Chuẩn hóa dữ liệu xét nghiệm khối lượng bằng các tiêu chuẩn hạt

Rachel Finck1, Erin F. Simonds2, Astraea Jager2, Smita Krishnaswamy3, Zohar Sachs2, Wendy J. Fantl2, Dana Pe’er3, Garry P. Nolan2, Sean C. Bendall2
1Baxter Laboratory in Stem Cell Biology, Department of Microbiology and Immunology, Stanford University, Stanford, California, USA.
2Baxter Laboratory in Stem Cell Biology, Department of Microbiology and Immunology, Stanford University, Stanford, California
3Department of Biological Sciences, Columbia University, New York

Tóm tắt

Tóm tắt

Xét nghiệm khối lượng sử dụng phổ khối lượng nguyên tử kết hợp với các nguyên tố báo cáo tinh khiết đồng vị để đo hiện nay tới 40 tham số trên mỗi tế bào duy nhất. Giống như bất kỳ công nghệ định lượng nào, có một nhu cầu cơ bản về các quy trình đảm bảo chất lượng và chuẩn hóa. Trong trường hợp xét nghiệm khối lượng, biến động tín hiệu theo thời gian do sự thay đổi trong hiệu suất của thiết bị kết hợp với khoảng thời gian giữa các lần bảo trì định kỳ cần phải được tính đến và sau đó chuẩn hóa. Ở đây, các mẫu đã được trộn với các hạt polystyrene nhúng kim loại lanthanide, cho phép theo dõi hiệu suất của thiết bị xét nghiệm khối lượng trong nhiều ngày thu thập dữ liệu. Quy trình được mô tả ở đây bao gồm việc đo đồng thời các hạt và tế bào trên máy xét nghiệm khối lượng, chiết xuất chữ ký dựa trên hạt, và áp dụng một thuật toán cho phép điều chỉnh cả biến động tín hiệu ngắn hạn và dài hạn. Biến động trong cường độ của các hạt còn lại sau khi chuẩn hóa cũng có thể được sử dụng để xác định chất lượng dữ liệu. Việc áp dụng thuật toán cho một phân tích theo chiều dọc kéo dài một tháng của một mẫu máu ngoại biên người đã giảm biên độ dao động tín hiệu trung vị từ 4,9 lần xuống còn 1,3 lần. © 2013 Hiệp hội Quốc tế về Phát triển Xét nghiệm tế bào

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1021/ac901049w

10.1126/science.1198704

10.1002/cyto.a.20823

10.1038/nprot.2006.250

Dendrou CA, 2009, Fluorescence intensity normalisation: Correcting for time effects in large‐scale flow cytometric analysis, Adv Bioinfo, 476106

10.1039/b921770c

10.1021/ja9052009

10.1016/j.jim.2010.07.002

10.1038/nbt.2317