Phương pháp Particle mesh Ewald: Phương pháp N⋅log(N) cho các tổng Ewald trong các hệ lớn

Journal of Chemical Physics - Tập 98 Số 12 - Trang 10089-10092 - 1993
Tom Darden1, Darrin M. York1, Lee G. Pedersen1
1National Institute of Environmental Health Sciences, Research Triangle Park, North Carolina, 27709

Tóm tắt

Trình bày một phương pháp N⋅log(N) để đánh giá năng lượng tĩnh điện và các lực của các hệ thống chu kỳ lớn. Phương pháp này dựa trên nội suy các tổng Ewald trong không gian nghịch đảo và đánh giá các tích chập kết quả bằng cách sử dụng biến đổi Fourier nhanh. Thời gian thực hiện và độ chính xác được trình bày cho ba hệ tinh thể ion lớn.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

1980, Proc. R. Soc. London, Ser. A, 373, 27, 10.1098/rspa.1980.0135

1981, Proc. R. Soc. London, Ser. A, 375, 475, 10.1098/rspa.1981.0064

1989, J. Phys. Chem., 93, 7320, 10.1021/j100358a012

1987, J. Comput. Phys., 72, 156, 10.1016/0021-9991(87)90076-3

1991, J. Chem. Phys., 95, 8430, 10.1063/1.461272

1989, Phys. Rev. A, 39, 5350, 10.1103/PhysRevA.39.5350

1983, J. Comput. Chem., 4, 187, 10.1002/jcc.540040211

1987, J. Comput. Phys., 73, 325, 10.1016/0021-9991(87)90140-9

1991, J. Stat. Phys., 63, 1223, 10.1007/BF01030008

1992, Chem. Phys. Lett., 198, 89, 10.1016/0009-2614(92)90053-P

1992, J. Chem. Phys., 97, 4309, 10.1063/1.463935

1992, J. Chem. Phys., 97, 3100, 10.1063/1.462997

1992, Biochemistry, 31, 4951, 10.1021/bi00136a005

1993, Biochemistry, 32, 1143

1986, J. Comput. Chem., 7, 230, 10.1002/jcc.540070216

1981, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 78, 2179, 10.1073/pnas.78.4.2179

1989, Science, 245, 616, 10.1126/science.2548279

1990, EMBO J., 9, 2351, 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07409.x