Ức chế phosphatase kiềm hoạt động lạnh bởi imipenem được hé lộ thông qua mô hình in silico các vị trí hoạt động của metallo‐β‐lactamase

FEBS Letters - Tập 586 - Trang 3710-3715 - 2012
Sandeep Chakraborty1, Bjarni Ásgeirsson2, Renu Minda3, Lipika Salaye1, Jean-Marie Frère3, Basuthkar J. Rao1
1Department of Biological Sciences, Tata Institute of Fundamental Research, Homi Bhabha Road, Mumbai 400 005, India
2Science Institute, Department of Biochemistry, University of Iceland, Dunhaga 3, IS-107 Reykjavik, Iceland
3Centre for Protein Engineering, Université de Liège, Institut de Chimie B6, Sart Tilman, B-4000 Liège, Belgium

Tóm tắt

Chúng tôi chứng minh sự ức chế hoạt động phosphatase nguyên sinh của phosphatase kiềm hoạt động lạnh từ Vibrio (VAP) (IC50 là 44 ± 4 (n = 4) μM ở pH 7.0 sau 30 phút tiền ủ) bởi một hợp chất β‐lactam đặc hiệu (chỉ do imipenem, và không phải do ertapenem, meropenem, ampicillin hay penicillin G). Khung đồng hình đã được phát hiện thông qua phân tích in silico thiết lập sự tương thích không gian và điện tĩnh của vị trí hoạt động của metallo‐β‐lactamase Class B2 CphA từ Aeromonas hydrophila với vị trí hoạt động của VAP. Các hợp chất β‐lactam đã thử nghiệm không ức chế Escherichia coli hay phosphatase kiềm tôm, điều này có thể được quy cho sự tương thích thấp hơn được chỉ ra bởi CLASP. Không có hoạt tính β‐lactamase nào có thể nhận thấy trong các phosphatase kiềm đã thử nghiệm. Đây là lần đầu tiên một khung nhận biết imipenem trong phosphatase kiềm (VAP) được chỉ ra.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1016/j.mib.2005.08.016 10.1039/a705983c 10.1016/S1473-3099(10)70168-7 10.1098/rstb.1980.0049 10.1128/AAC.01009-09 10.1086/514922 10.1016/j.bcp.2007.05.021 10.1016/j.bcp.2005.11.012 10.1128/CMR.00037-09 10.1021/jm9012938 10.1128/AAC.41.2.223 10.1128/AAC.48.7.2347-2349.2004 10.1128/AAC.49.7.2778-2784.2005 10.1371/journal.pone.0028470 10.1073/pnas.0903951107 10.1128/AAC.00288-09 10.1016/j.bbapap.2008.09.020 10.1021/ja00023a048 10.1021/ja00098a002 10.1007/s00775-008-0407-2 10.1093/jac/12.suppl_D.1 10.1073/pnas.181342398 10.1093/nar/gkh381 10.1101/gr.361602 10.1016/S0168-9525(00)02024-2 10.1146/annurev.mi.45.100191.000345 10.1126/science.7761829 10.1002/bip.20877 10.1002/jcc.540120405 10.1006/jmbi.1998.2393 10.1111/j.1742-4658.2009.06996.x 10.1046/j.1432-1327.1999.00664.x 10.1093/clinids/24.Supplement_2.S266 10.1128/AAC.39.7.1629 10.1039/P29800001725 Bauvois S., 2012, Are there unknown classes of β-lactamases? Sensitivity of β-lactams to nucleophilic agents and other enzymes, β-Lactamases, 507 10.1099/13500872-141-11-2897 10.1021/ja983390m 10.1016/j.jinorgbio.2008.05.007 10.1126/science.1118953 10.1021/bi9010539 10.1002/pro.284 10.1016/j.jmb.2005.04.044 10.1073/pnas.0400664101 10.1021/ja8047943 10.1002/anie.200604205 10.1007/s00792-011-0404-1 10.1046/j.1432-1327.2002.02815.x 10.1016/j.jmb.2008.12.001 10.1042/bj3300581
Thông tin
Thông tin xuất bản

FEBS Letters

Tập 586

3710-3715

Thông tin tác giả