Biến đổi trình tự DNA ti thể và mối quan hệ phát sinh loài giữa lợn Iberia và các quần thể lợn hoang dã và domesticated khác

Animal Genetics - Tập 34 Số 5 - Trang 319-324 - 2003
E. Alves1, C. Óvilo1, M. C. Rodríguez1, L. Silió1
1Departamento de Mejora Genética Animal, INIA, Madrid, Spain

Tóm tắt

Tóm tắtCác trình tự nucleotide của gene cytochrome B của DNA ti thể (mtDNA) (1140 bp) và vùng điều khiển (707 bp) đã được sử dụng để xác định mối quan hệ phát sinh loài giữa 51 mẫu lợn đại diện cho các giống lợn Iberia cổ đại và hiện tại (26), lợn rừng Tây Ban Nha (bảy) và các giống lợn domesticated khác (18) từ các giống phổ biến (Duroc, Large White, Landrace, Pietrain và Meishan) và địa phương (Spotted Black Jabugo, Basque và Mangalitza). Cây phát sinh loài được xây dựng từ khoảng cách cặp cho thấy bằng chứng về nguồn gốc châu Âu của cả lợn Iberia và lợn rừng Tây Ban Nha. Sự thuần chủng của các haplotype mtDNA châu Á trong nguồn gen của giống lợn Iberia dường như không có khả năng. Bốn ước tính về sự khác biệt trong trình tự giữa các nhánh châu Âu và châu Á đã được tính toán từ hai miền chính của vùng D-loop và các sự thay thế nucleotide đồng nghĩa và không đồng nghĩa trong gene cytochrome B. Thời gian kể từ sự phân kỳ của tổ tiên lợn được ước tính khoảng 600.000 năm trước thời điểm hiện tại.

Từ khóa

#DNA ti thể #lợn Iberia #mối quan hệ phát sinh loài #haplotype #thay thế nucleotide

Tài liệu tham khảo

Bradley D.G., 1996, Mitochondrial diversity and the origins of African and European cattle, 5131

Epstein H., 1984, Evolution of domesticated animals, 145

10.1093/genetics/154.4.1785

Jones G.F., 1998, The genetics of the pig, 17

10.1007/s002390010158

10.1046/j.1365-2052.2002.00784.x

KumarS. TamuraK. JakobsenI.B.&NeiM.(2001)MEGA2: Molecular Evolutionary Genetics Analysis software. Arizona State University Tempe Arizona.

Li W.H., 1997, Molecular evolution

López‐Bote C., 1998, Sustained utilization of the Iberian pig breed, Meat Science, 49, S17, 10.1016/S0309-1740(98)00072-2

10.1073/pnas.091591198

10.1111/j.1365-294X.2006.02908.x

Nei M., 2001, Molecular Evolution and Phylogenetics

10.1007/PL00006487

Rodrigáñez J., 2000, Alleles survival from Portuguese and Spanish strains in a population of Iberian pigs, Options Mediterranéennes, 41, 57

10.1016/S0378-1119(97)00404-6

10.1046/j.1523-1739.2000.99322.x

10.1023/A:1019921131171

10.1007/PL00006388

10.1046/j.1365-294x.1999.00729.x

Thông tin
Thông tin xuất bản

Animal Genetics

Tập 34 Số 5

319-324

Thông tin tác giả