Mối quan hệ phát sinh loài giữa các giống lợn châu Á và châu Âu xác định qua đa dạng trình tự D-loop DNA ti thể

Animal Genetics - Tập 33 Số 1 - Trang 19-25 - 2002
K I Kim1,2, Jun Heon Lee1, Kun Li3, Y W Zhang4, S‐S. Lee5, Jaime Gongora1, Chris Moran1
1Center for Advanced Technologies in Animal Genetics and Reproduction, Faculty of Veterinary Science, The University of Sydney, Sydney, NSW, Australia.,
2Department of Animal Biotechnology, Cheju National University, Cheju, South Korea
3Department of Animal Genetics and Breeding, Huazhong (Central China) Agricultural University, Wuhan, China.,
4Kun Ming Institute of Zoology, Chinese Academy of Science, Yunnan, China.,
5Cheju Agricultural Experimental Station, Cheju, South Korea

Tóm tắt

Các mối quan hệ phát sinh loài giữa các giống lợn châu Á và châu Âu đã được đánh giá bằng cách sử dụng 1036 bp của trình tự DNA ti thể (mtDNA) D-loop. Cây phân nhóm bằng phương pháp nhóm cặp không trọng số với trung bình số học (UPGMA) đã được xây dựng dựa trên khoảng cách tối đa khả năng, sử dụng các trình tự được xác định cho ba giống lợn Cheju (Hàn Quốc), 11 giống lợn Trung Quốc, một giống lợn Westran (xuất xứ từ lợn hoang Úc) và hai giống lợn châu Âu (Berkshire và Welsh), cùng với các trình tự được công bố cho bốn giống lợn Nhật Bản (bao gồm hai con lợn rừng), một giống lợn miniature Yucatan, năm giống lợn châu Âu (bao gồm Large White, Landrace, Duroc, Swedish và Wild Boar) và hai giống lợn Meishan. Trình tự DNA của con lợn collared peccary Colombia (Tayassu tajacu) cũng đã được xác định và được sử dụng như nhóm đối chứng. Phương pháp tối đa tích cực với tìm kiếm heuristic đã được sử dụng để xác định giá trị hỗ trợ bootstrap. Các giống lợn kiểu châu Á đã nhóm lại với nhau (hỗ trợ bootstrap 33%), nhưng khác với các giống lợn kiểu châu Âu cũng nhóm lại với nhau (93%). Giống lợn Westran, xuất phát từ con cháu hoang dã của các con lợn sinh sống trên đảo Kangaroo của Nam Úc, đã nhóm lại với các giống lợn châu Á, cho thấy nguồn gốc châu Á của ti thể của chúng. Giống Berkshire và Large White đã nhóm với các giống lợn châu Á, cho thấy rằng các giống lợn châu Á đã tham gia vào sự phát triển của các giống này. Các phát hiện của chúng tôi rõ ràng chỉ ra rằng lợn bản địa của Trung Quốc, Hàn Quốc và Nhật Bản chỉ mới tách biệt gần đây và hoàn toàn khác biệt so với các giống lợn kiểu châu Âu. Các giống lợn châu Âu bao gồm các con lợn có ti thể theo kiểu châu Á và không phải châu Á, một số trong đó được hình thành từ các tổ tiên mẹ có mối quan hệ gần gũi, nếu không muốn nói là từ một tổ tiên duy nhất.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

AviseJ.C.(1994)Molecular Markers Natural History and Evolution. Chapman & Hall New York.

10.1093/genetics/92.1.279

10.1111/j.1365-294X.2005.02655.x

BradleyD.G. MacHughE.E. CunninghamP. LoftusR.T.(1996)Mitochondrial diversity and origin of African and European cattle.Proceedings of the National Academy of Sciences of USA93 5131–5.

BrownW.M. GeorgeM.Jr WilsonA.C.(1979)Rapid evolution of mitochondrial DNA.Proceedings of the National Academy of Sciences of USA76 1967–71.

10.1093/genetics/106.3.479

Cooper H.M., 1954, Kangaroo Island’s wild pigs. Their possible origin, South Australian Naturalist, 28, 58

10.1007/BF01734359

Felsenstein J., 1985, Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap, Evolution, 39, 223, 10.2307/2408678

10.1086/283157

10.1007/BF00170460

10.1093/genetics/154.4.1785

Harrison R.G., 1989, Animal mitochondrial DNA as a genetic marker in population biology and evolutionary biology, Trends in Ecology and Evolution, 3, 535

10.1007/PL00006359

10.1023/A:1018763311574

JonesG.F.(1998)Genetic aspects of domestication common breeds and their origin. In:The Genetics of the Pig(ed. by M.F. Rothschild & A. Ruvinsky) pp. 17–50. CAB International Wellingford Oxon UK.

10.1111/j.1365-2052.1974.tb01309.x

10.1046/j.1365-2052.1999.00419.x

10.1007/BF02399819

LoftusR.T. MacHughD.E. BradleyD.G. SharpP.M. CunninghamP.(1994)Evidence for two independent domestications of cattle.Proceedings of National Academy of Sciences of USA91 2257–761.

Mannen H., 1998, Mitochondrial DNA variation and evolution of Japanese black cattle (Bos taurus), Genetics, 150, 1169, 10.1093/genetics/150.3.1169

10.1093/nar/16.3.1215

10.1007/BF02407018

10.1007/BF01454360

Sokal R.R., 1958, A statistical method for evaluating systematic relationships, University of Kansas Science Bulletin, 28, 1409

10.1111/j.1365-2052.1997.00108.x

SwoffordD.L.(2000)PAUP: Phylogenetic Analysis Using Parsimony version 4 beta (PPC). Smithsonian Institution Washington DC.

10.1093/nar/22.22.4673

10.1007/PL00006388

10.1126/science.1840702

10.1007/BF00499116

10.1007/BF00499094

10.1016/S0074-7696(08)62066-5

Thông tin
Thông tin xuất bản

Animal Genetics

Tập 33 Số 1

19-25

Thông tin tác giả