.1128/aem.61.10.3724-3728.1995

1991, Quantitative evaluation of mRNA levels., Meth. Mol. Cell. Biol., 2, 189

1993, Quantitative PCR and RT-PCR in virology., PCR Methods Applic., 2, 191, 10.1101/gr.2.3.191

1993, Increased viral burden and cytopathicity correlate temporally with CD4 + T-lymphocyte decline and clinical progression in human immunodeficiency virus type 1-infected individuals., J. Virol., 67, 1772, 10.1128/jvi.67.4.1772-1777.1993

10.1021/bi00374a001

10.1006/abio.1995.1019

1992, Quantitative or semi-quantitative PCR: Reality versus myth., PCR Methods Applic., 2, 1, 10.1101/gr.2.1.1

1995, Changes in the viral mRNA expression pattern correlate with a rapid rate of CD4 + T-cell number decline in human immunodeficiency virus type 1-infected individuals., J. Virol., 69, 2092, 10.1128/jvi.69.4.2092-2100.1995

Gibson, U.E.M., C.A. Heid, and P.M. Williams. 1996. A novel method for real time quantitative competitive RT-PCR. Genome Res. (this issue).

1990, Transient production of proteins using an adenovirus transformed cell line., DNA Prot. Engin. Tech., 2, 3

10.1038/nbt0492-413

10.1073/pnas.88.16.7276

1995, IL-13 expression at the sites of allergen challenge in patients with asthma., J. Immun., 155, 2688, 10.4049/jimmunol.155.5.2688

1995, A dominant T cell receptor beta-chain in response to a short ragweed allergen, Amb a 5., J. Immun., 154, 6157, 10.4049/jimmunol.154.11.6157

10.1016/0003-2697(90)90108-L

10.1093/nar/21.16.3761

1995, Oligonucleotides with fluorescent dyes at opposite ends provide a quenched probe system useful for detecting PCR product and nucleic acid hybridization., PCR Methods Applic., 4, 357, 10.1101/gr.4.6.357

10.1038/ng0495-341

1994, Rapid and simple PCR assay for quantitation of human immunodeficiency virus type 1 RNA in plasma: Application to acute retroviral infection., J. Clin. Microbiol., 32, 292, 10.1128/jcm.32.2.292-300.1994

10.1038/343085a0

1993, Quantitative competitive polymerase chain reaction for accurate quantitation of HIV DNA and RNA species., BioTechniques, 14, 70

10.1126/science.8096089

10.1016/0161-5890(95)00024-9

10.1101/gr.5.1.91

1980, Transcription maps of adenovirus., Methods Enzymol., 65, 750, 10.1016/S0076-6879(80)65071-X

10.1126/science.3798106

10.1016/0022-2836(75)90217-X

1994, PAF and TNF increase the precursor of NF-kappa B p50 mRNA in mouse intestine: Quantitative analysis by competitive PCR., Biochim. Biophys. Acta, 1215, 157, 10.1016/0005-2760(94)90105-8

10.1073/pnas.77.9.5201

Williams, S., C. Schwer, A. Krishnarao, C. Heid, B. Karger, and P.M. Williams. 1996. Quantitative competitive PCR: Analysis of amplified products of the HIV-1 gag gene by capillary electrophoresis with laser induced fluorescence detection. Anal. Biochem. (in press).