Các gen cần thiết cho sự phát triển của vi khuẩn mycobacterial được xác định bởi đột biến mật độ cao

Molecular Microbiology - Tập 48 Số 1 - Trang 77-84 - 2003
Christopher M. Sassetti1, Dana Boyd2, Eric J. Rubin1
1Department of Immunology and Infectious Diseases, Harvard School of Public Health, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA.
2Department of Microbiology and Molecular Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115 USA

Tóm tắt

Tóm tắt

Mặc dù đã có hơn một thế kỷ nghiên cứu, bệnh lao vẫn là một trong những nguyên nhân hàng đầu gây tử vong do nhiễm trùng trên toàn cầu. Trước tình trạng gia tăng tỷ lệ kháng thuốc, việc xác định các gen cần thiết cho sự phát triển của vi sinh vật này sẽ cung cấp các mục tiêu mới cho việc thiết kế các tác nhân kháng mycobacterium. Ở đây, chúng tôi mô tả việc sử dụng phương pháp lai ghép vị trí transposon (TraSH) để xác định một cách toàn diện các gen cần thiết cho tác nhân gây bệnh, Mycobacterium tuberculosis, nhằm đạt được sự phát triển tối ưu. Các gen này bao gồm những gen có thể được phân loại thành các con đường thiết yếu cũng như nhiều gen chưa được xác định chức năng. Các gen quan trọng cho sự phát triển của M. tuberculosis chủ yếu được bảo tồn trong bộ gen suy thoái của trực khuẩn phong, Mycobacterium leprae, cho thấy rằng các chức năng không thiết yếu đã bị mất chọn lọc kể từ khi vi khuẩn này phân nhánh ra khỏi những loài mycobacteria khác. Ngược lại, một tỷ lệ đáng ngạc nhiên của các gen này không có các đồng hình đã xác định trong các vi khuẩn khác, cho thấy rằng bộ gen tối thiểu cần thiết cho sự sống sót biến đổi rất lớn giữa các sinh vật có lịch sử tiến hóa khác nhau.

Từ khóa

#Mycobacterium tuberculosis; gene identification; drug resistance; transposon mutagenesis; microbial pathogens

Tài liệu tham khảo

10.1073/pnas.012602299

10.1038/nbt0998-851

10.1128/JB.142.2.439-446.1980

Brennan P.J., 2001, Genomic evidence for the retention of the essential mycobacterial cell wall in the otherwise defective Mycobacterium leprae, Lepr Rev, 72, 415

10.1128/JB.183.4.1259-1268.2001

10.1038/31159

10.1038/35059006

10.1073/pnas.97.3.1252

10.1073/pnas.140225297

10.1126/science.286.5447.2165

10.1074/jbc.M204060200

10.1126/science.1063566

10.1038/77305

10.1093/bioinformatics/18.suppl_1.S225

10.1099/00221287-113-2-409

10.1073/pnas.96.20.11428

10.1002/j.1460-2075.1996.tb00930.x

10.1128/JB.184.12.3392-3395.2002

Pavelka M.S., 1999, Comparison of the construction of unmarked deletion mutations in Mycobacterium smegmatis, Mycobacterium bovis bacillus Calmette‐Guerin, and Mycobacterium tuberculosis H37Rv by allelic exchange, J Bacteriol, 181, 4780, 10.1128/JB.181.16.4780-4789.1999

10.1016/S1074-5521(98)90291-5

10.1073/pnas.96.4.1645

10.1128/IAI.70.7.3371-3381.2002

10.1073/pnas.231275498

10.1128/JB.182.13.3832-3838.2000

Zalkin H., 1996, Escherichia Coli and Salmonella: Cellular and Molecular Biololgy