Biến đổi trình tự DNA ti thể và mối quan hệ phát sinh loài giữa lợn Iberia và các quần thể lợn hoang dã và domesticated khác
Tóm tắt
Các trình tự nucleotide của gene cytochrome B của DNA ti thể (mtDNA) (1140 bp) và vùng điều khiển (707 bp) đã được sử dụng để xác định mối quan hệ phát sinh loài giữa 51 mẫu lợn đại diện cho các giống lợn Iberia cổ đại và hiện tại (26), lợn rừng Tây Ban Nha (bảy) và các giống lợn domesticated khác (18) từ các giống phổ biến (Duroc, Large White, Landrace, Pietrain và Meishan) và địa phương (Spotted Black Jabugo, Basque và Mangalitza). Cây phát sinh loài được xây dựng từ khoảng cách cặp cho thấy bằng chứng về nguồn gốc châu Âu của cả lợn Iberia và lợn rừng Tây Ban Nha. Sự thuần chủng của các haplotype mtDNA châu Á trong nguồn gen của giống lợn Iberia dường như không có khả năng. Bốn ước tính về sự khác biệt trong trình tự giữa các nhánh châu Âu và châu Á đã được tính toán từ hai miền chính của vùng D-loop và các sự thay thế nucleotide đồng nghĩa và không đồng nghĩa trong gene cytochrome B. Thời gian kể từ sự phân kỳ của tổ tiên lợn được ước tính khoảng 600.000 năm trước thời điểm hiện tại.
Từ khóa
#DNA ti thể #lợn Iberia #mối quan hệ phát sinh loài #haplotype #thay thế nucleotideTài liệu tham khảo
Bradley D.G., 1996, Mitochondrial diversity and the origins of African and European cattle, 5131
Epstein H., 1984, Evolution of domesticated animals, 145
Jones G.F., 1998, The genetics of the pig, 17
KumarS. TamuraK. JakobsenI.B.&NeiM.(2001)MEGA2: Molecular Evolutionary Genetics Analysis software. Arizona State University Tempe Arizona.
Li W.H., 1997, Molecular evolution
López‐Bote C., 1998, Sustained utilization of the Iberian pig breed, Meat Science, 49, S17, 10.1016/S0309-1740(98)00072-2
Nei M., 2001, Molecular Evolution and Phylogenetics
Rodrigáñez J., 2000, Alleles survival from Portuguese and Spanish strains in a population of Iberian pigs, Options Mediterranéennes, 41, 57