Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Nhận diện protein mô qua phân tích axit amin sau khi tinh sạch bằng điện di hai chiều
Tóm tắt
Protein trong não chuột đã được tách ra bằng phương pháp điện di hai chiều (2-DE). Các protein từ một phần của mẫu 2-DE đã được chuyển lên màng ưa nước và 43 trong số chúng đã được cắt ra và thủy phân bằng phương pháp thủy phân pha lỏng. Thành phần axit amin của các protein này được xác định bằng phương pháp derivat hóa orthophthaldialdehyde tiền cột và so sánh với các thành phần của các protein đã biết được lưu trữ trong cơ sở dữ liệu trình tự NBRF. Một chương trình nhận diện mang tên ASA đã được phát triển cho mục đích này. Chương trình ASA bao gồm các yếu tố điều chỉnh và trọng số, giảm dữ liệu theo các cửa sổ trọng lượng phân tử, và loại trừ hoặc bao gồm một số sinh vật theo yêu cầu. Làm mẫu kiểm soát, tám protein thử nghiệm và năm protein nổi tiếng từ não chuột, tất cả đều được tách ra bằng phương pháp 2-DE, đã được chương trình xác định chính xác. Trong số 43 protein não được chọn, 19 đã được xác định với độ tin cậy cao.
Từ khóa
#Protein não chuột #điện di hai chiều #phân tích axit amin #chương trình ASA #xác định protein.Tài liệu tham khảo
Aebersold, R., Teplow, D., Hood, L. E., and Kent, S. B. H. (1986).J. Biol. Chem. 261, 4229–4238.
Aebersold, R. H., Leavitt, J., Saavedra, R. A., Hood, L. E., and Kent, S. B. H. (1987).Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 6970–6974.
Aebersold, R., and Leavitt, J. (1990).Electrophoresis 11, 517–527.
Anderson, N. L., Nance, S. L., Pearson, T. W., and Anderson, N. G. (1982).Electrophoresis 3, 135–142.
Ashman, K., and Bosserhoff, A. (1985). InModern Methods in Protein Chemistry—Review Articles (Tschesche, H., ed.), Walter de Gruyter, Berlin, Vol. 2, pp. 155–171.
Bauw, G., Van Damme, J., Puype, M., Vandekerckhove, J., Gesser, B., Ratz, G. P., Lauridsen, J. B., and Celis, J. E. (1989).Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 7701–7705.
Chang, J. Y., Knecht, R., and Braun, D. G. (1983).Methods Enzymol. 91, 41–48.
Eckerskorn, C., Jungblut, P., Mewes, W., Klose, J., and Lottspeich, F. (1988a).Electrophoresis 9, 830–838.
Eckerskorn, C., Mewes, W., Goretzki, H., and Lottspeich, F. (1988b).Eur. J. Biochem. 176, 509–519.
Eckerskorn, C., and Lottspeich, F. (1989).Chromatographia 28, 92–94.
Einarsson, S., Josefsson, B., and Lagerkvist, S. (1983).J. Chromatogr. 282, 609–618.
Hirano, H., and Watanabe, T. (1990).Electrophoresis 1, 573–580.
Jungblut, P., Choli, T., and Wittmann-Liebold, B. (1989).Biol. Chem. Hoppe-Seyler 370, 775.
Jungblut, P., Eckerskorn, C., Lottspeich, F., and Klose, J. (1990).Electrophoresis 11, 581–588.
Jungblut, P.et al., in preparation (1992).
Kennedy, T. E., Gawinowicz, M. A., Barzilai, A., Kandel, E. R., and Sweat, J. D. (1988).Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 7008–7012.
Klose, J. (1975).Humangenetik 26, 231–243.
Klose, J. (1983). InModern Methods in Protein Chemistry—Review Articles (Tschesche, H., ed.), Walter de Gruyter, Berlin, pp. 49–78.
Laemmli, U. K. (1979).Nature 227, 680–685.
Matsudaira, P. (1987).J. Biol. Chem. 262, 10,035–10,038.
Ozols, J. (1990).Methods in Enzymol. 182, 587–601.
Peterson, G. L. (1977).Anal. Biochem. 83, 346–356.
Sibbald, P. R., Sommerfeldt, H., and Argos, P. (1991).Anal. Biochem. 198, 330–333.
Tous, G. I., Fausnaugh, J. L., Akinyosoye, O., Lackland, H., Winter-Cash, P., Vitorica, F. J., and Stein, S. (1989).Anal. Biochem. 179, 50–55.
Turnell, D. C., and Cooper, J. D. H. (1982).Clin. Chem. 28, 527–531.
Ui, N. (1971).Biochim. Biophys. Acta 229, 567–581.
Vandekerckhove, J., Bauw, G., Puype, M., Van Damme, J., and Van Montagu, M. (1985).Eur. J. Biochem. 152, 9–19.
Walsh, M., McDougall, J., and Wittmann-Liebold, B. (1988).Biochemistry 27, 6867–6876.
Watanabe, Y., and Imai, K. (1981).Anal. Biochem. 136, 471–474.