Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Xác định một nidovirus mới trong một đợt bùng phát bệnh đường hô hấp chết người ở trăn ngọc (Python regius)
Tóm tắt
Nhiễm trùng đường hô hấp là nguyên nhân quan trọng gây morbidit và tử vong ở bò sát; tuy nhiên, các tác nhân gây bệnh chỉ hiếm khi được xác định. Viêm phổi, viêm khí quản và viêm thực quản đã được báo cáo trong một bộ sưu tập trăn ngọc (Python regius). Tám trong số 12 con rắn có dấu hiệu viêm phổi do vi khuẩn. Phân tích gen tổng thể thông qua phương pháp giải trình tự sinh học cho thấy sự hiện diện của một nidovirus mới từ các mẫu lấy từ phổi, thực quản và lá lách. Kỹ thuật PCR cho thấy sự hiện diện của RNA virus trong phổi, khí quản, thực quản, gan và lá lách. Phương pháp lai phân tử in situ xác nhận sự hiện diện của axit nucleic virus trong tế bào, nội bào trong phổi của những con rắn bị nhiễm. Phân tích phát sinh chủng loại dựa trên một đoạn polypeptide dài 1.136 axit amin cho thấy virus này có thể đại diện cho một loài mới trong phân họ Torovirinae. Báo cáo về một nidovirus mới ở trăn ngọc này có thể cung cấp cái nhìn sâu sắc về cơ chế bệnh sinh của bệnh đường hô hấp ở loài này và nâng cao hiểu biết của chúng ta về sự đa dạng của các nidovirus.
Từ khóa
#nidovirus #trăn ngọc #bệnh đường hô hấp #viêm phổi #viêm khí quản #viêm thực quản #phân tích phát sinh chủng loạiTài liệu tham khảo
Cavanagh D: Nidovirales: a new order comprising Coronaviridae and Arteriviridae. Arch Virol 1997, 142: 629-633.
Cowley JA, Dimmock CM, Spann KM, Walker PJ: Gill-associated virus of Penaeus monodon prawns: an invertebrate virus with ORF1a and ORF1b genes related to arteri- and coronaviruses. J Gen Virol 2000, 81: 1473-1484.
Lauber C, Ziebuhr J, Junglen S, Drosten C, Zirkel F, Nga PT, Morita K, Snijder EJ, Gorbalenya AE: Mesoniviridae: a proposed new family in the order Nidovirales formed by a single species of mosquito-borne viruses. Arch Virol 2012, 157: 1623-1628. 10.1007/s00705-012-1295-x
Snijder EJ, Horzinek MC, Spaan WJ: The coronaviruslike superfamily. Adv Exp Med Biol 1993, 342: 235-244.
Cowley JA, Dimmock CM, Walker PJ: Gill-associated nidovirus of Penaeus monodon prawns transcribes 3-coterminal subgenomic mRNAs that do not possess 5-leader sequences. J Gen Virol 2002, 83: 927-935.
Pasternak AO, Spaan WJ, Snijder EJ: Nidovirus transcription: how to make sense…? J Gen Virol 2006, 87: 1403-1421. 10.1099/vir.0.81611-0
Sittidilokratna N, Dangtip S, Cowley JA, Walker PJ: RNA transcription analysis and completion of the genome sequence of yellow head nidovirus. Virus Res 2008, 136: 157-165. 10.1016/j.virusres.2008.05.008
Walker PJ, Bonami JR, Boonsaeng V, Chang PS, Cowley JA, Enjuanes L, Flegel TW, Lightner DV, Loh PC, Snijder EJ, Tang K: Virus Taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses. Eighth Report of the International Committee for Taxonomy of Viruses. Edited by: Fauquet CM, Mayo MA, Maniloff J, Desselberger U, Ball LA. San Diego: Academic; 2005:937-979.
Siddell S, Snijder EJ: An Introduction to Nidoviruses. In Nidoviruses. Edited by: Perlman S, Gallagher T, Snijder EJ. Washington, DC: American Society for Microbiology; 2008:1-13.
Gaedke K, Zurbriggen A, Baumgärtner W: In vivo and in vitro detection of canine distemper virus nucleoprotein gene with digoxigenin-labelled RNA, double-stranded DNA probes and oligonucleotides by in situ hybridization. Zentralblatt fur Veterinarmedizin Reihe B J Vet Med 1997, 44: 329-340.
Zirkel F, Kurth A, Quan PL, Briese T, Ellerbrok H, Pauli G, Leendertz FH, Lipkin WI, Ziebuhr J, Drosten C, Junglen S: An insect nidovirus emerging from a primary tropical rainforest. mBio 2011,2(3):e00077-11.
Marschang RE: Viruses Infecting Reptiles. Viruses 2011,3(11):2087-2126. Published online 2011 November 1. doi: 10.3390/v3112087
Jacobson ER, Gaskin JM, Roelke M, Greiner EC, Allen J: Conjunctivitis, tracheitis, and pneumonia associated with herpesvirus infection in green sea turtles. J Am Vet Med Assoc 1986,189(9):1020-1023.
Westhouse RA, Jacobson ER, Harris RK, Winter KR, Homer BL: Respiratory and pharyngo-esophageal iridovirus infection in a gopher tortoise (Gopherus polyphemus). J Wildl Dis 1996,32(4):682-686. 10.7589/0090-3558-32.4.682
Jacobson ER, Gardiner CH: Adeno-like virus in esophageal and tracheal mucosa of a Jackson’s chameleon (Chamaeleo jacksoni). Vet Pathol 1990,27(3):210-212. 10.1177/030098589002700313
Jacobson ER: From Viruses and Viral Diseases of Reptiles. In Infectious Diseases and Pathology in Reptiles: Color Atlas and Text. 1st edition. Boca Raton: CRC Press/Taylor & Frances Group; 2007:413.
Jacobson ER, Adams HP, Geisbert TW, Tucker SJ, Hall BJ, Homer BL: Pulmonary lesions in experimental ophidian paramyxovirus pneumonia of Aruba Island rattlesnakes, Crotalus unicolor. Vet Pathol 1997,34(5):450-459. 10.1177/030098589703400509
Lamirande EW, Nichols DK, Owens JW, Gaskin JM, Jacobson ER: Isolation and experimental transmission of a reovirus pathogenic in ratsnakes (Elaphe species). Virus Res 1999,63(1–2):135-141.
Homer BL, Sundberg JP, Gaskin JM, Schumacher J, Jacobson ER: Immunoperoxidase detection of ophidian paramyxovirus in snake lung using a polyclonal antibody. J Vet Diagn Invest 1995,7(1):72-77. 10.1177/104063879500700111
Orós J, Sicilia J, Torrent A, Castro P, Déniz S, Arencibia A, Jacobson ER, Homer BL: Immunohistochemical detection of ophidian paramyxovirus in snakes in the Canary Islands. Vet Rec 2001,149(1):21-23. 10.1136/vr.149.1.21
Sand MA, Latimer KS, Gregory CR, Rakich PM, Jacobson ER, Pennick KE: Molecular diagnosis of paramyxovirus infection in snakes using reverse transcriptase-polymerase chain reaction and complementary deoxyribonucleic acid:ribonucleic acid in situ hybridisation. J Vet Diagn Invest 2004, 16: 442-448. 10.1177/104063870401600514
Radford AD, Coyne KP, Dawson S, Porter CJ, Gaskell RM: Feline calicivirus. Vet Res 2007,38(2):319-335. Epub 2007 Feb 13 10.1051/vetres:2006056
Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S: MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol 2011, 28: 2731-2739. 10.1093/molbev/msr121
Batts WN, Goodwin AE, Winton JR: Genetic analysis of a novel nidovirus from fathead minnows. J Gen Virol 2012, 93: 1247-1252. 10.1099/vir.0.041210-0