Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Giám sát dịch tễ và vi rút học đối với virus cúm ở Trung Quốc trong giai đoạn 2020–2021
Tóm tắt
Trong đại dịch bệnh coronavirus 2019 (COVID-19), hoạt động cúm mùa đã giảm toàn cầu và duy trì ở mức thấp hơn so với các mùa cúm trước, nhưng đã gia tăng tại Trung Quốc kể từ năm 2021. Các biện pháp phòng ngừa COVID-19 đi kèm với những đặc điểm dịch tễ khác nhau của cúm ở các khu vực khác nhau trên thế giới. Để ứng phó tốt hơn với các đợt bùng phát cúm dưới ảnh hưởng của đại dịch COVID-19, chúng tôi đã phân tích dịch tễ học, đặc điểm kháng nguyên và di truyền, cũng như khả năng kháng thuốc kháng virus của virus cúm trên đất liền Trung Quốc trong giai đoạn 2020–2021. Các mẫu bệnh phẩm hô hấp từ các trường hợp giống cúm đã được thu thập bởi các bệnh viện giám sát và gửi đến các phòng thí nghiệm mạng trong Mạng lưới Giám sát Cúm Quốc gia Trung Quốc. Phân tích đột biến kháng nguyên đối với các chủng virus cúm được thực hiện thông qua phương pháp ức chế ngưng kết hồng cầu. Kỹ thuật giải mã thế hệ tiếp theo đã được sử dụng để phân tích di truyền. Chúng tôi cũng đã tiến hành đặc tính phân tử và phân tích hệ phả hệ (phylogenetic) của các virus cúm đang lưu hành. Các virus đã được thử nghiệm độ nhạy với thuốc kháng virus bằng các phương pháp dựa trên hình thái và/hoặc dựa vào chuỗi gen. Trên đất liền Trung Quốc, hoạt động cúm đã phục hồi vào năm 2021 so với năm 2020 và gia tăng trong mùa cúm mùa đông truyền thống, nhưng không vượt qua đỉnh điểm của các năm trước. Gần như tất cả các virus bị phân lập trong thời gian nghiên cứu là của dòng B/Victoria và được đặc trưng bởi tính đa dạng di truyền, với các virus thuộc nhóm 1A.3a.2 hiện đang chiếm ưu thế. 37.8% virus được thử nghiệm có đặc điểm kháng nguyên tương tự như virus tham chiếu đại diện cho các thành phần của vắc xin cho các mùa cúm ở Bắc Bán cầu năm 2020–2021 và 2021–2022. Thêm vào đó, Trung Quốc có một nhóm độc đáo của các virus 1A.3a.1. Tất cả các virus đã được thử nghiệm đều nhạy cảm với các chất ức chế neuraminidase và ức chế endonuclease, ngoại trừ hai virus thuộc dòng B/Victoria được xác định có độ nhạy giảm đối với các chất ức chế neuraminidase. Hoạt động cúm gia tăng trên đất liền Trung Quốc trong năm 2021, gây ra mùa cúm trong mùa đông năm 2021–2022. Mặc dù đa dạng (phân) của các loại cúm giảm, nhưng các virus thuộc dòng B/Victoria cho thấy tăng tính đa dạng di truyền và kháng nguyên. Thế giới cần chuẩn bị đầy đủ cho co-đại dịch của cúm và virus coronavirus gây hội chứng hô hấp cấp tính nghiêm trọng 2 (SARS-CoV-2) toàn cầu.
Từ khóa
#virus cúm #giám sát dịch tễ #COVID-19 #Trung Quốc #kháng nguyên.Tài liệu tham khảo
Luliano AD, Roguski KM, Chang HH, Muscatello DJ, Palekar R, Tempia S, Global Seasonal Influenza-associated Mortality Collaborator Network, et al. Estimates of global seasonal influenza-associated respiratory mortality: a modelling study. Lancet. 2018;391(10127):1285–300.
Paul Glezen W, Schmier JK, Kuehn CM, Ryan KJ, Oxford J. The burden of influenza B: a structured literature review. Am J Public Health. 2013;103(3):e43-51.
Tafalla M, Buijssen M, Geets R, Vonk N-S. A comprehensive review of the epidemiology and disease burden of Influenza B in 9 European countries. Hum Vaccin Immunother. 2016;12(4):993–1002.
Shaw MW, Xu X, Li Y, Normand S, Ueki RT, Kunimoto GY, et al. Reappearance and global spread of variants of influenza B/Victoria/2/87 lineage viruses in the 2000–2001 and 2001–2002 seasons. Virology. 2002;303(1):1–8.
Virk RK, Jayakumar J, Mendenhall IH, Moorthy M, Lam P, Linster M, et al. Divergent evolutionary trajectories of influenza B viruses underlie their contemporaneous epidemic activity. Proc Natl Acad Sci USA. 2020;117(1):619–28.
Adlhoch C, Snacken R, Melidou A, Ionescu S, Penttinen P, The European Influenza Surveillance Network. Dominant influenza A(H3N2) and B/Yamagata virus circulation in EU/EEA, 2016/17 and 2017/18 seasons, respectively. Euro Surveill. 2018;23(13):18–00146.
Advisory Committee on Immunization Practices, Smith NM, Bresee JS, Shay DK, Uyeki TM, Cox NJ, et al. Prevention and control of influenza: recommendations of the Advisory Committee on Immunization Practices (ACIP). MMWR Recomm Rep. 2006;55(RR-10):1–42.
Ferdinands JM, Gaglani M, Martin ET, Middleton D, Monto AS, Murthy K, et al. Prevention of influenza hospitalization among adults in the United States, 2015–2016: results from the US Hospitalized Adult Influenza Vaccine Effectiveness Network (HAIVEN). J Infect Dis. 2019;220(8):1265–75.
Tisa V, Barberis I, Faccio V, Paganino C, Trucchi C, Martini M, et al. Quadrivalent influenza vaccine: a new opportunity to reduce the influenza burden. J Prev Med Hyg. 2016;57(1):E28-33.
Heikkinen T, Ikonen N, Ziegler T. Impact of influenza B lineage-level mismatch between trivalent seasonal influenza vaccines and circulating viruses, 1999–2012. Clin Infect Dis. 2014;59(11):1519–24.
Huang QS, Wood T, Jelley L, Jennings T, Jefferies S, Daniells K, et al. Impact of the COVID-19 nonpharmaceutical interventions on influenza and other respiratory viral infections in New Zealand. Nat Commun. 2021;12(1):1001.
Laurie KL, Rockman S. Which influenza viruses will emerge following the SARS-CoV-2 pandemic? Influenza Other Respir Viruses. 2021;15(5):573–6.
World Health Organization. Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2022 southern hemisphere influenza season. 2021. https://www.who.int/publications/m/item/recommended-composition-of-influenza-virus-vaccines-for-use-in-the-2021-southern-hemisphere-influenza-season. Accessed 24 Sept 2021.
World Health Organization. Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2022–2023 northern hemisphere influenza season. 2022. https://www.who.int/publications/m/item/recommended-composition-of-influenza-virus-vaccines-for-use-in-the-2022-2023-northern-hemisphere-influenza-season. Accessed 25 Feb 2022.
Zhou B, Lin X, Wang W, Halpin RA, Bera J, Stockwell TB, et al. Universal influenza B virus genomic amplification facilitates sequencing, diagnostics, and reverse genetics. J Clin Microbiol. 2014;52(5):1330–7.
World Health Organization. Meetings of the WHO working group on surveillance of influenza antiviral susceptibility—Geneva, November 2011 and June 2012. Wkly Epidemiol Rec. 2012;87(39):369–74.
Katoh K, Standley DM. MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability. Mol Biol Evol. 2013;30(4):772–80.
Price MN, Dehal PS, Arkin AP. FastTree 2—approximately maximum-likelihood trees for large alignments. PLoS ONE. 2010;5(3):e9490.
World Health Organization. Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2020–2021 northern hemisphere influenza season. 2020. https://www.who.int/publications/m/item/recommended-composition-of-influenza-virus-vaccines-for-use-in-the-2020-2021-northern-hemisphere-influenza-season. Accessed 28 Feb 2020.
World Health Organization. Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2021–2022 northern hemisphere influenza season. 2021. https://www.who.int/publications/m/item/recommended-composition-of-influenza-virus-vaccines-for-use-in-the-2021-2022-northern-hemisphere-influenza-season. Accessed 26 Feb 2021.
Shi W, Ke C, Fang S, Li J, Song H, Li X, et al. Co-circulation and persistence of multiple A/H3N2 influenza variants in China. Emerg Microbes Infect. 2019;8(1):1157–67.
Huang WJ, Cheng YH, Chen T, Li XY, Tan MJ, Wei HJ, et al. Characterization of influenza viruses—China, 2019–2020. China CDC Weekly. 2020;2(44):856–61.
Huang WJ, Li XY, Tan MJ, Cheng YH, Chen T, Wei HJ, et al. Epidemiological and virological surveillance of seasonal influenza viruses—China, 2020–2021. China CDC Wkly. 2021;3(44):918–22.
Nerome R, Hiromoto Y, Sugita S, Tanabe N, Ishida M, Matsumoto M, et al. Evolutionary characteristics of influenza B virus since its first isolation in 1940: dynamic circulation of deletion and insertion mechanism. Arch Virol. 1998;143(8):1569–83.
Nakagawa N, Kubota R, Nakagawa T, Okuno Y. Antigenic variants with amino acid deletions clarify a neutralizing epitope specific for influenza B virus Victoria group strains. J Gen Virol. 2001;82(Pt 9):2169–72.
Govorkova EA, Takashita E, Daniels RS, Fujisaki S, Presser LD, Patel MC, et al. Global update on the susceptibilities of human influenza viruses to neuraminidase inhibitors and the cap-dependent endonuclease inhibitor baloxavir, 2018–2020. Antivir Res. 2022;200:105281.
Burnham AJ, Baranovich T, Marathe BM, Armstrong J, Webster RG, Govorkova EA. Fitness costs for Influenza B viruses carrying neuraminidase inhibitor-resistant substitutions: underscoring the importance of E119A and H274Y. Antimicrob Agents Chemother. 2014;58(5):2718–30.