Fugu: một bộ gen tham chiếu động vật có xương sống gọn nhẹ

FEBS Letters - Tập 476 - Trang 3-7 - 2000
Byrappa Venkatesh1, Patrick Gilligan1, Sydney Brenner1
1Institute of Molecular and Cell Biology, National University of Singapore, 30 Medical Drive, Singapore 117609

Tóm tắt

Tại 400 Mb, cá nóc Nhật Bản, Fugu rubripes, có bộ gen động vật có xương sống nhỏ nhất nhưng lại sở hữu một tập hợp gen tương tự như các động vật có xương sống khác. Các gen của nó được đóng gói dày đặc với các trình tự liên gen và nội gen ngắn, thiếu các yếu tố lặp lại. Nó có khả năng có thiên hướng đột biến hướng tới việc loại bỏ DNA và có thể gần với một bộ gen động vật có xương sống 'tối thiểu'. Do đó, nó là một bộ gen tham chiếu hữu ích cho việc phát hiện gen và xác thực gen ở các động vật có xương sống khác. Tính hữu ích của nó trong việc phát hiện các yếu tố điều tiết bảo tồn đã được chứng minh. Chuỗi gen Fugu là một bổ sung tốt cho các nghiên cứu di truyền ở các động vật có xương sống khác.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1038/366265a0 Nelson J.S. (1994) Fishes of the World John Wiley New York. 10.1073/pnas.96.18.10267 Leis J.M. (1983) in: Ontogeny and Systematics of Fishes (Moser H.G. Ed.) Special Publication No. 1 pp. 459–463. Am. Soc. Ichthyol. Herpetol. 10.1101/gr.9.10.960 10.1016/S0378-1119(98)00296-0 10.1016/S0378-1119(98)00600-3 10.1126/science.282.5394.1711 10.1016/0888-7543(95)80044-M 10.1101/gr.6.12.1207 10.1006/jmbi.1996.0347 10.1006/geno.1996.0406 10.1016/S0378-1119(97)00064-4 10.1073/pnas.95.9.5178 10.1126/science.287.5455.1060 10.1038/ng0595-67 10.1073/pnas.93.16.8485 10.1006/geno.1997.4913 10.1016/S0378-1119(97)00423-X 10.1016/S0378-1119(98)00495-8 10.1016/S0378-1119(98)00010-9 10.1016/S0378-1119(98)00032-8 10.1006/geno.1998.5732 10.1101/gr.9.3.242 10.1073/pnas.93.4.1366 10.1073/pnas.94.23.12462 10.1073/pnas.95.22.13068 10.1101/gr.9.3.251 10.1038/990031 10.1126/science.282.5396.2012 10.1126/science.287.5461.2185 10.1101/gr.6.12.1185 10.1038/ng0597-79 10.1101/gr.9.5.437 10.1093/hmg/8.7.1313 10.1038/35001596 10.1073/pnas.92.5.1684 10.1242/dev.124.20.3929 10.1242/dev.125.14.2735 Hinegardner R., 1976, Comp. Biochem. Physiol., 55, 367, 10.1016/0300-9629(76)90063-3 Olmo E., 1989, Comp. Biochem. Physiol., 92, 447 10.1002/cyto.990100606 10.1086/282801 Bloom S.E. Delany M.E. and Muscarella D.E. (1993) in: Manipulation of the Avian Genome (Etches R.J. and Gibbons A.M.V. Eds.) pp. 39–59. CRC Press Boca Raton FL. 10.1016/S0168-9525(98)01506-6 10.1101/gr.8.1.9 Ozato K., 1992, Mol. Mar. Biol. Biotech., 1, 346 10.2331/fishsci.61.594