Karyotip phân tử trong chẩn đoán di truyền
Tóm tắt
Karyotip phân tử thông qua Array-CGH ("so sánh phương pháp lai gen") và SNP-Arrays (SNP: "đột biến nucleotide đơn lẻ") cho phép nghiên cứu toàn bộ bộ gen với độ phân giải cao, nhằm phát hiện các biến đổi về số lượng bản sao (biến thể số lượng bản sao, "copy number variants", CNVs) có thể là nguyên nhân của một bệnh di truyền. Kỹ thuật này chủ yếu được sử dụng để làm rõ nguyên nhân trong các rối loạn phát triển có triệu chứng và không có triệu chứng (thần kinh) cũng như để phân loại di truyền cho các khối u. Ngoài ra, trong chẩn đoán trước sinh, karyotip phân tử cũng có thể hữu ích trong việc làm rõ nguyên nhân khi có kết quả siêu âm bất thường. Bài báo cung cấp một cái nhìn tổng quan ngắn gọn về các phương pháp cơ bản, cũng như những giới hạn và thế mạnh của chúng, đồng thời đưa ra cái nhìn về tương lai.
Từ khóa
Tài liệu tham khảo
Bruno DL et al (2011) Extending the scope of diagnostic chromosome analysis: detection of single gene defects using high-resolution SNP microarrays. Hum Mutat 32(12):1500–1506
Bruno DL et al (2011) Pathogenic aberrations revealed exclusively by single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping data in 5000 samples tested by molecular karyotyping. J Med Genet 48(12):831–839
Conlin LK et al (2010) Mechanisms of mosaicism, chimerism and uniparental disomy identified by single nucleotide polymorphism array analysis. Hum Mol Genet 19(7):1263–1275
Leeuw N de et al (2012) Diagnostic interpretation of array data using public databases and internet sources. Hum Mutat
Deak KL, Horn SR, Rehder CW (2011) The evolving picture of microdeletion/microduplication syndromes in the age of microarray analysis: variable expressivity and genomic complexity. Clin Lab Med 31(4):543–64, viii
Hanemaaijer NM et al (2012) Practical guidelines for interpreting copy number gains detected by high-resolution array in routine diagnostics. Eur J Hum Genet 20(2):161–165
Haraksingh RR et al (2011) Genome-wide mapping of copy number variation in humans: comparative analysis of high resolution array platforms. PLoS One 6(11):e27859
Miller DT et al (2010) Consensus statement: chromosomal microarray is a first-tier clinical diagnostic test for individuals with developmental disabilities or congenital anomalies. Am J Hum Genet 86(5):749–764
Morrow EM (2010) Genomic copy number variation in disorders of cognitive development. J Am Acad Child Adolesc Psychiatry 49(11):1091–1104
Schaaf CP, Wiszniewska J, Beaudet AL (2011) Copy number and SNP arrays in clinical diagnostics. Annu Rev Genomics Hum Genet 12:25–51
Su Z et al (2011) Next-generation sequencing and its applications in molecular diagnostics. Expert Rev Mol Diagn 11(3):333–343
Deutsche Gesellschaft für Humangenetik e. V., Berufsverband Deutscher Humangenetiker e. V. (2011) S2-Leitlinie Humangenetische Diagnostik. Med Genet 23:281–323
Scheinin et al. (2012) Posterpräsentation ISCO-Konferenz 2012