Sự thật và sự giả mạo trong proteomics của các dịch thể cơ thể. Proteomics nước bọt đang cho chúng ta biết điều gì?

Journal of Separation Science - Tập 31 Số 11 - Trang 1948-1963 - 2008
Irene Messana1, Rosanna Inzitari2, Chiara Fanali2, Tiziana Cabras1, Massimo Castagnola3
1Department of Sciences Applied to Biosystems, Cagliari University, Cagliari, Italy
2Institute of Biochemistry and Clinical Biochemistry, Catholic University of Rome, Rome (Italy). Fax: +39-06-3053598
3Institute for the Chemistry of Molecular Recognition, National Research Council (C.N.R.), Rome, Italy

Tóm tắt

Tóm tắt

Bài tổng quan này ngắn gọn mô tả một số điểm nổi bật về tình trạng hiện tại của tri thức liên quan đến peptidoma nước bọt. Nó phác thảo các khó khăn nội tại trong việc xác định nó liên quan đến các yếu tố biến đổi khác nhau, chẳng hạn như: i) đa hình di truyền cao, được phức tạp bởi các sự chèn/xóa cá nhân và việc cắt ghép thay thế; ii) sự trưởng thành sau dịch mã phức tạp bao gồm các cắt đứt proteolytic khác nhau, gắn đường, phosphoryl hóa và quá trình sulf hóa; iii) sự biến thiên sinh lý và các đóng góp khác nhau cho tổng thể. Hơn nữa, một số vấn đề công nghệ và phân tích cũng như những cạm bẫy phải vượt qua trong quá trình nghiên cứu của chúng tôi tập trung vào việc xác định phẩm chất và số lượng rộng rãi của peptidoma nước bọt, chủ yếu dựa trên phân tích LC-MS của các peptide tự nhiên còn nguyên vẹn, cũng được mô tả ở đây. Hy vọng rằng thông tin được cung cấp có thể hữu ích cho các nhóm khác tham gia vào việc phân tích nước bọt hoặc các dịch thể cơ thể khác cho các ứng dụng lâm sàng.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1034/j.1601-0825.2002.1o816.x

10.1038/sj.bdj.4807861

10.14219/jada.archive.2006.0158

10.1002/prca.200600771

10.1177/00220345940730110701

10.1002/pmic.200401156

10.1016/S0003-9969(98)00068-5

10.1016/S0003-9969(98)00040-5

Kauffman D. L., 1993, Crit. Rev. Oral Biol. Med., 4, 287, 10.1177/10454411930040030501

Azen E. A., 1996, Am. J. Hum. Genet., 58, 143

10.1021/pr049953c

10.1046/j.1432-1327.1998.2580623.x

10.1016/S0021-9258(18)68522-9

10.1016/0006-291X(89)92460-1

10.1074/jbc.M404322200

10.1021/pr0700706

Schlesinger D. H., 1977, J. Biol. Chem., 252, 1689, 10.1016/S0021-9258(17)40603-X

10.1007/BF00582164

Sabatini L. M., 1987, Am. J. Hum. Gen., 41, 1048

10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022620

10.1002/pmic.200600395

10.1177/10454411920030040101

10.1177/154411130201300304

10.1177/10454411930040030701

10.1002/pmic.200401316

10.1021/pr060065m

10.1007/s10989-007-9109-9

10.1016/j.archoralbio.2007.06.009

10.1016/j.archoralbio.2003.11.007

10.1196/annals.1384.030

10.1007/BF00499086

10.1007/BF00561335

Maeda N., 1985, J. Biol. Chem., 260, 11123, 10.1016/S0021-9258(17)39156-1

10.1002/humu.1380040103

10.1016/0003-9969(91)90147-M

10.1016/0003-9861(70)90446-7

10.1002/elps.1150120114

10.1177/08959374000140011101

10.1093/glycob/12.1.1

10.1074/jbc.273.2.881

10.1016/S0021-9258(20)80762-5

10.1006/geno.1996.0049

10.2741/Fowler

10.1177/154405910708600802

Brunati A. M., 2000, Biochem. J., 351, 765, 10.1042/bj3510765

10.1007/s00018-005-5506-4

10.1111/j.1432-1033.1997.00719.x

10.1006/bbrc.1997.7702

10.1096/fj.02-0870fje

10.1006/bbrc.2001.5049

10.1111/j.1749-6632.1998.tb10727.x

10.1016/S1367-5931(98)80033-1

Messana I. Cabras T. Pisano E. Sanna M. T. et al. Mol. Cell. Proteomics2008 in press.

10.1016/j.bbapap.2006.07.002

10.1111/j.1600-0722.2005.00246.x

10.1016/j.forsciint.2004.10.026

Tandler B. Riva A. in: Mjor I. A. Fejerskov O. (Eds.) Human oral embryology and histology. Salivary Glands Munksgaard Copenhagen 1986 pp. 243–284.

10.1177/002215540405200307

10.1016/0003-9969(80)90068-0

10.1113/jphysiol.1972.sp009721

10.1021/pr060520e

10.1016/j.archoralbio.2006.06.005

10.1515/CCLM.2005.197

10.1016/S1567-5688(03)00035-7

10.1016/S1567-5688(03)00032-1

10.1002/pmic.200300638

10.1002/pmic.200401037

10.1021/bi048176r

10.1021/pr050129d

10.1002/jssc.200700445

10.1074/jbc.M308689200

10.1002/pmic.200700084

Nesvizhskii A. I., 2007, Methods Mol. Biol., 367, 87

10.1021/pr060573w

10.1038/13690

10.1074/mcp.M400129-MCP200

10.1007/978-1-59745-255-7_3

10.1002/(SICI)1097-0231(19970615)11:9<1015::AID-RCM958>3.0.CO;2-H

10.1074/mcp.M500084-MCP200

10.1002/jssc.200600290

10.1074/mcp.M500230-MCP200

Messana I., 2003, Eur. J. Morphol., 4, 103, 10.1080/09243860412331282228