Xác định một dấu hiệu sinh học nước bọt mới miR‐143‐3p cho chẩn đoán bệnh nha chu: Một nghiên cứu chứng minh khái niệm

Mặc dù việc sử dụng miRNA trong nước bọt như các dấu hiệu sinh học tiềm năng đã được báo cáo trong một số bệnh/điều kiện như viêm khớp dạng thấp và ung thư miệng, chưa có nghiên cứu nào báo cáo về tính hữu dụng của chúng trong chẩn đoán bệnh nha chu. Do đó, mục tiêu của nghiên cứu này là xác định miRNA trong nước bọt và tìm ra dấu hiệu sinh học miRNA trong nước bọt phù hợp nhất cho bệnh nha chu mãn tính.

Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã khám phá ứng dụng tiềm năng của công nghệ giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) để xác định miRNA trong hai mẫu nước bọt không được kích thích thu thập bằng phương pháp nhỏ giọt thụ động từ một bệnh nhân được chẩn đoán mắc bệnh nha chu mãn tính tổng quát và một người kiểm soát khỏe mạnh. Sau đó, việc xác thực miRNA đã biết có mức biểu hiện cao nhất trong bệnh nha chu đã được thực hiện trên các mẫu nước bọt thu thập từ một tập hợp độc lập gồm 16 bệnh nhân nha chu mãn tính và 16 người kiểm soát khỏe mạnh về nha chu bằng phương pháp PCR định lượng theo thời gian thực (qRT‐PCR). Dự đoán gen mục tiêu và lập bản đồ con đường được thực hiện bằng các công cụ tin sinh học.

Phân tích NGS đã xác định 40 miRNA được điều chỉnh tăng và 40 miRNA được điều chỉnh giảm trong bệnh nha chu mãn tính so với nhóm kiểm soát khỏe mạnh, trong đó miR‐143‐3p là miRNA có mức biểu hiện cao nhất trong bệnh nha chu (Số đọc – 227630; thay đổi gấp – 5.82). Việc xác thực bằng qRT‐PCR cho thấy sự điều chỉnh tăng đáng kể biểu hiện miR‐143‐3p trong nhóm thử nghiệm so với nhóm kiểm soát (P < 0.05). Gen K‐RAS (gen oncogen virus sarcoma chuột Kirsten V‐Ki‐ras2) được dự đoán là gen mục tiêu cho miR‐143‐3p ở người. Lập bản đồ con đường KEGG (Từ điển Kyoto về gen và bộ gen) cho thấy sự tham gia của K‐RAS trong con đường kinase protein hoạt hóa bởi miogen (MAPK).

Việc ứng dụng NGS cho việc xác định biểu hiện miRNA có thể được coi là một công cụ quý giá trong việc phát hiện các dấu hiệu sinh học mới trong chẩn đoán nha chu. Ngoài ra, kết quả của nghiên cứu chỉ ra tính hữu dụng tiềm năng của miR‐143‐3p như một dấu hiệu sinh học nước bọt mới cho bệnh nha chu mãn tính.