NT-CRISPR: Phương pháp để tiến hóa gene của Vibrio natriegens

BIOspektrum - Tập 29 - Trang 311-313 - 2023
Daniel Stukenberg1, Anke Becker1
1Zentrum für Synthetische Mikrobiologie (SYNMIKRO), Universität Marburg, Marburg, Deutschland

Tóm tắt

Với NT-CRISPR, chúng tôi đã phát triển một phương pháp hiệu quả và dễ áp dụng, cho phép chúng tôi thực hiện các thay đổi di truyền trên vi khuẩn V. natriegens. Chúng tôi tận dụng khả năng của V. natriegens trong việc tiếp nhận DNA từ môi trường thông qua quá trình biến đổi tự nhiên và tích hợp DNA này vào bộ gen của nó, cùng với công nghệ CRISPR-Cas9 để tăng tỷ lệ tế bào được thay đổi chính xác lên gần 100 phần trăm, bằng cách tiêu diệt đáng tin cậy các tế bào không thay đổi. Chúng tôi hiện đang sử dụng phương pháp này trong phòng thí nghiệm để tạo ra các chủng đã được chỉnh sửa gen – với mục tiêu là hiểu tốc độ phát triển nhanh chóng của V. natriegens.

Từ khóa

#NT-CRISPR #gene #Vibrio natriegens #công nghệ CRISPR-Cas9 #chỉnh sửa gen #biện pháp di truyền #biến đổi tự nhiên

Tài liệu tham khảo

Eagon RG (1962) Generation Time of Less Than 10 Minutes. J Bacteriol 83: 736–737 Hoff J, Daniel B, Stukenberg D, Thuronyi BW et al. (2020) Vibrio natriegens: an ultrafast-growing marine bacterium as emerging synthetic biology chassis. Environ Microbiol; 22: 4394–4408 Johnsborg O, Eldholm V, Håvarstein LS (2007) Natural genetic transformation: prevalence, mechanisms and function. Res Microbiol; 158: 767–778 Jinek M, Chylinski K, Fonfara I et al. (2012) A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity. Science; 337: 816–821 Ran FA, Hsu PD, Wright J et al. (2013) Genome engineering using the CRISPR-Cas9 system. Nat Protoc; 8: 2281–2308 Stukenberg D, Hoff J, Faber A, Becker A (2022) NT-CRISPR, combining natural transformation and CRISPR-Cas9 counterselection for markerless and scarless genome editing in Vibrio natriegens. Commun Biol; 5: 265 Yang H, Patel DJ (2017) Inhibition Mechanism of an Anti-CRISPR Suppressor AcrIIA4 Targeting SpyCas9. Mol Cell; 67: 117–127