Định lượng vai trò của nhập cư và ngẫu nhiên trong việc hình thành cấu trúc cộng đồng prokaryote

Wiley - Tập 8 Số 4 - Trang 732-740 - 2006
William T. Sloan1, Mary Lunn2, Stephen Woodcock1, Ian M. Head3, Sean Nee4, Thomas P. Curtis3
1Department of Civil Engineering, University of Glasgow, Oakfield Avenue, Glasgow G12 8LT, UK.
2Department of Statistics, University of Oxford, 1 South Parks Road, Oxford, OX1 3TG, UK
3School of Civil Engineering and Geosciences, University of Newcastle upon Tyne, Newcastle, NE1 7RU, UK.
4Division of Biological Sciences, University of Edinburgh, West Mains Road, Edinburgh EH9 3JT, UK

Tóm tắt

Tóm tắt

Các quần thể vi khuẩn và archaea tự nhiên có vai trò quan trọng đối với sự sống trên Trái Đất và có ý nghĩa thực tiễn lớn trong y học, kỹ thuật và nông nghiệp. Tuy nhiên, các quy luật chi phối sự hình thành những cộng đồng này vẫn chưa được hiểu rõ, và cần có một mô tả toán học có thể sử dụng cho quá trình này. Thông thường, cấu trúc cộng đồng vi sinh vật được cho là bị chi phối chủ yếu bởi các yếu tố xác định như cạnh tranh và phân hóa môi trường sinh thái. Ở đây, chúng tôi chỉ ra rằng, đối với một loạt các cộng đồng prokaryote, sự phong phú tương đối và tần suất mà các taxa khác nhau được quan sát trong các mẫu có thể được giải thích bằng một mô hình cộng đồng trung lập (NCM). NCM, là một quá trình ngẫu nhiên về sinh sản, chết và nhập cư, không thể hiện rõ các yếu tố xác định và do đó không thể là một mô tả hoàn chỉnh hoặc trung thành của việc lắp ráp cộng đồng. Tuy nhiên, sự thành công của nó cho thấy rằng sự ngẫu nhiên và nhập cư là những lực lượng quan trọng trong việc hình thành các mẫu thấy được trong các cộng đồng prokaryote.

Từ khóa

#cộng đồng vi sinh vật #mô hình cộng đồng trung lập #prokaryote #nhập cư #ngẫu nhiên

Tài liệu tham khảo

10.1086/303345

10.1126/science.293.5539.2413

10.1098/rspb.2003.2550

Caswell H.(1976)Community structure: a neutral model analysis.Ecological Monographs46:327–354.

10.1016/0169-5347(89)90024-4

10.1126/science.1066854

10.1073/pnas.142680199

10.1126/science.295.5561.1835c

10.1038/23616

10.1046/j.1365-294x.1998.00318.x

10.1038/4241006a

10.1086/377190

10.1385/0-89603-566-2:139

10.1038/nature03073

10.1103/PhysRevE.68.061912

Hubbell S.P., 2001, The Unified Neutral Theory of Biodiversity and Biogeogrpahy

Kimura M., 1971, Theoretical Aspects of Population Genetics

10.1111/j.1574-6941.2001.tb00847.x

Koops H.‐P., 2003, The Prokaryotes: An Evolving Electronic Resource for the Microbial Community

10.1007/s002480000038

10.1111/j.1462-2920.2004.00616.x

Linacre C.H.(2004)Diversity and the quantification of ammonia oxidising bacteria and denitrification from turbidity maximum of estuaries.PhD Thesis. Newcastle upon Tyne: University of Newcastle upon Tyne Department of Civil Engineering and Geosciences.

10.1111/j.0030-1299.2004.12685.x

MacArthur R.H., 1967, The Theory of Island Biogeography

10.1038/nature01583

10.1016/j.tpb.2003.08.001

10.1016/j.femsec.2004.05.005

10.1128/AEM.66.12.5368-5382.2000

10.2307/1939377

10.1073/pnas.0403458101

Tilman D., 1993, Species Diversity in Ecological Communities, 13

10.1103/PhysRevE.68.061902

10.1038/nature01883

10.1016/S0958-1669(02)00315-4

10.1073/pnas.95.12.6578

10.1038/nature03211

10.1006/jtbi.1997.0491

10.1080/089106001750462669

Zwart G., 2002, Typical freshwater bacteria: an analysis of available 16S rRNA gene sequences from plankton of lakes and rivers, Aquat Microbial Ecol, 28, 141, 10.3354/ame028141

10.1128/AEM.69.10.5875-5883.2003

Thông tin
Thông tin xuất bản

Wiley

Tập 8 Số 4

732-740

Thông tin tác giả