Phân bổ theo vùng, phân biệt theo địa phương: khảo sát ảnh hưởng cơ bản của việc sử dụng đất địa phương đối với đa dạng sinh học vi khuẩn trong không khí

Wiley - Tập 20 Số 10 - Trang 3529-3542 - 2018
Kathryn M. Docherty1, Douglas S. Pearce1, Kristina Lemmer2, Rebecca L. Hale3
1Department of Biological Sciences, Western Michigan University, Kalamazoo, Michigan, USA.
2Department of Mechanical and Aerospace Engineering, Western Michigan University, Kalamazoo, Michigan, USA
3Department of Biological Sciences, Idaho State University, Pocatello, Idaho, USA

Tóm tắt

Tóm tắt

Vi khuẩn trong không khí tồn tại rất phong phú và có thể thay đổi theo mục đích sử dụng đất. Sự mở rộng đô thị đang gia tăng nhanh chóng trên quy mô toàn cầu, làm thay đổi các nguồn nguyên liệu tự nhiên của đa dạng sinh học vi khuẩn trong không khí, khi đất và các loại cây bản địa bị thay thế bằng bê tông và các khu vườn được quản lý. Sự đô thị hóa làm đồng nhất hóa đa dạng sinh học của các sinh vật lớn hơn, nhưng những tác động của nó vẫn chưa được nghiên cứu đầy đủ trong lĩnh vực vi sinh vật học. Nghiên cứu này sử dụng các phương pháp phân loại và độ dốc để khảo sát các cộng đồng vi khuẩn trong không khí ở phía tây nam Michigan (Mỹ). Các cộng đồng vi khuẩn trong không khí mang dấu hiệu vi khuẩn đường ruột và đồng nhất như nhau giữa các địa điểm thành phố và nông thôn, mặc dù sự đồng nhất của cộng đồng vi khuẩn trong đất tại các địa điểm đô thị lớn hơn. Ruminococcaceae là nhóm vi khuẩn phong phú, nguồn gốc của chúng có thể là từ động vật hoang dã. Bên cạnh dấu hiệu vi khuẩn đường ruột, còn có những ảnh hưởng cơ bản của việc sử dụng đất, điều này thể hiện qua sự chia sẻ các loại vi khuẩn trong không khí giữa các địa điểm thành phố và nông thôn. Bacillales, Burkholderiales, Alteromonadales và Pseudomonadales được chia sẻ nhiều hơn tại các địa điểm đô thị, trong khi Xanthomonadales, chứa các tác nhân gây bệnh cho cây trồng, lại được chia sẻ giữa các địa điểm nông nghiệp trong nông thôn. Những kết quả này gợi ý rằng các loại vi khuẩn có thể phân bổ toàn cầu, kết hợp với các nguồn địa phương, góp phần vào các cộng đồng đô thị, trong khi các hoạt động nông thôn khu vực điều khiển thành phần nông thôn. Chúng tôi xác định rằng đất khó có thể góp phần vào phân bổ rộng rãi của một số loại vi khuẩn liên quan đến thực vật, nhưng có thể là nguồn phân bổ cho những loại khác.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1073/pnas.1420815112

10.1128/MMBR.57.2.293-319.1993

10.1016/j.soilbio.2011.03.012

10.1128/AEM.00447-09

10.1038/ismej.2010.167

10.1128/AEM.05498-11

10.2307/1942268

10.1073/pnas.0608255104

10.1038/nmeth.f.303

10.1007/s10021-003-0172-6

10.1111/j.1365-2427.2011.02696.x

10.1186/2193-1801-2-127

10.1073/pnas.1212089110

10.1007/s10453-010-9181-z

10.1007/s00248-007-9216-3

10.1214/09-SS051

Fox J., 2011, An R Companion to Applied Regression Second

10.1016/j.ibiod.2008.06.004

10.1126/science.1150195

10.1890/120374

10.1007/s10980-015-0297-y

10.1007/s13213-010-0117-1

10.1128/mBio.00569-12

Homer C. G., 2015, Completion of the 2011 National Land Cover Database for the counterminous United States‐representing a decade of land cover change information, Photogramm. Eng. Remote Sens (Basel), 81, 345

Jaccard P., 1908, Nouvelles recherches sur la distribution florale, Bull Soc Vaud Des Sci Nat, 44, 223

10.1111/j.1574-6941.2008.00476.x

10.1111/j.1365-3059.2005.01176.x

10.1093/bioinformatics/btq166

10.1214/aoms/1177706261

10.1111/j.1365-2672.1998.00586.x

10.3389/fmicb.2016.00772

10.1094/PDIS-10-16-1426-PDN

10.1128/AEM.01043-13

Legendre P., 2012, Numerical Ecology. Volume 24, 3rd edition

10.1111/j.1574-6941.1997.tb00408.x

10.1186/s13073-016-0307-y

10.1093/gbe/evw098

10.1128/AEM.00610-16

Maczulak A., 2011, Chapter 35: Clostridia

10.1111/j.1364-3703.2012.00804.x

10.1186/1471-2105-13-31

10.2307/1938259

10.1023/A:1014359024275

10.1371/journal.pone.0061217

10.3389/fmicb.2015.01454

10.1016/j.scitotenv.2016.07.037

10.1371/journal.pone.0009768

10.1023/A:1025821622411

10.1264/jsme2.ME10114

Oksanen J. Blanchet F.G. Friendly M. Kindt R. Legendre P. McGlinn D. et al. (2016)vegan: Community Ecology Package. R package.

10.1093/molbev/msp077

10.1073/pnas.1323995111

10.1093/nar/gks1219

Rainey F. A., 2009, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 3 (the Firmicutes), 1016

10.7717/peerj.2584

10.1371/journal.pone.0023777

10.1111/j.1366-9516.2005.00226.x

10.1073/pnas.1205743110

10.1007/s002530100826

10.1128/AEM.00062-07

10.1016/j.landurbplan.2017.05.004

10.1016/j.jglr.2014.04.008

10.1098/rstb.2010.0283

Xian G., 2011, Change of impervious surface surface area between 2001 and 2006 in the conterminous United States, Photogramm. Eng. Remote Sensing, 77, 758

Thông tin
Thông tin xuất bản

Wiley

Tập 20 Số 10

3529-3542

Thông tin tác giả