Xác định hệ vi sinh vật bình thường của khoang miệng

Journal of Clinical Microbiology - Tập 43 Số 11 - Trang 5721-5732 - 2005
A. Jørn1,2, Bruce J. Paster1,3, Lauren N. Stokes1, Ingar Olsen2, Floyd E. Dewhirst1,3
1Department of Molecular Genetics, The Forsyth Institute
2Faculty of Dentistry, University of Oslo, Oslo, Norway
3Department of Oral and Developmental Biology, Harvard School of Dental Medicine, Boston, Massachusetts

Tóm tắt

TÓM TẮT Hơn 700 loài vi khuẩn hoặc phylotype, trong đó hơn 50% chưa được nuôi cấy, đã được phát hiện trong khoang miệng. Mục tiêu của chúng tôi là (i) sử dụng các kỹ thuật phân tử độc lập với nuôi cấy để mở rộng kiến thức về sự đa dạng vi khuẩn trong khoang miệng của con người khỏe mạnh, bao gồm cả những loài vi khuẩn chưa được nuôi cấy, và (ii) xác định tính đặc hiệu theo vị trí và đối tượng của sự thuộc địa của vi khuẩn. Chín vị trí từ năm đối tượng lâm sàng khỏe mạnh đã được phân tích. Các vị trí này bao gồm mặt lưng của lưỡi, hai bên lưỡi, biểu mô má, khẩu cái cứng, khẩu cái mềm, mảng bám trên bề mặt răng, mảng bám bên dưới nướu, tiền đình hàm trên và amidan. Gen 16S rRNA từ DNA mẫu đã được khuếch đại, nhân bản và chuyển vào Escherichia coli . Các chuỗi gen 16S rRNA đã được sử dụng để xác định danh tính loài hoặc họ hàng gần nhất. Trong 2.589 mẫu nhân bản, 141 loài chủ yếu đã được phát hiện, trong đó hơn 60% chưa được nuôi cấy. Mười ba phylotype mới đã được xác định. Các loài chung cho tất cả các vị trí thuộc về các chi Gemella , Granulicatella , Streptococcus , và Veillonella . Trong khi một số loài có tính đặc hiệu theo đối tượng và được phát hiện ở hầu hết các vị trí, các loài khác lại có tính đặc hiệu theo vị trí. Hầu hết các vị trí có từ 20 đến 30 loài chủ yếu khác nhau, và số lượng loài chủ yếu từ cả chín vị trí trên mỗi cá nhân nằm trong khoảng từ 34 đến 72. Các loài thường liên quan đến bệnh nha chu và sâu răng không được phát hiện. Có một hệ vi sinh vật vi khuẩn chủ yếu đặc trưng của khoang miệng khỏe mạnh, rất đa dạng và có tính đặc hiệu theo vị trí và đối tượng. Việc hoàn toàn xác định hệ vi sinh vật của khoang miệng khỏe mạnh của con người là rất quan trọng trước khi chúng ta có thể hiểu được vai trò của vi khuẩn trong các bệnh lý miệng.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1902/jop.1999.70.1.13

10.1902/jop.1996.67.10s.1123

10.1128/JCM.40.3.1001-1009.2002

10.4065/72.6.532

10.1093/eurheartj/5.suppl_C.45

10.1111/j.1600-051X.2005.00670.x

10.1093/nar/gki038

10.1046/j.1440-1754.2000.00447.x

10.1099/00222615-39-3-179

10.1128/jcm.34.3.537-542.1996

10.1177/00220345890680050101

10.1128/iai.13.1.238-246.1976

Jukes, T. H., and C. R. Cantor. 1969. Evolution of protein molecules, vol. 3, p. 21-132. In H. N. Munro (ed.), Mammalian protein metabolism. Academic Press, Inc., New York, N.Y.

10.1099/00207713-45-2-406

10.1128/JCM.41.2.558-563.2003

10.1073/pnas.96.25.14547

10.1177/154405910308200503

10.1007/BF02539153

10.1034/j.1600-051X.2003.00376.x

10.1902/annals.1998.3.1.233

10.1128/JB.183.12.3770-3783.2001

10.1128/JCM.40.6.2187-2191.2002

10.1902/annals.2002.7.1.8

Saitou, N., and M. Nei. 1987. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. Evol.4:406-425.

10.1111/j.1348-0421.2000.tb02545.x

10.1902/jop.1999.70.7.793

10.1111/j.1600-051X.1998.tb02419.x

Van de Peer, Y., and R. De Wachter. 1994. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment. Comput. Appl. Biosci.10:569-570.

10.1086/516215

10.1128/IAI.68.3.1374-1382.2000

10.1128/jcm.25.3.522-525.1987

10.1128/jb.172.3.1673-1675.1990

10.1099/jmm.0.04950-0

10.1001/archinte.160.18.2749

Thông tin
Thông tin xuất bản

Journal of Clinical Microbiology

Tập 43 Số 11

5721-5732

Thông tin tác giả