Progress and Prospects of Pyrrole‐Imidazole Polyamide–Fluorophore Conjugates as Sequence‐Selective DNA Probes

ChemBioChem - Tập 13 Số 15 - Trang 2170-2185 - 2012
Thangavel Vaijayanthi1, Toshikazu Bando1, Ganesh N. Pandian2, Hiroshi Sugiyama1,2
1Department of Chemistry, Graduate School of Science, Kyoto University, Kitashirakawa Oiwakecho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan
2Institute for Integrated Cell-Material Sciences, Kyoto University, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502 (Japan)

Tóm tắt

AbstractRecently, the versatility of N‐methylpyrrole (Py)‐N‐methylimidazole (Im) polyamide conjugates, which have been developed from the DNA‐binding antibiotics distamycin A and netropsin, has been shown. These synthetic small molecules can permeate cells to bind with duplex DNA in a sequence‐specific manner, and hence can influence gene expression in vivo. Accordingly, several reports demonstrating the sequence specificity and biological activity of Py‐Im polyamides have accumulated. However, the benefits of Py‐Im polyamides, in particular those conjugated with fluorophores, has been overlooked. Moreover, clear directions for the employment of these attractive artificial small molecules have not yet been shown. Here, we present a detailed overview of the current and prospective applications of Py‐Im polyamide–fluorophore conjugates, including sequence‐specific recognition with fluorescence emission properties, and their potential roles in biological imaging.

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