Các Retrotransposon lồng ghép trong các vùng gian gen của bộ gen ngô

American Association for the Advancement of Science (AAAS) - Tập 274 Số 5288 - Trang 765-768 - 1996
Phillip SanMiguel1, Alexander P. Tikhonov1, Young-Kwan Jin1, Natasha Motchoulskaia1, Dmitrii Zakharov1, Admasu Melake‐Berhan1, Patricia S. Springer1, Keith J. Edwards2, Michael Lee1, Zoya Avramova1, Jeffrey L. Bennetzen1
1P. SanMiguel, A. Tikhonov, Y.-K. Jin, N. Motchoulskaia, D. Zakharov, A. Melake-Berhan, P. S. Springer, M. Lee, Z. Avramova, J. L. Bennetzen, Department of Biological Sciences, Purdue University, West Lafayette, IN 47907, USA.
2K. J. Edwards, Long Ashton Research Station, Long Ashton, Bristol BS18 9AF, UK.

Tóm tắt

Cấu trúc tương đối của các gen và DNA lặp lại trong các bộ gen eukaryote phức tạp chưa được hiểu rõ. Phân tích chuỗi chẩn đoán cho thấy một vùng 280-kilobase chứa gen Adh1-F và u22 chủ yếu được hình thành từ các retrotransposon chèn vào nhau. Mười họ retroelement đã được phát hiện, với tần suất tái lặp dao động từ 10 đến 30.000 bản sao trên mỗi bộ gen đơn bội. Các retrotransposon này chiếm hơn 60% vùng Adh1-F và ít nhất 50% DNA nhân của ngô. Các yếu tố này chủ yếu còn nguyên vẹn và phân tán khắp các vùng chứa gen trong bộ gen ngô.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Flavell R. B., Bennett M. D., Smith J. B., Smith D. B., Biochem. Genet. 12, 257 (1974);

Hake S., Walbot V., Chromosoma 79, 251 (1980).

Gupta M., Shepherd N. S., Bertram I., Saedler H., EMBO J. 3, 133 (1984).

Bennetzen J. L., Schrick K., Springer P. S., Brown W. E., SanMiguel P., Genome 37, 565 (1994).

Springer P. S., Edwards K. J., Bennetzen J. L., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91, 863 (1994).

Avramova Z., SanMiguel P., Georgieva E., Bennetzen J. L., Plant Cell 7, 1667 (1995).

Grandbastien M.-A., Trends Genet. 8, 103 (1992);

Bennetzen J. L., Trends Microbiol. 4, 347 (1996).

Turcich M. P., et al., Sex. Plant Reprod. 9, 65 (1996).

Hu W., Das O. P., Messing J., Mol. Gen. Genet. 248, 471 (1995).

Shepherd N. S., et al., Nature 307, 185 (1984).

SanMiguel P. Tikhonov A. Jin Y.-K. Motchoulskaia N. Zakharov D. Melake-Berhan A. Springer P. S. Edwards K. J. Lee M. Avramova Z. Bennetzen J. L. data not shown.

Levin H. L., Mol. Cell. Biol. 15, 3310 (1995).

Avramova Z. et al. Plant J. in press.

Edwards K. J., et al., Genome 39, 811 (1996).

10.1007/BF02672069

Gatti M., Pimpinelli S., Annu. Rev. Genet. 26, 239 (1992).

Deininger P. L., Batzer M. A., Evol. Biol. 27, 157 (1993);

10.1006/jmbi.1994.0095

Wessler S. R., Bureau T. E., White S. E., Curr. Opin. Genet. Dev. 5, 814 (1995).

Smit A. F. A., Nucleic Acids Res. 21, 1863 (1993).

Kriz A. L., Boston R. S., Larkins B. A., Mol. Gen. Genet. 207, 90 (1987);

Kersanach R., et al., Nature 367, 387 (1994).

Kirihara J. A., Petri J. B., Messing J., Gene 71, 359 (1988).

Abler M. L., Scandalios J. G., Plant Mol. Biol. 22, 1031 (1993);

Allen R. L., Lonsdale D. M., Plant J. 3, 261 (1993).

Quayle T. J., Brown J. W., Feix G., Gene 80, 249 (1989);

Montoliu L., Rigau J., Puigdomenech P., Plant Mol. Biol. 14, 1 (1990).

Cresse A. D., Hulbert S. H., Brown W. E., Lucas J. R., Bennetzen J. L., Genetics 140, 315 (1995).