Phân tích proteom không gắn nhãn LC-MS/MS cho việc phát hiện biomarker quy mô lớn trong các mẫu phức tạp

Journal of Separation Science - Tập 30 Số 14 - Trang 2198-2203 - 2007
Yishai Levin1, Emanuel Schwarz1, Lan Wang1, F. Markus Leweke2, Sabine Bahn
1Institute of Biotechnology, University of Cambridge, Cambridge, UK. Fax: +44-1223-33416
2Department of Psychiatry and Psychotherapy, University of Cologne, Cologne, Germany

Tóm tắt

Tóm tắt

Các nền tảng proteom cho phép các nhà nghiên cứu phân tích một số lượng lớn protein qua nhiều bộ mẫu phức tạp cho thấy tiềm năng lớn trong việc phát hiện biomarker. Các phương pháp dựa trên LC-MS/MS có thể được sử dụng để phân tích nhiều mẫu mà không cần phải gắn nhãn protein. Vì phân tích là một quá trình tuần tự, hiệu suất của hệ thống cần phải nhất quán trong suốt toàn bộ thí nghiệm. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã sử dụng một bộ mẫu huyết thanh spiked cũng như một bộ 55 mẫu huyết thanh lâm sàng từ các bệnh nhân tâm thần phân liệt và tình nguyện viên khỏe mạnh để chỉ ra rằng phương pháp proteom không gắn nhãn cung cấp kết quả tái lập được qua một số lượng mẫu lớn và có thể được sử dụng để đo lường chính xác độ phong phú tương đối của protein. Sử dụng phương pháp này, chúng tôi đã xác định 1709 protein huyết thanh bao phủ một phạm vi động hơn ba bậc độ lớn. Chúng tôi tin rằng proteomics định lượng không gắn nhãn đặc biệt phù hợp cho việc phát hiện biomarker trong các bộ mẫu lớn.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1016/j.ymeth.2004.08.020

10.1021/pr050406g

10.1074/mcp.M600162-MCP200

10.1002/prca.200600771

10.1038/85686

10.1021/pr034015i

10.1074/mcp.M300069-MCP200

10.1021/ac026468x

10.1074/mcp.M500084-MCP200

10.1002/(SICI)1097-0231(19980615)12:11<695::AID-RCM220>3.0.CO;2-2

10.1021/pr025517j

10.1002/(SICI)1097-0231(19990730)13:14<1427::AID-RCM662>3.0.CO;2-5

10.1089/neu.2006.0079

10.1016/j.jchromb.2006.10.069

10.1021/ac034869m

10.1021/ac030096q

10.1038/nbt1183