Phân bố toàn cầu của các kiểu huyết thanh/kiểu gen rotavirus và ý nghĩa của nó đối với việc phát triển và triển khai vắc xin rotavirus hiệu quả

Reviews in Medical Virology - Tập 15 Số 1 - Trang 29-56 - 2005
Norma Santos1, Yasutaka Hoshino2
1Departamento de Virologia, Instituto de Microbiologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ, 21.941-590, Brazil
2Laboratory of Infectious Diseases, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland 20892 USA

Tóm tắt

Tóm tắtVắc xin rotavirus an toàn và hiệu quả đang là nhu cầu cấp bách, đặc biệt là ở các nước đang phát triển. Cơ sở kiến thức quan trọng đối với phát triển và triển khai vắc xin là về dịch tễ học của các kiểu huyết thanh/kiểu gen G và P của rotavirus trên toàn thế giới. Phân bố theo thời gian và địa lý của các kiểu G và P rotavirus ở người được xem xét thông qua phân tích tổng cộng 45571 chủng được thu thập toàn cầu từ 124 nghiên cứu báo cáo từ 52 quốc gia trên năm châu lục, công bố trong giai đoạn 1989 đến 2004. Bốn kiểu G phổ biến (G1, G2, G3 và G4) kết hợp với P[8] hoặc P[4] chiếm hơn 88% tổng số chủng phân tích trên toàn thế giới. Ngoài ra, các virus kiểu huyết thanh G9 kết hợp với P[8] hoặc P[6] đã nổi lên là kiểu G quan trọng thứ tư trên toàn cầu với tần suất tương đối 4,1%. Khi phân phối toàn cầu các kiểu G và/hoặc P được chia thành năm lục địa/phân lục địa, nhiều đặc điểm đặc trưng đã nổi lên. Ví dụ, P[8]G1 chiếm hơn 70% các trường hợp nhiễm rotavirus ở Bắc Mỹ, Châu Âu và Úc, nhưng chỉ khoảng 30% các trường hợp nhiễm ở Nam Mỹ và Châu Á, cùng với 23% ở Châu Phi. Ngoài ra, ở Châu Phi (i) tần suất tương đối của G8 cao ngang với G3 hoặc G4 thường gặp trên toàn cầu, (ii) P[6] chiếm gần một phần ba tổng số các kiểu P xác định được và (iii) 27% các trường hợp nhiễm bệnh liên quan đến các chủng rotavirus mang các kết hợp không bình thường như P[6]G8 hoặc P[4]G8. Hơn nữa, ở Nam Mỹ, virus G5 ít phổ biến dường như tăng mức độ quan trọng dịch tễ học trong số các trẻ em bị tiêu chảy. Những phát hiện như vậy đã (i) khẳng định tầm quan trọng của việc giám sát liên tục các chủng rotavirus một cách chủ động trong nhiều bối cảnh địa lý khác nhau và (ii) cung cấp các cân nhắc quan trọng cho phát triển và triển khai một vắc xin rotavirus hiệu quả (ví dụ, điều chỉnh kiểu P-G theo địa lý trong việc bào chế vắc xin đa giá thế hệ tiếp theo). Bản quyền © 2004 John Wiley & Sons, Ltd.

Từ khóa

#rotavirus #vắc xin #dịch tễ học #phân bố địa lý #kiểu huyết thanh #kiểu gen #chủng virus #giám sát chủng virus.

Tài liệu tham khảo

10.1590/S1020-49892000001000002

10.3201/eid0905.020562

10.1053/jinf.2002.1012

10.1016/S0264-410X(98)00376-4

Midthun K, 1996, Rotavirus vaccines: an overview, Clin Microbiol Rev, 9, 423, 10.1128/CMR.9.3.423

Mackow ER, 1995, Infections of the Gastrointestinal Tract, 983

Kapikian AZ, 2001, Fields Virology, 1787

Estes MK, 2001, Fields Virology, 1747

10.1006/viro.2000.0472

10.1016/S0042-6822(03)00418-5

10.1016/S0042-6822(03)00534-8

Centers for Disease Control and Prevention, 1999, Withdrawal of rotavirus vaccine recommendation, MMWR, 48, 1007

Centers for Disease Control and Prevention, 1999, Intussusception among recipients of rotavirus vaccine, United States, 1998–1999, MMWR, 48, 577

10.1016/S0140-6736(01)06346-2

10.1056/NEJM200102223440804

10.1097/00006454-200104000-00008

10.1542/peds.108.1.54

Masendycz PJ, 1999, Rotavirus diversity: what surveillance will tell us, Commun Dis Intel, 23, 198

10.1128/JCM.38.7.2784-2787.2000

10.1016/S0264-410X(02)00616-3

10.3201/eid1006.030519

10.1128/JCM.41.7.3399-3402.2003

Santos N, 1998, Detection of rotavirus types G8 and G10 among Brazilian children with diarrhea, J Clin Microbiol, 36, 2727, 10.1128/JCM.36.9.2727-2729.1998

10.1007/BF01718637

Timenetsky MCT, 1994, Survey of rotavirus G and P types associated with human gastroenteritis in São Paulo, Brazil, from 1986 to 1992, J Clin Microbiol, 32, 2622, 10.1128/jcm.32.10.2622-2624.1994

10.1128/JCM.39.5.1999-2001.2001

10.1128/JCM.40.8.2837-2842.2002

10.1590/S0100-879X2001000400005

10.1590/S0074-02761995000600016

10.1128/IAI.39.1.91-99.1983

10.1016/S0166-0934(02)00087-3

10.1128/JVI.76.13.6596-6601.2002

10.1111/j.1348-0421.2000.tb02525.x

10.1002/0470846534.ch9

10.1093/infdis/174.Supplement_1.S30

10.1179/000349803125002526

10.1128/JCM.41.6.2680-2682.2003

10.1590/S0036-46651999000300006

10.1590/S0074-02762002000100020

10.1128/JCM.39.5.1981-1984.2001

10.1002/(SICI)1096-9071(199903)57:3<308::AID-JMV15>3.0.CO;2-B

Fischer TK, 2000, Genotype profiles of rotavirus strains from children in a suburban community in Guinea‐Bissau, Western Africa, J Clin Microbiol, 38, 264, 10.1128/JCM.38.1.264-267.2000

10.1128/JVI.75.8.3696-3705.2001

10.1128/JCM.41.6.2317-2322.2003

10.1006/viro.2001.1333

10.1128/JCM.41.6.2760-2762.2003

10.1128/JCM.40.4.1390-1394.2002

10.1128/jcm.32.7.1820-1822.1994

10.1128/JCM.40.5.1709-1714.2002

10.1128/JCM.39.10.3524-3529.2001

10.1128/JCM.32.5.1408-1409.1994

10.1128/JCM.41.5.2088-2095.2003

10.1128/JCM.30.1.9-16.1992

10.1128/JCM.42.1.393-397.2004

10.1002/jmv.1890470410

10.1099/0022-1317-50-5-462

10.1128/JCM.39.11.3969-3975.2001

10.1007/s007050070094

10.1128/JCM.39.3.836-843.2001

10.1002/(SICI)1096-9071(199907)58:3<296::AID-JMV17>3.0.CO;2-5

10.1016/S0042-6822(03)00153-3

10.1128/JCM.40.4.1534-1537.2002

Iturriza‐Gómara M, 2000, Molecular epidemiology of human group A rotavirus infections in the United Kingdom between 1995 and 1998, J Clin Microbiol, 38, 4394, 10.1128/JCM.38.12.4394-4401.2000

10.1002/(SICI)1096-9071(200001)60:1<63::AID-JMV11>3.0.CO;2-4

Dunn SJ, 1993, Serotypic and genotypic characterization of human serotype 10 rotaviruses from asymptomatic neonates, J Clin Microbiol, 31, 165, 10.1128/jcm.31.1.165-169.1993

10.1016/S0966-842X(00)88908-8

10.1128/JCM.29.10.2273-2279.1991

10.1128/JVI.76.23.11793-11800.2002

10.1016/S0014-5793(98)00415-3

10.1016/S0065-3527(08)60070-6

10.1002/rmv.411

Padilla‐Noriega L, 1998, Antigenic and genomic diversity of human rotavirus VP4 in two consecutive epidemic season in Mexico, J Clin Microbiol, 36, 1688, 10.1128/JCM.36.6.1688-1692.1998

Woods PA, 1992, Distribution of serotypes of human rotavirus in different populations, J Clin Microbiol, 30, 781, 10.1128/jcm.30.4.781-785.1992

Trabelsi A, 2000, Distribution of rotavirus VP7 serotypes and VP4 genotypes circulating in Sousse, Tunisia, from 1995 to 1999: emergence of natural human reassortants, J Clin Microbiol, 38, 3415, 10.1128/JCM.38.9.3415-3419.2000

Radwan SF, 1997, Serotyping of group A rotaviruses in Egyptian neonates and infants less than 1 year old with acute diarrhea, J Clin Microbiol, 35, 2996, 10.1128/jcm.35.11.2996-2998.1997

10.1128/jcm.29.5.862-868.1991

10.1099/0022-1317-69-2-451

Ward RL, 1991, Reactivities of serotyping monoclonal antibodies with culture‐adapted human rotavirus, J Clin Microbiol, 29, 449, 10.1128/jcm.29.3.449-456.1991

O'Mahony J, 1999, VP4 and VP7 genotyping of rotavirus samples recovered from infected children in Ireland over a 3‐year period, J Clin Microbiol, 37, 1699, 10.1128/JCM.37.6.1699-1703.1999

10.1002/1096-9071(200101)63:1<67::AID-JMV1010>3.0.CO;2-T

10.1128/JCM.39.3.1085-1091.2001

Masendycz P, 2000, Annual report of the rotavirus surveillance program, 1999/2000, Commun Dis Intell, 24, 195

Masendycz P, 2001, Report of the Australian Rotavirus Surveillance Program, 2000/2001, Commun Dis Intell, 25, 143

Kirkwood C, 2002, Report of the Australian Rotavirus Surveillance Program, 2001/2002, Commun Dis Intell, 26, 537

10.1016/S0168-1702(02)00318-0

10.1128/JCM.39.10.3796-3798.2001

10.1128/JCM.38.2.898-901.2000

10.1007/s007050050206

10.1128/JCM.41.9.4400-4403.2003

10.1007/s007050050594

10.1006/viro.1993.1428

10.1002/jmv.1890470102

10.1128/JCM.37.8.2706-2708.1999

10.1128/JCM.40.7.2398-2407.2002

10.1128/JCM.41.11.5153-5158.2003

SantosN HonmaS CamposG et al.Development of a PCR‐ELISA methodology for identification of rotavirus VP7 (G) genotypes. Abstract 23rd Annual Meeting of the American Society for Virology2004 Milwaukee WI Canada 272.

10.1128/JCM.42.1.441-444.2004

10.1099/0022-1317-78-6-1373

10.1007/BF01718636

10.1128/JCM.39.11.4020-4025.2001

10.1002/jmv.10089

10.1128/JCM.39.3.1157-1160.2001

10.1002/jmv.2020

10.1128/JCM.40.1.146-149.2002

O'Halloran F, 2000, Molecular characterization of rotavirus in Ireland: detection of novel strains circulating in the population, J Clin Microbiol, 38, 3370, 10.1128/JCM.38.9.3370-3374.2000

10.1111/j.1348-0421.1984.tb00726.x

10.1007/BF01348983

Kelkar SD, 2000, Circulation of group A rotavirus subgroups and serotypes in Pune, India, 1990–1997, J Health Popul Nutr, 18, 163

10.1002/jmv.2197

Clark HF, 1987, Rotavirus isolates WI61 representing a presumptive new human serotype, J Clin Microbiol, 25, 1757, 10.1128/jcm.25.9.1757-1762.1987

10.1128/JCM.42.4.1434-1438.2004

10.1128/JCM.36.11.3223-3229.1998

10.1111/j.1348-0421.1990.tb00994.x

10.1093/infdis/166.2.227

10.1111/j.1348-0421.2000.tb02590.x

10.1046/j.1442-200X.2000.01247.x

10.1128/JCM.37.6.1885-1891.1999

Ramachandran M, 1996, Unusual diversity of human rotavirus G and P genotypes in India, J Clin Microbiol, 34, 436, 10.1128/jcm.34.2.436-439.1996

10.1002/(SICI)1096-9071(200005)61:1<150::AID-JMV24>3.0.CO;2-W

Bon F, 2000, G and P genotyping of rotavirus strains circulating in France over three‐year period: detection of G9 and P[6] strains at low frequencies, J Clin Microbiol, 38, 1681, 10.1128/JCM.38.4.1681-1683.2000

10.1007/s007050050224

10.1128/JCM.41.8.3960-3963.2003

10.1128/JCM.42.4.1609-1613.2004

10.1017/S0950268803001353

10.1128/JCM.41.7.3100-3111.2003

Palombo EA, 2000, Emergence of serotype G9 human rotavirus in Australia, J Clin Microbiol, 38, 1305, 10.1128/JCM.38.3.1305-1306.2000

10.1128/jcm.21.3.425-430.1985

10.1056/NEJM198307143090203

Steele AD, 1995, Geographic distribution of human rotavirus VP4 genotypes and VP7 serotypes in five South African regions, J Clin Microbiol, 33, 1516, 10.1128/jcm.33.6.1516-1519.1995

10.1099/0022-1317-75-7-1775

10.1128/JCM.40.5.1875-1878.2002

Santos N, 1994, VP4 genotyping of human rotavirus in the United States, J Clin Microbiol, 32, 205, 10.1128/jcm.32.1.205-208.1994

10.1016/S0140-6736(00)02760-4

10.1023/A:1024884103757

Taniguchi K, 1989, Complete nucleotide sequence of the gene encoding VP4 of a human rotavirus (strain K8) which has unique VP4 neutralization epitopes, J Virol, 63, 4101, 10.1128/jvi.63.9.4101-4106.1989

10.1002/jmv.1890170105

10.1128/JVI.63.3.1431-1434.1989

Silberstein I, 1995, 1995. Distribution of both rotavirus VP4 genotypes and VP7 serotypes among hospitalized and nonhospitalized Israeli children, J Clin Microbiol, 33, 1421, 10.1128/jcm.33.5.1421-1422.1995

10.1002/jmv.20134

CastelloAA JiangB GlassRI GlikmannG GenstchJR.Rotavirus G and P genotpe prevalence in Argentina 1999–2003: detection of P[9]G12 strains. Abstract 23rd Annual Meeting of the American Society for Virology2004 Milwaukee WI Canada 272.

10.1017/S0950268802007975

Beards G, 1992, A serotype 10 human rotavirus, J Clin Microbiol, 30, 1432, 10.1128/jcm.30.6.1432-1435.1992

10.1006/viro.1993.1271

10.1128/JCM.42.6.2541-2547.2004

Taniguchi K, 1990, Nucleotide sequence of VP4 and VP7 genes of human rotaviruses with subgroup I specificity and long RNA pattern: implication for new serotype specificity, J Virol, 64, 5640, 10.1128/jvi.64.11.5640-5644.1990

CheonD‐S LeeK KimW et al.Genetic analysis of the VP7 gene of unusual genotypes of human group A rotavirus strains circulating in Korea. Abstract 23rd Annual Meeting of the American Society for Virology2004 Milwaukee WI Canada 272.

10.1006/viro.1993.1540

10.1099/0022-1317-75-1-215

Nakagomi O, 1990, Molecular identification by RNA‐RNA hybridization of a human rotavirus that is closely related to rotaviruses of feline and canine, J Clin Microbiol, 28, 1198, 10.1128/jcm.28.6.1198-1203.1990

10.1006/mcpr.1998.0198

10.1007/BF01309698

10.1002/jmv.10462

10.1007/s007050050565

10.1016/j.virol.2004.04.020

Beards GM, 1989, Temporal and geographical distribution of human rotavirus serotypes, 1983 to 1988, J Clin Microbiol, 27, 2827, 10.1128/jcm.27.12.2827-2833.1989

Cunliffe NA, 1998, Epidemiology of rotavirus diarrhea in Africa: a review to assess the need for rotavirus immunization, Bull WHO, 76, 525

10.1111/j.1651-2227.1999.tb14320.x

Tian Y, 1993, Genomic concatemerization/deletion in rotaviruses: a new mechanism for generating rapid change of potential epidemiological importance, J Virol, 67, 6625, 10.1128/jvi.67.11.6625-6632.1993

10.1111/j.1574-6968.1999.tb08819.x

10.1006/viro.2000.0682

10.1128/JCM.41.8.3649-3654.2003

10.1016/S0168-1702(98)00124-5

10.1099/0022-1317-80-2-341

10.1099/0022-1317-79-2-321

10.1007/BF01718215

10.1111/j.1348-0421.1995.tb03277.x

10.1099/0022-1317-77-2-239

10.1007/s007050050174

10.1128/JCM.40.6.2016-2022.2002

10.1099/0022-1317-80-6-1407

10.1002/1096-9071(200008)61:4<504::AID-JMV14>3.0.CO;2-S

10.3109/10425179809008479

Gerna G, 1988, Identification of two subtypes of serotype 4 human rotavirus by using VP7‐specific neutralizing monoclonal antibodies, J Clin Microbiol, 26, 1388, 10.1128/jcm.26.7.1388-1392.1988

10.1016/0042-6822(92)90766-I

10.1002/jmv.10511

10.1002/jmv.2081

Coulson BS, 1999, Comparison of enzyme immunoassay and reverse transcriptase PCR for identification of serotype G9 rotaviruses, J Clin Microbiol, 37, 3187, 10.1128/JCM.37.10.3187-3193.1999

10.1128/JVI.78.14.7795-7802.2004

Nakagomi T, 1999, Isolation of a human rotavirus strain with a super‐short RNA pattern and a new P2 subtype, J Clin Microbiol, 37, 1213, 10.1128/JCM.37.4.1213-1216.1999

Hoshino Y, 1988, Infection immunity of piglets to either VP3 or VP7 outer capsid protein confers resistance to challenge with a virulent rotavirus bearing the corresponding antigen, J Virol, 62, 744, 10.1128/jvi.62.3.744-748.1988

10.1016/S0065-3527(08)60585-0

Offit PA, 1986, Reassortant rotaviruses containing structural proteins VP3 and VP7 from different parents induce antibodies protective against each parental serotype, J Virol, 60, 491, 10.1128/jvi.60.2.491-496.1986

10.1016/S0165-2427(02)00046-6

10.1093/infdis/167.3.577

10.1086/317619

10.1002/0470846534.ch8

Matson DO, 1996, Protective immunity against groupo A rotavirus infection and illness in infants, Arch Virol, 12, 129

10.1086/340103

Offit PA, 1994, Immunologic determinants of protection against rotavirus disease, Curr Topics Microbiol Immunol, 185, 230

10.1016/S0168-7069(03)09020-7

10.1002/jmv.1890300315

Hoshino Y, 2000, Rotavirus serotypes: classification and importance in epidemiology, immunity, and vaccine development, J Health Popul Nutr, 18, 5

10.1093/infdis/166.6.1251

10.1016/S0264-410X(03)00120-8

Clark HF, 1996, WC3 reassortant vaccines in children, Arch Virol, 12, 187

10.1016/S0264-410X(02)00313-4

10.1016/j.jinf.2004.01.018

10.1016/S0168-7069(03)09019-0

Argüelles MH, 2000, VP7 and VP4 genotyping of human group A rotavirus in Buenos Aires, Argentina, J Clin Microbiol, 38, 252, 10.1128/JCM.38.1.252-259.2000

10.1093/tropej/45.2.81

10.1007/s10096-003-0952-0

10.1016/S1386-6532(02)00266-4

10.1097/00006454-199703000-00010

Padilla‐Noriega L, 1990, Diversity of rotavirus serotypes in Mexican infants with gastroenteritis, J Clin Microbiol, 28, 1114, 10.1128/jcm.28.6.1114-1119.1990

Castillo AR, 2000, VP4 and VP7 genotyping by reverse transcription‐PCR of human rotavirus in Mexican children with acute diarrhea, J Clin Microbiol, 38, 3876, 10.1128/JCM.38.10.3876-3878.2000

10.1016/S1386-6532(02)00177-4

10.1080/02724936.1997.11747859

10.1002/(SICI)1096-9071(199912)59:4<520::AID-JMV16>3.0.CO;2-7

Ward RL, 1991, Culture adaptation and characterization of group A rotaviruses causing diarrheal illness in Bangladesh from 1985 to 1986, J Clin Microbiol, 29, 1915, 10.1128/jcm.29.9.1915-1923.1991

10.1046/j.1442-200x.2000.01249.x

10.1002/(SICI)1096-9071(199904)57:4<390::AID-JMV11>3.0.CO;2-0

10.1016/S0168-1702(02)00081-3

10.1002/jmv.10542

10.1007/BF01317917

10.1111/j.1348-0421.2003.tb03422.x

Guanasena S, 1993, Relative frequency of VP4 gene alleles among human rotavirus recovered over a 10‐year period (1982–1991) from Japanese children with diarrhea, J Clin Microbiol, 31, 2195, 10.1128/jcm.31.8.2195-2197.1993

10.1017/S0950268800051311

Rasool NB, 1993, Serotype analysis of rotaviruses from different locations in Malaysia, J Clin Microbiol, 31, 1817, 10.1128/jcm.31.7.1815-1819.1993

10.1046/j.1442-200x.2000.01256.x

Lintag IC, 1990, Determination of subgroup, serotype and electropherotype of human rotaviruses obtained from diarrheic patients in the Philippines, Southeast Asian J Trop Med Public Health, 21, 249

10.1002/jmv.10398

10.1093/tropej/42.4.211

el‐Sheikh SM, 2001, Prevalene of viral, bacterial and parasitic enteropathogens among young children with acute diarrhoea in Jeddah, Saudi Arabia, J Health Popul Nutr, 19, 25

10.1046/j.1442-200x.2000.01251.x

Chiu T‐F, 2000, Rotavirus gastroenteritis in children: 5‐year experience in a medical center, J Microbiol Immunol Infect, 33, 181

10.1046/j.1442-200x.2000.01257.x

10.1046/j.1442-200x.2000.01255.x

10.1002/jmv.10347

10.1086/320733

10.1046/j.1360-2276.2003.01141.x

10.1093/oxfordjournals.aje.a010080

Frühwirth M, 2000, Distribution of rotavirus VP4 genotypes and VP7 serotypes among nonhospitalized and hospitalized patients with gastroenteritis and patients with nosocomially acquired gastroenteritis in Austria, J Clin Microbiol, 38, 1804, 10.1128/JCM.38.5.1804-1806.2000

10.1007/BF01311188

Gault E, 1999, Distribution of human rotavirus G types circulating in Paris, France, during the 1997–1998 epidemic: high prevalence of type G4, J Clin Microbiol, 37, 2373, 10.1128/JCM.37.7.2373-2375.1999

10.1128/JCM.40.11.4266-4272.2002

10.1111/j.1651-2227.2002.tb03325.x

10.1017/S0950268800004842

Wilhelmi I, 1999, The molecular epidemiology of the rotavirus in Spanish children. The rotavirus study group (GER), Enferm Infecc Microbiol Clin, 17, 509

10.1023/A:1007618215377

Baggi F, 2000, Genotyping of rotaviruses in environmental water and stool samples in Southern Switzerland by nucleotide sequence analysis of 189 base pairs at the 5′ end of the VP7 gene, J Clin Microbiol, 38, 3681, 10.1128/JCM.38.10.3681-3685.2000

10.1006/viro.1994.1163

Thông tin
Thông tin xuất bản

Reviews in Medical Virology

Tập 15 Số 1

29-56

Thông tin tác giả