Thông tin về Quyết định Điều Trị Kháng Sinh: Đánh giá Các Phương Pháp Chẩn Đoán Phân Tử Nhanh Để Xác Định Tính Nhạy Cảm và Kháng Carbapenem Đối Với Loài Acinetobacter spp. Trong PRIMERS III

Journal of Clinical Microbiology - Tập 55 Số 1 - Trang 134-144 - 2017
Scott Evans1, Andrea M. Hujer2,3, Hongyu Jiang1, Carol Hill4, Kristine M. Hujer2,3, José R. Mediavilla5, Claudia Manca5, Thuy Tien T. Tran1, Tatiana Domitrovic2,3, Paul G. Higgins6,7, Harald Seifert6,7, Barry N. Kreiswirth5, Robin Patel8, Michael R. Jacobs9, Liang Chen5, Rangarajan Sampath10, Thomas A. Hall10, Christine Marzan10, Vance G. Fowler11,4, Henry F. Chambers12, Robert A. Bonomo2,13,3
1Center for Biostatistics in AIDS Research and the Department of Biostatistics, Harvard University, Boston, Massachusetts, USA
2Department of Medicine, Case Western Reserve University School of Medicine, Cleveland, Ohio, USA
3Louis Stokes Cleveland Department of Veterans Affairs Medical Center, Cleveland, Ohio, USA
4Duke Clinical Research Institute, Duke University Medical Center, Durham, North Carolina USA
5Public Health Research Institute Center, New Jersey Medical School-Rutgers University, Newark, New Jersey, USA
6German Center for Infection Research (DZIF), partner site Bonn–Cologne, Germany
7Institute for Medical Microbiology, Immunology and Hygiene, University of Cologne, Cologne, Germany
8Division of Clinical Microbiology, Department of Laboratory Medicine and Pathology, Mayo Clinic, Rochester, Minnesota, USA
9Department of Pathology, Case Western Reserve University School of Medicine, Cleveland, Ohio., USA
10IBIS Biosciences Inc., an Abbott Company, Carlsbad, California, USA
11Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Duke University Medical Center, Durham, North Carolina, USA
12University of California, San Francisco General Hospital, San Francisco, California, USA
13Departments of Pharmacology, Molecular Biology and Microbiology, Biochemistry, and Proteomics and Bioinformatics, Case Western Reserve University School of Medicine, Cleveland, Ohio, USA

Tóm tắt

TÓM TẮT

Sự phát tán rộng rãi của các loài Acinetobacter kháng carbapenem đã tạo ra những thách thức điều trị đáng kể. Hiện tại, các xét nghiệm chẩn đoán phân tử nhanh (RMD) có khả năng xác định kiểu hình này chưa có sẵn trên thị trường. Hai nền tảng RMD, gồm PCR kết hợp với phân tích khối phổ ion hóa điện phun (PCR/ESI-MS) và đèn phát quang phân tử (MB), đã được đánh giá để phát hiện các gen liên quan đến tính kháng/cảm với carbapenem trong Acinetobacter spp. Một bộ sưu tập bao gồm 200 mẫu phân lập bệnh lý của các loài Acinetobacter đã được thử nghiệm. Các giá trị dự đoán cho tính nhạy cảm và kháng đã được ước lượng dựa trên tỷ lệ hiện hữu của tính nhạy cảm, và căn cứ vào sự vắng mặt hoặc sự hiện diện của các gen beta-lactamase ( bla ) NDM, VIM, IMP, KPC, và OXA carbapenemase (ví dụ, bla OXA-23 , bla OXA-24/40 , và bla OXA-58 được tìm thấy trong nghiên cứu này) so với tiêu chuẩn tham chiếu của các xác định MIC. Theo cách diễn giải các giá trị MIC, 49% ( n = 98) các mẫu phân lập đã kháng lại carbapenem (được xác định bằng kháng hoặc kháng trung gian với imipenem). Tính nhạy cảm đối với imipenem (khoảng tin cậy 95% [CI]) đạt 82% (74%, 89%) và 92% (85%, 97%) cho PCR/ESI-MS và MB, tương ứng. Tính nhạy cảm đối với kháng imipenem (khoảng tin cậy 95% [CI]) đạt 95% (88%, 98%) và 88% (80%, 94%) cho PCR/ESI-MS và MB, tương ứng. PRIMERS III thiết lập rằng các RMD có thể phân biệt giữa kháng và nhạy cảm carbapenem trong Acinetobacter spp. Trong bối cảnh có tỷ lệ kháng đã biết, SPV và RPV có thể cung cấp thông tin cho các bác sĩ lâm sàng về lựa chọn tốt nhất cho liệu pháp kháng sinh thực nghiệm chống lại tác nhân kháng thuốc đa dạng này.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1093/cid/civ837

10.1128/AAC.01464-06

10.1155/2016/7318075

10.1586/14787210.6.3.269

10.1016/S1473-3099(08)70279-2

10.1016/j.ijantimicag.2015.11.006

10.1128/AAC.01663-08

10.1093/jac/dks382

10.1128/AAC.00778-06

10.1093/jac/dkq191

10.1016/j.ajic.2009.05.007

CLSI. 2014. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing; 24th informational supplement. CLSI document M100-S24. Clinical and Laboratory Standards Institute, Wayne, PA.

10.1016/j.diagmicrobio.2008.12.012

10.1128/JCM.01588-10

10.1016/j.ijantimicag.2009.10.014

10.1128/AAC.02413-12

10.1016/j.ijantimicag.2006.01.004

10.1128/JCM.01765-10

10.1111/j.1469-0691.2007.01819.x

10.1093/jac/dkt480

10.1016/j.ijmm.2012.12.007