Nghiên cứu docking phân tử về hoạt động kháng ung thư của một số dẫn xuất s-triazin như chất ức chế HDAC6

Tóm tắt

Một loạt dẫn xuất s-triazine mới đã được thiết kế và sàng lọc hoạt động kháng ung thư in silico trên mục tiêu histone deacetylase 6 (HDAC6) bằng phương pháp docking phân tử, sử dụng AutoDock Vina. Hợp chất 12 cho thấy tương tác mạnh mẽ nhất trong số tất cả các hợp chất được thử nghiệm với giá trị ái lực là -11.3 Kcal/mol so với các thuốc tham chiếu Gedatolisib (-8.9 Kcal/mol) và Paclitaxel (-9.0 Kcal/mol) tại vị trí hoạt động của HDAC6. Đặc biệt, hợp chất 12 thiết lập các liên kết hydro mạnh và thể hiện tương tác kỵ nước tương tự như Gedatolisib và Paclitaxel tại các axit amin như SER150, LYS142, TRP261, và ALA145. Do đó, hợp chất này có thể là một phân tử dẫn đầu tiềm năng và hỗ trợ cho việc thử nghiệm thực nghiệm chống lại enzyme HDAC6 như một tác nhân kháng ung thư.

Từ khóa

#triazin #kháng ung thư #in silico #docking phân tử #HDAC6

Tài liệu tham khảo

<p>[1] P. Singla, V. Luxami, and K. Paul, “Triazine-benzimidazole hybrids: anticancer activity, DNA interaction and dihydrofolate reductase inhibitors,” Bioorg Med Chem., vol. 23(8), pp. 1691-1700, 2015.</p>

<p>[2] G. I. Aldana-Masangkay and K. M. Sakamoto, “The role of HDAC6 in cancer,” J. Biomed Biotechnol., vol. 2011, p. 875824, 2011.</p>

<p>[3] P. C. Em, L. T. Tuong Vi, L. H. Huong Ha, V. T. Bich Ngoc, B. V. Long, V. T. Thao, D. V. Duy, T. N. Ngoc Vi, N. L. Bao Khanh and N. T. Tuyen, “N,2,6-Trisubstituted 1H-benzimidazole derivatives as a new scaffold of antimicrobial and anticancer agents: Design, synthesis, in vitro evaluation, and in silico studies,” RSC Adv., vol. 13(1), pp. 399-420, 2023. DOI: 10.1039/d2ra06667j.</p>

<p>[4] P. C. Em, L. T. Tuong Vi and N. T. Tuyen, “Design, synthesis, bio-evaluation, and in silico studies of some N-substituted 6-(chloro/nitro)-1H-benzimidazole derivatives as antimicrobial and anticancer agents,” RSC Adv., vol. 12(33), pp. 21621-21646, 2022. DOI: 10.1039/d2ra03491c.</p>

<p>[5] E. C. Pham, T. N. Truong, N. H. Dong, D. D. Vo and T. T. Hong Do, “Synthesis of a series of novel 2-amino-5-substituted 1,3,4-oxadiazole and 1,3,4-thiadiazole derivatives as potential anticancer, antifungal and antibacterial agents”, Med. Chem., vol. 18, pp. 558 - 573, 2022. DOI: 10.2174/1573406417666210803170637.</p>

<p>[6] P. C. Em, L. T. Tuong Vi, T. P. Long, T. N. Huong-Giang, N. L. Bao Khanh and N. T. Tuyen, “Design, synthesis, antimicrobial evaluations and in silico studies of novel pyrazol-5(4H)-one and 1H-pyrazol-5-ol derivatives,” Arab. J. Chem., vol. 15(3), p. 103682, 2022. DOI: 10.1016/j.arabjc.2021.103682.</p>

<p>[7] P. C. Em and N. T. Tuyen, “Design, microwave-assisted synthesis, antimicrobial and anticancer evaluation, and in silico studies of some 2-naphthamide derivatives as DHFR and VEGFR-2 Inhibitors,” ACS Omega., vol. 7(37), pp. 33614-33628, 2022. DOI: 10.1021/acsomega.2c05206.</p>

Thông tin
Thông tin xuất bản
Chưa có thông tin xuất bản
Thông tin tác giả