Nghiên cứu liên kết toàn bộ gen đối với trọng lượng cơ thể của đàn gia súc ở vùng Siberia

Animal Genetics - Tập 50 Số 3 - Trang 250-253 - 2019
Alexander Igoshin1, N. S. Yudin1,2, Nadezhda M. Belonogova1, Denis M. Larkin1,3
1Institute of Cytology and Genetics, SB RAS, Novosibirsk, 630090, Russia
2Novosibirsk State University, Novosibirsk 630090, Russia
3Royal Veterinary College, University of London, London NW1 0TU, UK

Tóm tắt

Tóm tắtTrọng lượng cơ thể là một đặc điểm phức tạp ở gia súc liên quan đến các phép đo chăn nuôi thương mại thường được sử dụng liên quan đến tăng trưởng. Mặc dù nhiều vị trí đặc trưng tính trạng định lượng (QTL) cho trọng lượng cơ thể đã được xác định ở gia súc cho đến nay, việc tìm kiếm các yếu tố di truyền ở các giống khác nhau hoặc ở các môi trường khác nhau là có triển vọng. Do đó, chúng tôi đã tiến hành một nghiên cứu liên kết toàn bộ gen (GWAS) trên hai quần thể gia súc từ Liên bang Nga (khu vực Siberia) sử dụng mảng GGP HD150K chứa 139 376 dấu hiệu đơn nucleotide polymorphism (SNP). Các bài kiểm tra liên kết cho 107 550 SNP còn lại sau khi lọc cho thấy năm SNP có ý nghĩa thống kê trên BTA5, với tỷ lệ phát hiện sai dưới 0.05. Vùng nhiễm sắc thể chứa năm SNP này chứa gen CCND2, được liên kết trước đó với tăng cân trung bình hàng ngày và chỉ số khối cơ thể ở các quần thể gia súc thịt bò Mỹ và ở con người tương ứng. Nghiên cứu của chúng tôi là GWAS đầu tiên về trọng lượng cơ thể ở các quần thể gia súc thịt bò từ Liên bang Nga. Các kết quả được cung cấp ở đây gợi ý rằng, mặc dù có sự tồn tại của các QTL đặc hiệu giống và loài, nhưng kiến trúc di truyền của trọng lượng cơ thể có thể được bảo tồn tiến hóa ở các loài động vật có vú.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.5194/aab-60-61-2017

10.1111/j.1365-2052.2011.02272.x

Commission on Genetic Resources for Food and Agriculture(2015)Status and Trends of Animal Genetic Resources – 2014.FAO Rome.http://www.fao.org/3/a-mm278e.pdf.

Dmitriev N.G., 1989, Animal Genetic Resources of the USSR

10.1038/27376

10.3168/jds.2017-12604

Hernandez N., 2016, Association of polymorphisms in growth hormone and leptin candidate genes with live weight traits of Brahman cattle, Genetics and Molecular Research, 1, 5

10.1093/nar/gks1150

10.1530/JOE-15-0449

10.1038/ng.548

10.1111/jbg.12152

10.1086/519795

10.5713/ajas.2014.14287

10.1186/1471-2164-15-1004

Sambrook J., 2006, The Condensed Protocols from Molecular Cloning: A Laboratory Manual

10.1186/s12864-017-3754-y

10.1038/ng.2882

10.1111/asj.12417

10.1111/j.1365-2052.2012.02320.x

10.1038/s41437-017-0024-3

Thông tin
Thông tin xuất bản

Animal Genetics

Tập 50 Số 3

250-253

Thông tin tác giả