Quy định Epigenetic của Các Yếu Tố Đề Kháng trong Thực Vật

Annual Review of Plant Biology - Tập 60 Số 1 - Trang 43-66 - 2009
Damon Lisch1
1Department of Plant and Microbial Biology, University of California, Berkeley, California 94720

Tóm tắt

Các yếu tố đề kháng tạo thành một tỷ lệ đáng kể trong hầu hết các bộ gen thực vật. Bởi vì chúng có khả năng gây đột biến cao, các yếu tố đề kháng được kiểm soát bởi một tập hợp các cơ chế có chức năng nhận diện và làm im lặng chúng theo phương pháp epigenetic. Trong hầu hết các trường hợp, quá trình này rất hiệu quả và phần lớn các yếu tố đề kháng đều không hoạt động. Tuy nhiên, các yếu tố đề kháng có thể được kích hoạt bởi nhiều điều kiện khác nhau mà các quần thể tự nhiên có thể gặp phải, và ngay cả những loài gần gũi cũng có thể có sự khác biệt đáng kể về số lượng bản sao của các yếu tố đề kháng. Việc làm im lặng các yếu tố đề kháng đã chứng minh có mối liên hệ chặt chẽ với các hiện tượng epigenetic khác, và các yếu tố đề kháng được biết là có đóng góp trực tiếp và gián tiếp vào việc điều chỉnh các gen của vật chủ. Nhìn chung, những quan sát này gợi ý rằng những thay đổi tự nhiên trong hoạt động của các yếu tố đề kháng có thể có tác động quan trọng đến nguyên nhân và hậu quả của việc làm im lặng epigenetic ở thực vật.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Alleman M, 1986, Genetics, 112, 107, 10.1093/genetics/112.1.107

10.1038/ng1478

10.1016/j.tcb.2005.03.006

10.1007/s11103-005-4429-7

10.1111/j.1469-8137.2005.01433.x

10.1002/dvg.1020100604

10.1093/nar/29.10.2127

10.1016/S0092-8674(04)00045-5

10.1038/nature02874

10.1016/j.cell.2006.05.005

10.1128/MCB.17.9.5165

10.1016/0966-842X(96)10042-1

10.1105/tpc.015958

10.1101/sqb.2004.69.419

10.1016/S0960-9822(02)00925-9

10.1101/gad.1026102

10.1007/s00294-006-0078-x

10.1038/nrg1601

10.1371/journal.pgen.0020083

10.1371/journal.pbio.0040363

10.1126/science.1095989

10.1073/pnas.83.6.1767

10.1007/s00438-006-0141-9

10.1002/j.1460-2075.1987.tb04753.x

10.1038/nature06745

10.1128/9781555817954.ch1

10.1105/tpc.006163

10.1016/S0092-8674(00)80864-8

Dietrich CR, 2002, Genetics, 160, 697, 10.1093/genetics/160.2.697

Dooner HK, 1991, Genetics, 129, 855, 10.1093/genetics/129.3.855

10.1105/tpc.12.11.2101

10.1371/journal.pone.0000219

10.1002/bies.950170405

Fedoroff NV, 1995, Curr. Top. Microbiol. Immunol., 197, 143

10.1038/ncb1155

10.1126/science.1101092

10.1016/j.cell.2005.12.034

10.1159/000084957

10.1023/A:1018302216927

10.1093/aob/mcj001

10.1073/pnas.0509650103

10.1101/gr.4399206

10.1073/pnas.232688099

10.1104/pp.102.017533

10.1105/tpc.105.037655

10.1038/nature05917

10.1101/gad.1667808

10.1126/science.1062939

Hershberger RJ, 1995, Genetics, 140, 1087, 10.1093/genetics/140.3.1087

10.1073/pnas.93.15.7783

10.1016/j.bbaexp.2007.03.001

10.1038/nature731

10.1126/science.277.5329.1100

10.1038/nature02953

10.1038/nature01214

10.1016/S0960-9822(02)00976-4

10.1093/emboj/17.21.6385

10.1016/S0960-9822(01)00226-3

10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218

10.1016/S0168-9525(02)00006-9

10.1101/sqb.2006.71.023

10.1016/j.cub.2006.05.045

10.1101/gr.4064205

10.1023/A:1006423110134

10.1073/pnas.93.22.12406

10.1101/sqb.2004.69.139

10.1073/pnas.110587497

10.1038/sj.embor.7400446

Kashkush K, 2002, Genetics, 160, 1651, 10.1093/genetics/160.4.1651

10.1038/ng1063

10.1371/journal.pbio.0050057

10.1534/genetics.104.029637

10.1093/pcp/pch109

10.1023/A:1016072014259

10.1111/j.0014-3820.2001.tb01268.x

10.1126/science.1089835

10.1111/j.1365-313X.2006.02936.x

10.1016/j.gene.2004.12.017

10.1146/annurev.genet.33.1.479

10.1016/j.cell.2006.05.032

10.1038/sj.emboj.7600430

10.1038/nature02651

10.1371/journal.pbio.0000067

10.1002/bies.20219

10.1073/pnas.052152199

Lisch D, 1995, Genetics, 139, 1777, 10.1093/genetics/139.4.1777

10.1016/j.cell.2008.03.029

10.1101/gad.1217304

10.1023/B:PLAN.0000038270.48326.7a

10.1101/gr.5530106

10.1016/S1097-2765(00)80478-5

10.1016/j.tig.2007.01.004

Martienssen R, 1994, Genetics, 136, 1157, 10.1093/genetics/136.3.1157

10.1016/j.cell.2007.07.007

10.1038/nrg1500

10.1371/journal.pgen.0010079

McClintock B, 1948, Carnegie Inst. Wash. Yearb., 47, 155

McClintock B, 1950, Carnegie Inst. Wash. Yearb., 49, 157

McClintock B, 1958, Carnegie Inst. Wash. Yearb., 57, 415

McClintock B, 1965, Carnegie Inst. Wash. Yearb., 64, 527

McClintock B, 1965, Brookhaven Symp. Biol., 18, 162

10.1126/science.15739260

10.1093/emboj/19.19.5194

10.1038/ng1615

10.1073/pnas.0605421103

10.1073/pnas.0504235102

10.1534/genetics.107.071902

10.1038/nbt1291

10.1016/j.cub.2006.09.022

10.1038/284604a0

10.1146/annurev.genet.34.1.401

Pan YB, 1988, Genetics, 119, 457, 10.1093/genetics/119.2.457

10.1104/pp.104.053215

10.1104/pp.107.107730

10.1007/BF00226117

10.1098/rstb.2004.1611

10.1101/gr.5290206

10.1371/journal.pone.0000203

10.1261/rna.916708

10.1016/j.cell.2006.05.031

10.1101/gad.348405

10.1002/(SICI)1520-6408(1998)22:1<100::AID-DVG10>3.0.CO;2-D

10.1101/gad.1476406

10.1101/gr.7073008

10.1016/j.gde.2008.01.014

Robertson DS, 1986, Genetics, 113, 765, 10.1093/genetics/113.3.765

10.1016/j.virusres.2004.01.020

10.1038/sj.emboj.7601788

10.1046/j.1365-294X.2002.01557.x

10.1093/molbev/msi082

10.1038/nature02107

10.1016/S0960-9822(01)00116-6

10.1016/j.tplants.2003.12.010

10.1371/journal.pgen.1000216

10.1038/ng1576

10.1038/nrg2072

10.1016/j.tig.2005.04.008

10.1016/S1097-2765(00)00078-2

10.1101/gad.1006702

10.1105/tpc.12.12.2511

10.1046/j.1365-313X.1999.00460.x

10.1073/pnas.0407154101

10.1186/gb-2005-6-11-r90

10.1016/j.cub.2006.09.020

10.1016/S0960-9822(03)00539-6

10.1105/tpc.11.9.1769

10.1159/000084941

10.1016/S0168-9525(01)02367-8

10.1126/science.1074973

10.1073/pnas.0603080103

10.1016/0092-8674(94)90119-8

10.1016/j.tplants.2006.01.003

10.1554/0014-3820(2002)056[2126:POGVSA]2.0.CO;2

10.1371/journal.pbio.0040339

10.1371/journal.pbio.0020104

10.1007/s00239-002-2397-y

10.1016/S0168-9525(97)01181-5

10.1101/sqb.2006.71.047

10.1038/sj.emboj.7601603

10.1105/tpc.006106

10.1126/science.1079695

10.1038/ng1929

10.1101/sqb.2006.71.059