Hiệu suất tốt của tiêu chí của Hội đồng Y khoa di truyền và Genomics Hoa Kỳ/Hiệp hội GiPath học phân tử trong việc dự đoán khả năng gây bệnh của các biến thể di truyền gây ra phình đại động mạch chủ ngực và tách mạch
Tóm tắt
Sự xác định các biến thể gây bệnh ở bệnh nhân mắc chứng phình động mạch chủ ngực và tách mạch (TAAD) trước đây được tìm thấy là một chỉ số quan trọng chỉ ra nhu cầu can thiệp phẫu thuật sớm hơn. Để đánh giá các phương pháp có sẵn trong việc phân loại các biến thể di truyền đã được xác định, chúng tôi đã so sánh sự sống sót không có sự kiện trong một nhóm bệnh nhân TAAD được phân loại là kiểu gen dương tính và kiểu gen âm tính theo tiêu chí của Hội đồng Y khoa di truyền và Genomics Hoa Kỳ và Hiệp hội GiPath học phân tử (ACMG-AMP) hoặc theo cơ sở dữ liệu ClinVar.
Chúng tôi đã phân tích một nhóm bệnh nhân chưa được báo cáo trước đây gồm 132 bệnh nhân được kiểm tra trong môi trường lâm sàng thông thường để phát hiện các biến thể di truyền trong một bộ gen tùy chỉnh gồm 30 gen liên quan đến TAAD hoặc bộ gen thương mại TruSight Cardio gồm 174 gen liên quan đến bệnh tim. Các biến thể được xác định đã được phân loại sử dụng nền tảng VarSome. Các đường cong sống sót Kaplan-Meier đã được xây dựng để so sánh sự sống sót không có sự kiện giữa các đối tượng được xác định là 'kiểu gen dương tính' và 'kiểu gen âm tính' bằng cách sử dụng các phân loại khác nhau để so sánh hiệu suất của chúng.
Từ khóa
Tài liệu tham khảo
Ostberg NP, Zafar MA, Ziganshin BA, Elefteriades JA. The genetics of thoracic aortic aneurysms and dissection: a clinical perspective. Biomolecules. 2020. https://doi.org/10.3390/biom10020182.
Pinard A, Jones GT, Milewicz DM. Genetics of thoracic and abdominal aortic diseases. Circ Res. 2019;124(4):588–606.
Erbel R, Aboyans V, Boileau C, Bossone E, Bartolomeo RD, Eggebrecht H, et al. 2014 ESC Guidelines on the diagnosis and treatment of aortic diseases: Document covering acute and chronic aortic diseases of the thoracic and abdominal aorta of the adult. The Task Force for the Diagnosis and Treatment of Aortic Diseases of the European Society of Cardiology (ESC). Eur Heart J. 2014;35(41):2873–926.
Hiratzka LF, Bakris GL, Beckman JA, Bersin RM, Carr VF, Casey DE Jr, et al. 2010 ACCF/AHA/AATS/ACR/ASA/SCA/SCAI/SIR/STS/SVM guidelines for the diagnosis and management of patients with Thoracic Aortic Disease: a report of the American College of Cardiology Foundation/American Heart Association Task Force on Practice Guidelines, American Association for Thoracic Surgery, American College of Radiology, American Stroke Association, Society of Cardiovascular Anesthesiologists, Society for Cardiovascular Angiography and Interventions, Society of Interventional Radiology, Society of Thoracic Surgeons, and Society for Vascular Medicine. Circulation. 2010;121(13):e266-369.
Ziganshin BA, Bailey AE, Coons C, Dykas D, Charilaou P, Tanriverdi LH, et al. Routine genetic testing for thoracic aortic aneurysm and dissection in a clinical setting. Ann Thorac Surg. 2015;100(5):1604–11.
Kuzmik GA, Sang AX, Elefteriades JA. Natural history of thoracic aortic aneurysms. J Vasc Surg. 2012;56(2):565–71.
Poninska JK, Bilinska ZT, Franaszczyk M, Michalak E, Rydzanicz M, Szpakowski E, et al. Next-generation sequencing for diagnosis of thoracic aortic aneurysms and dissections: diagnostic yield, novel mutations and genotype phenotype correlations. J Transl Med. 2016;14(1):115.
Richards S, Aziz N, Bale S, Bick D, Das S, Gastier-Foster J, et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015;17(5):405–24.
Loeys BL, Dietz HC, Braverman AC, Callewaert BL, De Backer J, Devereux RB, et al. The revised Ghent nosology for the Marfan syndrome. J Med Genet. 2010;47(7):476–85.
Freed LA, Benjamin EJ, Levy D, Larson MG, Evans JC, Fuller DL, et al. Mitral valve prolapse in the general population: the benign nature of echocardiographic features in the Framingham Heart Study. J Am Coll Cardiol. 2002;40(7):1298–304.
Petersen SE, Selvanayagam JB, Wiesmann F, Robson MD, Francis JM, Anderson RH, et al. Left ventricular non-compaction: insights from cardiovascular magnetic resonance imaging. J Am Coll Cardiol. 2005;46(1):101–5.
Elliott P, Andersson B, Arbustini E, Bilinska Z, Cecchi F, Charron P, et al. Classification of the cardiomyopathies: a position statement from the European Society Of Cardiology Working Group on Myocardial and Pericardial Diseases. Eur Heart J. 2008;29(2):270–6.
Ghosh R, Oak N, Plon SE. Evaluation of in silico algorithms for use with ACMG/AMP clinical variant interpretation guidelines. Genome Biol. 2017;18(1):225.
Nykamp K, Anderson M, Powers M, Garcia J, Herrera B, Ho YY, et al. Sherloc: a comprehensive refinement of the ACMG-AMP variant classification criteria. Genet Med. 2017;19(10):1105–17.
Amendola LM, Jarvik GP, Leo MC, McLaughlin HM, Akkari Y, Amaral MD, et al. Performance of ACMG-AMP Variant-Interpretation Guidelines among Nine Laboratories in the Clinical Sequencing Exploratory Research Consortium. Am J Hum Genet. 2016;98(6):1067–76.
Escobar-Lopez L, Ochoa JP, Mirelis JG, Espinosa MA, Navarro M, Gallego-Delgado M, et al. Association of genetic variants with outcomes in patients with nonischemic dilated cardiomyopathy. J Am Coll Cardiol. 2021;78(17):1682–99.
Campens L, Renard M, Callewaert B, Coucke P, De Backer J, De Paepe A. New insights into the molecular diagnosis and management of heritable thoracic aortic aneurysms and dissections. Pol Arch Med Wewn. 2013;123(12):693–700.