Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Biến đổi sinh thái và đa dạng di truyền liên quan đến mẫu hạt albumins, globulins và prolamins ở các taxa Vicia từ Algeria
Tóm tắt
Đã tiến hành nghiên cứu sự biến đổi di truyền trong 78 quần thể các taxa Vicia L. thu thập tại địa phương dựa trên mẫu hạt albumin, globulin và prolamin bằng phương pháp điện di trên gel polyacrylamide có natri dodecyl sulfate (SDS-PAGE) cùng với đặc trưng sinh thái địa lý của các địa điểm được điều tra. Các phân tích nhóm dựa trên 131, 119 và 98 băng được sử dụng cho albumin, globulin và prolamin tương ứng. Các cây phát sinh chủng loại dựa trên chỉ số Jaccard và phương pháp UPGMA đã được tạo ra và mức độ đa dạng di truyền giữa và trong các taxa đã được đánh giá. Năm nhóm đã được hình thành từ protein albumins, sáu nhóm từ globulins và bốn nhóm từ prolamins. Kết quả phản ánh sự đa dạng lớn của các protein lưu trữ và có mối tương quan cao giữa ba phân đoạn được nghiên cứu. Nhiều mẫu truy cập có băng đặc trưng có thể được sử dụng như một dấu hiệu phân biệt cả ở cấp độ nội loài và liên loài. Không thấy mối quan hệ rõ ràng nào giữa các nhóm theo nguồn gốc địa lý của chúng. Dữ liệu thu được từ điều tra sinh thái địa lý có thể được sử dụng cho các chiến dịch thu thập trong tương lai.
Từ khóa
#đa dạng di truyền #Vicia L. #albumins #globulins #prolamins #điện di gel polyacrylamide #điều tra sinh thái địa lýTài liệu tham khảo
Abd El Moneim AM (1992) Narbon Vetch (Vicia narbonensis L.): a potential feed legume crop for dry areas in West Asia. J Agron Crop Sci 169(5):347–353
Ashour FM, El-Sadek LM, El-Badan GE (2005) Karyotypic relatedness among Vicia species. Egypt J Genet Cytol 34:345–353
Ball PW (1968) Vicia L. In: Tutin TG, Heywood VH, Burges NA, Moore DM, Valentine DH, Walters SM, Webb DA (eds) Flora Europaea, vol 2. Rosaceae to Umbelliferae. Cambridge University Press, Cambridge, pp 129–136
Bechkri S, Khelifi D (2016) Variation in Vicia sativa s.l. from Algeria based on morphological characters and ecogeographic parameters. Genet Resour Crop Evol. doi:10.1007/s10722-016-0404-1
Bennett SJ, Maxted N (1997) An ecogeographic analysis of the Vicia narbonensis complex. Genet Resour Crop Evol 44:411–428
Chung JW, Kim TS, Suresh S, Lee SY, Cho GT (2013) Development of 65 novel polymorphic cDNA-SSR markers in common vetch (Vicia sativa subsp sativa). Molecules 18(7):8376–8392
Crawford DJ (1990) Plant molecular systematics. Wiley, New York
Darre MJ, Minior DN, Tatake JG, Ressler C (1998) Nutritional evaluation of detoxified and raw common vetch seed using diets of broilers. J Agric Food Chem 46:4675–4679
Davis PH, Plitmann U (1970) Vicia L. In: Davis PH (ed) Flora of Turkey and the East Aegean Islands. University Press, Edinburgh, pp 274–321
De la Rosa L, Gonzalez JM (2010) The genetic diversity associated with seed proteins in a collection of Spanish underground vetches (Vicia sativa L. subsp. amphicarpa (Dorthes) Asch. et Graebn.). Genet Resour Crop Evol 57:565–573
Diklic N (1972) Vicia L. In: Josifovic M (ed) Flora SR Srbije. Beograd, Sanu, pp 315–355
Ehrman TA, Maxted N (1990) Ecogeographic survey and collection of Syrian Vicieae and Cicereae (Leguminosae). Plant Genet Res Newsl 77:1–8
El Bakatoushi R, Ashour FM (2009) Genetic diversity among some Vicia narbonensis L. varieties as revealed by karyotype and protein analysis. Egypt J Genet Cytol 38:85–97
Emberger L (1955) Une classification biogéographique des climats. Rec Trav Lab Bot Géol Fac Sci 7:1–43
Emre I, Turgut-Balik D, Genç H, Sahin A (2010) Total seed storage protein patterns of some Lathyrus species growing in Turkey using SDS-PAGE. Pak J Bot 42(5):3157–3163
Francis GM, Enneking D, Abd El Moneim AM (2000) When and where will vetches have an impact as grain legumes? In: Knight R (ed) Linih’ng research and marketing opportunities for pulses in the 21st century. Proceedings of the Third International Food Legume Research Conference, Adelaide 1997. Current plant science and biotechnology in agriculture. Kluwer, London, p 375–384
Freitas RL, Ferreira RB, Teixeira AR (2000) Use of a single method in the extraction of the seed storage globulins from several legume species. Application to analyse structural comparisons within the major classes of globulins. Int J Food Sci Nutr 51:341–352
Goodrich W, Cooke J, Morgan AG (1985) The application of electrophoresis to the characterization of cultivars of Vicia faba L. FABIS Newsl 13:8–11
Haider AS, El-Shanshoury AR (2000) Variability of storage proteins and esterase isozymes in Vicia sativa subsp. Biol Plant 43:205–209
Hameed A, Shah TM, Atta BM, Iqbal N, Haq MA, Ali H (2009) Comparative seed storage protein profiling of Kabuli chickpea genotypes. Pak J Bot 41(2):703–710
Hanelt P, Mettin D (1989) Biosystematics of the genus Vicia L. (Leguminosae). Annu Rev Ecol Syst 20:199–223
Higgins TJV (1984) Synthesis and regulation of major proteins in seeds. Ann Rev Plant Physiol 35:191–221
Jaaska V (1997) Isoenzyme diversity and phylogenetic affinities in Vicia subgenus Vicia (Fabaceae). Genet Resour Crop Evol 44:557–574
Jaaska V, Leht M (2007) Phylogenetic relationships between and within sections Hypechusa, Narbonensis and Peregrinae of genus Vicia (Fabaceae) based on evidence from isozymes and morphology. CEJB 2(1):137–155
Kupicha FK (1976) The infrageneric structure of Vicia. Notes R Bot Gard Edinb 34:287–326
Ladizinsky G, Hymowitz T (1979) Seed protein electrophoresis in taxonomic and evolutionary studies: review. Theor Appl Genet 54:145–151
Laemmli UK (1970) Cleavage of structural proteins during the assembly of head of bacteriophage T4. Nature 227:680–685
Leht M (2009) Phylogenetics of Vicia (Fabaceae) based on morphological data. Feddes Repert 120(7–8):379–393
Mantel N (1967) Adaptation of Karber’s method for estimating the exponential parameter from quantal data, and its relationship to birth, death, and branching processes. Biometrics 23:739–746
Maxted N (1993) A phenetic investigation of Vicia L. subgenus Vicia (Leguminosae, Vicieae). Bot J Linn Soc 111:155–182
Maxted N (1995) An ecogeographical study of Vicia subgenus Vicia. Systematic and ecogeographic studies on crop genepools 8. International Plant Genetic Resources Institute, Rome
Maxted N, Ford-Lloyd BV, Hawkes JG (1996) Complementary conservation strategies. In: Maxted N, Ford-Lloyd BV, Hawkes JG (eds) Plant genetic conservation: the in situ approach. Chapman and Hall, London, pp 20–57
Mirali N, El-Khouri S, Rizq F (2007) Genetic diversity and relationships in some Vicia species as determined by SDS–PAGE of seed proteins. Biol Plant 51(4):660–666
Mudzana G, Pickett AA, Jarman RJ, Cooke RT, Keefe PD (1995) Variety discrimination in faba beans (Vicia faba L.) an integrated approach. Plant Var Seeds 8:135–145
Mustafa AEZ (2007) Genetic variation among Egyptian cultivars of Vicia faba L. Pak J Biol Sci 10(23):4204–4210
Nemecek T, Von Richthofen JS, Dubois G, Casta P, Charles R, Pahl H (2008) Environmental impacts of introducing grain legumes into European crop rotations. Eur J Agron 28:380–393
Osborne TB (1924) The vegetable proteins. London, Longmans-Green
Potokina E, Tomooka N, Vaughan DA, Alexandrova T, Xu RQ (1999) Phylogeny of Vicia subgenus Vicia (Fabaceae) based on analysis of RAPDs and RFLP of PCR-amplified chloroplast genes. Genet Res Crop Evol 46:149–161
Potokina E, Endo Y, Eggi E, Ohashi H (2003) Electrophoretic patterns of seed proteins in the East Asian Vicia species (Leguminosae) and their systematic utility. J Japanese Bot 78(1):29–37
Przybylska J, Zimniak-Przybylska Z (1997) Electrophoretic seed albumin patterns in Vicia species of sectt. Hypechusa and Peregrinae (Fabaceae). Plant Syst Evol 208:239–248
Quézel P, Santa S (1962) Nouvelle flore de l’Algérie et des régions méridionales. Tome 1. Editions du centre national de la recherche scientifique, Paris, pp 524–531
Ribeiro AC, Teixeira AR, Ferreira RB (2004) Characterization of globulins from common vetch (Vicia sativa L.). J Agric Food Chem 52:4913–4920
Romesburg HC (1990) Cluster analysis for researchers. Robert E. Krieger Publishing Company, Malabar
Seltzer P (1946) Le climat de l’Algérie. Alger, Carbonel, p 219
Shiran B, Raina SN (2014) Evidence of rapid evolution and incipient speciation in Vicia sativa species complex based on nuclear and organellar RFLPs and PCR analysis. Genet Resour Crop Evol 48:519–532
Stewart P (1969) Un nouveau climagramme pour l’Algérie et son application au barrage vert. Bull Soc Hist Nat Afr Nord 65:1–2