Thiết kế, Tổng hợp và Kết nối Phân tử của Một Chất Chống U Lymphoma Pyrimidine Mới

Russian Journal of Bioorganic Chemistry - Tập 49 - Trang S119-S131 - 2024
Tingting Fan1, Feng Jin2
1Affiliated People’s Hospital of Jiangsu University, Zhenjiang, China
2Medical College of Anhui University of Science and Technology, Huainan, China

Tóm tắt

Năm hợp chất đã được tổng hợp thành công thông qua một số bước đơn giản. Alkyne đóng vai trò thiết yếu trong việc biến đổi cấu trúc của thuốc. Trong bài báo này, alkynyl và vòng benzen đã được đưa vào cấu trúc của các dẫn xuất pyrimidine nhằm thu được các hợp chất đơn và đôi alkynyl. Năm hợp chất này có các đặc tính quang lý tương tự. Thử nghiệm độc tính tế bào in vitro được thực hiện thông qua phương pháp MTT. Kết quả cho thấy hoạt tính của các hợp chất đơn alkynyl tốt hơn so với các hợp chất đôi alkynyl. Để mô phỏng sự liên kết giữa hợp chất và protein mục tiêu, kết nối phân tử đã được thực hiện bằng phần mềm môi trường hoạt động phân tử (MOE) bản AutoDock Vina 1.1.2. Bốn protein (JNK3, Bcr-Abl kinase, MAP3K và Topo II) đã được chọn để mô phỏng. Kết quả cho thấy rằng liên kết hydro, liên kết π-π và tương tác kỵ nước là những lực chính. Ngoài ra, điều thú vị là sau khi biến đổi cấu trúc, hợp chất có ái lực cao hơn trong việc kết nối với protein so với nguyên liệu ban đầu, và hợp chất được protein bắt tốt hơn. Điều này tạo nền tảng cho nghiên cứu và phát triển thuốc mới và có giá trị tham khảo nhất định trong nghiên cứu các tác nhân chống u bướu.

Từ khóa

#Tổng hợp hóa học #Pyrimidine #Alkyne #Độc tính tế bào #Kết nối phân tử #Protein

Tài liệu tham khảo

Sebastien, R., Sinaeda, A., Aymeric, N., and Gilles, P.V.W., Biochem. Pharmacol., 2018, vol. 153, pp. 24–34. Muraro, D.S., Abrantes, F.L., Pozebon, H., Gabriel, M., and Marco, E., Australian J. Crop. Sci., 2021, vol. 15, pp. 9–15. https://doi.org/10.21475/ajcs.21.15.01.1942 Moatasem, A.-S., Syakirah, S., and Rashid, A.R., Eur. Asian J. Bio. Sci., 2020, vol. 14, pp. 3607–3616. Yang, Z.S., Sun, A.P., Zhao, X.S., Chen, Z.G., and Tian, Z.W., Int. J. Biol. Macromol., 2020, vol. 151, pp. 878–884. https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2020.02.165 Rana, R., Sharma, R., and Kumar, A., Infect. Disord.: Drug Target., 2019, vol. 19, pp. 224–237. https://doi.org/10.2174/1871526518666180806123230 Fu, K., Wang, C., Ma, C., Zhou, H., and Li, Y.X., Front. Pharmacol., 2021, vol. 12, p. 771459. Yang, Z.S., Sun, A.P., Zhao, T.S., Chen, Z.G., and Xie, Y.F., Int. J. Biol. Macromol., 2020, vol. 15, pp. 878–884. Lian, G., Hu, K., Zhou, M., Liu, Y., and Jin, G., J. Polymer Res., 2023, vol. 30, p. 105. https://doi.org/10.1007/s10965-023-03487-y Lian, G., Shao, T., Qi, X., and Jin, G.F., Inorg. Chem. Commun., 2022, vol. 137, Article ID: 109171. https://doi.org/10.1016/j.inoche.2021.109171 Geng, P.B., Xu, X.H., and Gao, Z., J. Oleo Sci., 2021, vol. 70, pp. 1815–1828. https://doi.org/10.5650/jos.ess21255 Yi, L., Ke, J.Y., Liu, J.Y., Lai, H.L., Liu, L., and Wang, P.X., J. Leukocyte Biol., 2021, vol. 110, pp. 1113–1120. https://doi.org/10.1002/jlb.3ma0121-024rrrr Chen, X., Li, D., Zhang, H., Duan, Y., and Huang, Y., Int. J. Pharm., 2021, vol. 606, Article ID: 120894. https://doi.org/10.1016/j.ijpharm.2021.120894 Liao, K., Su, X., Lei, K., Liu, Z., and Wang, M.M., Biomed. Pharm., 2021, vol. 135, Article ID: 111195. https://doi.org/10.1016/j.biopha.2020.111195 Shu, Z., Cao, Y., Tao, Y., and Gui, S., Drug Deliv., 2020, vol. 27, pp. 642–651. https://doi.org/10.1080/10717544.2020.1754524 Wang, Y., Yu, C., and Zhang, H., Phytother. Res., 2019, vol. 33, pp. 1827–1836. https://doi.org/10.1002/ptr.6372 Zhang, Y.-S., Han, J.-Y., Iqbal, O., and Liang, A.-H., Int. J. Mol. Sci., 2019, vol. 20, pp. 70/1–70/15. https://doi.org/10.3390/ijms20010070 Zhang, Y., Zou, B., Tan, Y., Su, J., Liu, L., and Li, X., Pharmacol. Res., 2019, vol. 142, pp. 140–150. https://doi.org/10.1016/j.phrs.2019.02.015 Yue, M.F., Zhang, X.Y., Dou, Y.N., Wei, Z.F., and Dai, Y., Front. Pharmacol., 2018, vol. 9, pp. 675/1–675/13. https://doi.org/10.3389/fphar.2018.00675 Xu, W., Wang, X., Tu, Y., Sugiyama, K., Yamada, H., and Hirano, T., Phytother. Res., 2019, vol. 33, pp. 187–196. https://doi.org/10.1002/ptr.6215 Qian, X., Zhao, Z., Shang, W., and Cai, H., Mol. Med. Rep., 2018, vol. 18, pp. 49–58. https://doi.org/10.3892/mmr.2018.8959 Wang, Y., Jin, Y., Yun, X., and Xia, Y., Life Sci., 2018, vol. 209, pp. 228–235. https://doi.org/10.1016/j.lfs.2018.08.012 Zhao, F., Wang, Y., and Jin, G.F., Arabian J. Chem., 2021, vol. 14, Article ID: 103395. https://doi.org/10.1016/j.arabjc.2021.103395 Baskan, C., Erturk, A.G., Aydin, B., and Siriken, B., Bioorg. Chem., 2022, vol. 119, Article ID: 105517. https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2021.105517 Watson, D.J., Laing, L., Gibhard, L., and Wiesner, L., Antimicrob. Agents Chemother., 2021, vol. 65, p. e00990. https://doi.org/10.1128/aac.00990-21 Shaki, H. and Color, F., Fibers Polymers, 2020, vol. 21, pp. 2530–2538. https://doi.org/10.1007/s12221-020-1148-2 Suthagar, K., Jiao, W., Munier-Lehmann, H., and Fairbanks, A.J., Carbohydrate Res., 2018, vol. 457, pp. 32–40. https://doi.org/10.1016/j.carres.2018.01.001 Liu, Y., Wang, Z., Dou, Y., Li, S., Chen, E., and Jin, G.F., Eur. Polymer J., 2022, vol. 180, Article ID: 111606. https://doi.org/10.1016/j.eurpolymj.2022.111606 Persaud, A.K., Bernier, M.C., Raj, R., and Hill, K., Nature Commun., 2023, vol. 14, p. 3175. https://doi.org/10.1038/s41467-023-38789-8 Shao, T., Wang, Y., and Jin, G., Dyes Pigments, 2022, vol. 201, Article ID: 110204. https://doi.org/10.1016/j.dyepig.2022.110204 Gao, X., Sun, B., Hou, Y., Li, D., and Hua, H., J. Enzyme Inhibit. Med. Chem., 2022, vol. 37, pp. 1870–1883. Deng, M., Wang, P., Long, X., Xu, G., and Wang, C., ChemMedChem, 2023, vol. 18, p. e202200664. Wei, C.-J., Xu, F., Shi, M.-J., Hu, J.-W., Wang, J.-J., Zhen, B., Wang, J.-H., and Du, G.-H., J. Asian Nat. Prod. Res., 2017, vol. 20, pp. 277–291. Liu Y., Hu K., and Jin, G., Chem. Biodiv., 2022, vol. 19, Article ID: e202200644. https://doi.org/10.1002/cbdv.202200644