Giải trình tự thế hệ mới trong thực hành chẩn đoán

medizinische genetik - 2014
Thomas Bettecken1, Arne Pfeufer2,3,4, Ralf Sudbrak5,6, Rabia Siddiqui7, André Franke8, Thomas F. Wienker9, Michael Krawczak7,10
1Aff1grid.419548.50000000094975095Max-Planck-Institut für PsychiatrieKraepelinstr. 2–1080804MünchenDeutschland
2Aff4Myriad GmbHMartinsriedDeutschland
3Aff3grid.461735.20000 0004 0436 7803Praxis für HumangenetikIsar Medizin ZentrumMünchenDeutschland
4Aff2grid.4567.00000000404832525Institut für Bioinformatik und Systembiologie Helmholtz-Zentrum MünchenDeutschland
5Aff5 grid.419538.2 0000000090710620 Abteilung Analyse des Vertebratengenoms Max-Planck-Institut für Molekulare Genetik Berlin Deutschland
6Aff6 grid.473915.d Alacris Theranostics GmbH Berlin Deutschland
7Aff7 TMF - Technologie- und Methodenplattform für die vernetzte medizinische Forschung e. V. Berlin Deutschland
8Christian-Albrechts-Universität, Kiel
9Max-Planck-Institut für Molekulare Genetik
10Aff10 grid.9764.c 0000000121539986 Institut für Medizinische Informatik und Statistik Christian-Albrechts-Universität Kiel Kiel Deutschland

Tóm tắt

Tóm tắt Giải trình tự thế hệ mới (NGS) cho phép nghiên cứu toàn bộ exome hoặc genome của một bệnh nhân với mức chi phí và thời gian hợp lý. Bước nhảy vọt chẩn đoán này, bên cạnh các khía cạnh pháp lý, đạo đức và kinh tế, còn có nhiều ảnh hưởng đến việc chăm sóc bệnh nhân. Tuy nhiên, việc áp dụng NGS rộng rãi trong chẩn đoán thường ngày hiện vẫn còn gặp nhiều trở ngại. Cụ thể, có khả năng rằng thông qua NGS, một loạt các biến thể hiếm sẽ được phát hiện ở một bệnh nhân, những biến thể này theo kiến thức hiện tại vẫn chưa thể được giải thích rõ ràng trong lâm sàng. Như một bước đầu tiên nhằm giải quyết vấn đề này, khái niệm về một cơ sở dữ liệu được giới thiệu, nhằm tích hợp một cách hệ thống thông tin kiểu gen và kiểu hình từ bối cảnh chăm sóc sức khỏe tại Đức. Nguồn tài nguyên được tạo ra sẽ không chỉ có giá trị lớn về mặt khoa học. Nó sẽ cung cấp cho các nhà gen di truyền lâm sàng sự hiện diện chứng cứ cần thiết để đánh giá đáng tin cậy dữ liệu giải trình tự liên quan đến bệnh nhân của họ.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

The 1000 Genomes Project Consortium (2012) An integrated map of genetic variation from 1,092 human genomes. Nature 491:56–65

De Ligt J, Veltman JA, Vissers LE (2013) Point mutations as a source of de novo genetic disease. Curr Opin Genet Dev 23:257–263

Hsu TC (1952) Mammalian chromosomes in vitro – the karyotype of Man. J Heredity 43:167–172

Lejeune J, Gautier M, Turpin R (1959) Etude des chromosomes somatiques de neuf enfants mongoliens. C R Hebd Seances Acad Sci 248:1721–1722

Schinzel A (1984) Catalogue of unbalanced chromosome aberrations. Walter de Gruyter & Co, Berlin

Krawczak M, Cooper DN (1997) The human gene mutation database. Trends Genet 13:121–122

Mathieu N, Löhnhardt B, Grütz R et al (2013) Ethische und rechtliche Implikationen der Speicherung humaner Genomdaten. Medizin Genet 25:278–283

Baker M (2012) One-stop shop for disease genes. Nature 491:171

Tennessen JA, Bigham AW, O’Connor TD et al (2012) Evolution and functional impact of rare coding variation from deep sequencing of human exomes. Science 337:64–69

Webb AJ, Thorisson GA, Rookes AJ, GEN2PHEN Consortium (2011) An informatics project and online „Knowledge Centre“ supporting modern genotype-to-phenotype research. Hum Mutat 32:543–550

Stein LD (2010) The case for cloud computing in genome informatics. Genome Biol 11: 207

Stellungnahme der Zentralen Ethikkommission bei der Bundesärztekammer zum Schutz nichteinwilligungsfähiger Personen in der medizinischen Forschung (1997). Dt. Ärzteblatt 94: A1011-1012 (http://www.aerzteblatt.de/pdf/94/15/a1011_5.pdf. Zugegriffen: 24. Januar 2014)

NIH seeks better database for genetic Diagnosis (2013). Science 342: 27 (http://www.sciencemag.org/content/342/6154/27.full. Zugegriffen: 24. Januar 2014)

Thông tin
Thông tin xuất bản

medizinische genetik

Thông tin tác giả