Bản đồ biểu hiện nội sinh của u ác tính hắc tố bằng hình ảnh khối phổ

Clinical and Translational Medicine - Tập 7 - Trang 1-9 - 2018
Yutaka Sugihara1,2, Daniel Rivas1, Johan Malm1,3,4, Marcell Szasz1,5,6, HoJeong Kwon1,7, Bo Baldetorp2,4, Håkan Olsson2, Christian Ingvar8, Melinda Rezeli1, Thomas E. Fehniger1,4, György Marko-Varga1,2,4,7
1Clinical Protein Science & Imaging, Biomedical Center, Department of Biomedical Engineering, Lund University, Lund, Sweden
2Department of Oncology, Clinical Sciences, Lund University, Skåne University Hospital, Lund, Sweden
3Section for Clinical Chemistry, Department of Translational Medicine, Lund University, Skåne University Hospital Malmö, Malmö, Sweden
4Centre of Excellence in Biological and Medical Mass Spectrometry, Biomedical Centre D13, Lund University, Lund, Sweden
5Cancer Center, Semmelweis University, Budapest, Hungary
6Department of Tumor Biology, National Koranyi Institute of Pulmonology, Budapest, Hungary
7Chemical Genomics Global Research Lab, Department of Biotechnology, College of Life Science and Biotechnology, Yonsei University, Seoul, Republic of Korea
8Department of Surgery, Clinical Sciences, Lund University, SUS, Lund, Sweden

Tóm tắt

Hiện tại, chỉ có một số ít biomarker phân tử cho u ác tính hắc tố. Tình trạng này tồn tại cho cả việc chẩn đoán bệnh, phân giai đoạn, và đo lường hiệu quả điều trị bằng cách theo dõi sự tiến triển của sự phát triển bệnh và tác động của thuốc. Có một nhu cầu lớn trong việc xác định các dấu hiệu nổi bật mới của sự tiến triển bệnh và thay đổi. Hình ảnh khối phổ bằng laser ion hóa hấp dẫn có hỗ trợ từ ma trận (MALDI-MSI) đã được phát triển trong nhóm của chúng tôi để nghiên cứu sự phân bố thuốc trong các ngăn mô vi mô. Tại đây, chúng tôi mở rộng thêm về phát triển công nghệ này và giới thiệu lần đầu tiên các mô u hắc tố để lập bản đồ sự phân bố của các chất chuyển hóa bằng cách sử dụng khối phổ độ phân giải cao. MALDI-MSI có thể đo lường và xác định mô hình phân bố của một số chất chuyển hóa phân tử nhỏ trong các ngăn mô của các khối u tách biệt từ bệnh nhân hắc tố. Dữ liệu về việc đo trực tiếp các loại chất chuyển hóa ở các vị trí tại các ngăn mô chưa được sẵn có như một chỉ số lâm sàng cho hầu hết các loại bệnh ung thư. Phát triển hiện tại về việc lập bản đồ sự biểu hiện phân tử nội sinh của các khối u hắc tố bằng hình ảnh khối phổ tập trung vào việc thiết lập một quy trình chuẩn bị mô ung thư, trong đó sự hình thành tinh thể ma trận được xây dựng đồng nhất trên bề mặt mô, cung cấp hồ sơ phân tử đồng đều. Chúng tôi áp dụng công nghệ chuẩn bị vi mô này cho việc trình bày bệnh bằng cách lập bản đồ các dấu hiệu phân tử từ các mẫu u của bệnh nhân. Chúng tôi đã tự động hóa quy trình này với một nền tảng phân phát công nghệ vi mô. Điều này cung cấp cơ sở cho việc tạo ra màng mỏng của các mô bệnh nhân ung thư trước khi tiến hành quét hình ảnh. Sự phân chia các vùng u được hiển thị trong phân tích hình ảnh giao diện với phân loại và đặc trưng mô học. Điều này cho phép xác định vị trí trong khối u với việc lập bản đồ hình ảnh đến các khu vực mục tiêu bệnh, chẳng hạn như tế bào hắc tố, đại thực bào, và bạch cầu lympho.

Từ khóa

#biomarker #u ác tính hắc tố #MALDI-MSI #khối phổ #chất chuyển hóa #phân tích hình ảnh #khối u #chuẩn bị mô #công nghệ vi mô

Tài liệu tham khảo

Balch CM, Gershenwald JE, Soong SJ, Thompson JF, Atkins MB, Byrd DR, Buzaid AC, Cochran AJ, Coit DG, Ding S, Eggermont AM, Flaherty KT, Gimotty PA, Kirkwood JM, McMasters KM, Mihm MC Jr., Morton DL, Ross MI, Sober AJ, Sondak VK (2009) Final version of 2009 AJCC melanoma staging and classification. J Clin Oncol 27(36):6199–6206 Tsao H, Atkins MB, Sober AJ (2004) Management of cutaneous melanoma. N Engl J Med 351(10):998–1012 Stoeckli M, Chaurand P, Hallahan DE, Caprioli RM (2001) Imaging mass spectrometry: a new technology for the analysis of protein expression in mammalian tissues. Nat Med 7:493–496 McDonnell LA, Piersma SR, Altelaar AFM, Mize TH, Luxembourg SL, Verhaert P, van Minnen J, Heeren RMA (2005) Subcellular imaging mass spectrometry of brain tissue. J Mass Spectrom 40:160–168 Caprioli RM, Farmer TB, Gile J (1997) Molecular imaging of biological samples: localization of peptides and proteins using MALDI-TOF MS. Anal Chem 69:4751–4760 Marko-Varga G, Fehniger TE, Rezeli M, Döme B, Laurell T, Végvári A (2011) Drug localization in different lung cancer phenotypes by MALDI mass spectrometry imaging. J Proteomics 74:982–992 Takats Z, Wiseman JM, Gologan B, Cooks RG (2004) Mass spectrometry sampling under ambient conditions with desorption electrospray ionization. Science 306:471–473 Landgraf RR, Conaway MCP, Garrett TJ, Stacpoole PW, Yost RA (2009) Imaging of lipids in spinal cord using intermediate pressure matrix-assisted laser desorption-linear ion trap/orbitrap MS. Anal Chem 81:8488–8495 Solon EG, Schweitzer A, Stoeckli M, Prideaux B (2010) Autoradiography, MALDI-MS, and SIMS-MS imaging in pharmaceutical discovery and development. AAPS J 12:11–26 Pawłowski K, Szasz M, Sugihara Y, Jönsson G, Ingvar C, Lundgren L, Baldetorp B, Olsson H, Malm J, Rezeli M, Laurell T, Wieslander E, Marko-Varga G (2017) Correlation pathology characteristics to protein expression and protein function in malignant melanoma. PLoS ONE 12(4):e0176167 Katona F, Murnyák B, Marko-Varga G, Hortobágyi T (2017) Molecular background of the primary melanoma and the brain metastasis. Orv Hetil 158(28):1083–1091 Sugihara Y, Végvári Á, Welinder C, Jönsson G, Ingvar C, Lundgren L, Olsson H, Breslin T, Wieslander E, Laurell T, Rezeli M, Jansson B, Fehniger TE, Baldetorp B, Marko-Varga G (2014) A new look at drugs targeting malignant melanoma—an application for mass spectrometry imaging. Proteomics 14:1963–1970 Eriksson J, Andersson S, Appelqvist R, Wieslander E, Truedsson M, Bugge M, Malm J, Dahlbäck M, Andersson B, Fehniger TE, Marko-Varga G (2017) Merging clinical chemistry biomarker data to COPD-Orestad database-building a clinical infrastructure for proteomics studies. Proteome Sci 15:8 Kwon H, Fehniger TE, Marko-Varga G (2016) Building the basis for proteomics in precision medicine for targeted treatment. Clin Transl Med 15:9 Baldetorp B, Welinder C, Jönsson G, Ingvar C, Lundgren L, Olsson H, Breslin T, Végvári A, Laurell T, Rezeli M, Jansson B, Marko-Varga G (2013) Malignant melanoma initiative in Southern Sweden establishing a fully automated biobank Public Service Review: European Union. 25:1 Welinder C, Jonsson G, Ingvar C, Lundgren L, Olsson H, Breslin T, Vegvari A, Laurell T, Rezeli M, Jansson B, Baldetorp B, Marko-Varga G (2013) Establishing a Southern Swedish malignant melanoma OMICS and biobank clinical capability. Clin Transl Med 2(1):7 Önnerfjord P (1999) doctoral thesis, Lund University