Nhiễm trùng đường hô hấp và nhiễm trùng máu mắc phải tại cộng đồng và bệnh viện ở những bệnh nhân nhập viện với viêm phổi COVID-19

Springer Science and Business Media LLC - Tập 9 Số 1 - 2021
Kirstine Kobberøe Søgaard1, Veronika Baettig2, Michael Osthoff3, Stephan Märsch4, Karoline Leuzinger5, Michael Schweitzer6, Julian Meier6, Stefano Bassetti3, Roland Bingisser7, Christian H. Nickel7, Nina Khanna2, Sarah Tschudin‐Sutter2, Maja Weisser2, Manuel Battegay2, Hans H. Hirsch2, Hans Pargger4, Martin Siegemund8, Adrian Egli6
1Clinical Bacteriology and Mycology, University Hospital Basel, Petersgraben 4, 4031, Basel, Switzerland
2Division of Infectious Diseases, Hospital Epidemiology, University Hospital Basel and University of Basel, Basel, Switzerland
3Division of Internal Medicine, University Hospital Basel, Basel, Switzerland
4Department of Intensive Care Medicine, University Hospital Basel, Basel, Switzerland
5Clinical Virology, Laboratory Medicine, University Hospital Basel, Basel, Switzerland
6Department of Biomedicine, Applied Microbiology Research, University of Basel, Basel, Switzerland
7Department of Emergency Medicine, University Hospital Basel, Basel, Switzerland
8Department of Clinical Research, University Hospital Basel, Basel, Switzerland

Tóm tắt

Tóm tắt Mục tiêu

SARS-CoV-2 có thể gây tổn thương phổi cấp tính, và nhiễm trùng thứ phát do đó là biến chứng quan trọng ở bệnh nhân viêm phổi COVID-19. Tuy nhiên, thông tin chi tiết về các nhiễm trùng mắc phải tại cộng đồng và bệnh viện ở những bệnh nhân viêm phổi COVID-19 còn rất hạn chế.

 Phương pháp

Chúng tôi xác định 220 bệnh nhân dương tính với SARS-CoV-2 đã nhập viện tại Bệnh viện Đại học Basel, Thụy Sĩ (từ ngày 25 tháng 2 đến ngày 31 tháng 5 năm 2020). Chúng tôi loại trừ bệnh nhân từ chối đồng ý chung (n = 12), bệnh nhân không có bằng chứng lâm sàng của viêm phổi (n = 29), và bệnh nhân nhập viện dưới 24 giờ (n = 17). Chúng tôi đánh giá tần suất nhiễm trùng mắc phải tại cộng đồng và bệnh viện bằng cách sử dụng các mẫu nuôi cấy hô hấp và máu kết hợp với chẩn đoán kháng nguyên, chẩn đoán dựa trên nuôi cấy, và chẩn đoán phân tử. Đối với bệnh nhân ICU, tất cả các phát hiện lâm sàng và vi sinh vật được đánh giá lại một cách liên ngành (chăm sóc tích cực, bệnh truyền nhiễm, và vi sinh vật học lâm sàng), và đạt được thỏa thuận để phân loại bệnh nhân có nhiễm trùng.

 Kết quả

Trong nhóm cuối cùng gồm 162 bệnh nhân nhập viện (tuổi trung bình 64.4 năm (IQR, 50.4–74.2); 61.1% nam giới), 41 (25.3%) bệnh nhân được nhập viện tại khoa chăm sóc tích cực, 34/41 (82.9%) cần hỗ trợ thông khí cơ học, và 17 (10.5%) trong số tất cả bệnh nhân nhập viện đã tử vong. Tổng cộng, 31 ca nhiễm trùng được chẩn đoán bao gồm năm ca nhiễm virus đồng mắc, 24 ca nhiễm khuẩn, và ba ca nhiễm nấm (viêm phổi liên quan đến máy thở, n = 5; viêm khí phế quản, n = 13; viêm phổi, n = 1; và nhiễm trùng máu, n = 6). Thời gian trung bình để phát triển nhiễm trùng đường hô hấp là 12.5 ngày (IQR, 8–18) và thời gian để nhiễm trùng máu là 14 ngày (IQR, 6–30). Nhiễm khuẩn và nhiễm nấm mắc ở bệnh viện xảy ra thường xuyên hơn ở bệnh nhân ICU so với những bệnh nhân khác (36.6% so với 1.7%). Điều trị kháng sinh hoặc thuốc kháng nấm đã được áp dụng cho 71 (43.8%) bệnh nhân.

 Kết luận

Nhiễm trùng virus và vi khuẩn mắc phải tại cộng đồng là hiếm gặp ở bệnh nhân viêm phổi COVID-19. Ngược lại, nhiễm khuẩn hoặc nhiễm nấm mắc phải tại bệnh viện thường xuyên làm phức tạp quá trình điều trị ở bệnh nhân ICU.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Wu CP, Adhi F, Highland K. Recognition and management of respiratory coinfection and secondary bacterial pneumonia in patients with COVID-19: Posted april 27, 2020. Cleve Clin J Med. 2020;87(11):659–63.

Lansbury L, Lim B, Baskaran V, Lim WS. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J Infect. 2020;81(2):266–75.

Langford BJ, So M, Raybardhan S, Leung V, Westwood D, MacFadden DR, et al. Bacterial co-infection and secondary infection in patients with COVID-19: a living rapid review and meta-analysis. Clin Microbiol Infect. 2020;26(12):1622–9.

Hughes S, Troise O, Donaldson H, Mughal N, Moore LSP. Bacterial and fungal coinfection among hospitalized patients with COVID-19: a retrospective cohort study in a UK secondary-care setting. Clin Microbiol Infect. 2020;26(10):1395–9.

Garcia-Vidal C, Sanjuan G, Moreno-García E, Puerta-Alcalde P, Garcia-Pouton N, Chumbita M, et al. Incidence of co-infections and superinfections in hospitalised patients with COVID-19: a retrospective cohort study. Clin Microbiol Infect. 2020. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.07.041.

Contou D, Claudinon A, Pajot O, Micaëlo M, Longuet Flandre P, Dubert M, et al. Bacterial and viral co-infections in patients with severe SARS-CoV-2 pneumonia admitted to a French ICU. Ann Intensive Care. 2020;10(1):119.

Engsbro AL, Israelsen SB, Pedersen M, Tingsgaard S, Lisby G, Andersen CØ, Benfield T. Predominance of hospital-acquired bloodstream infection in patients with Covid-19 pneumonia. Infect Dis. 2020;52:919–22.

Giacobbe DR, Battaglini D, Ball L, Brunetti I, Bruzzone B, Codda G, et al. Bloodstream infections in critically ill patients with COVID-19. Eur J Clin Investig. 2020;50(10):e13319.

Leuzinger K, Roloff T, Gosert R, et al. Epidemiology of SARS-CoV-2 emergence amidst community-acquired respiratory viruses. J Infect Dis. 2020;222(8):1270–9.

Osthoff M, Gürtler N, Bassetti S, Balestra G, Marsch S, Pargger H, et al. Impact of MALDI-TOF-MS-based identification directly from positive blood cultures on patient management: a controlled clinical trial. Clin Microbiol Infect. 2017;23:78–85.

Metlay JP, Waterer GW, Long AC, Anzueto A, Brozek J, Crothers K, et al. Diagnosis and treatment of adults with community-acquired pneumonia. Am J Respir Crit Care Med. 2019;200:e45–67.

Magill SS, Klompas M, Balk R, Burns SM, Deutschman CS, Diekema D, et al. Developing a new, national approach to surveillance for ventilator-associated events. Crit Care Med. 2013;41:1096–9.

Feng Y, Ling Y, Bai T, et al. COVID-19 with different severities: a multicenter study of clinical features. Am J Respir Crit Care Med. 2020;201:1380–8.

Lippi G, Mattiuzzi C, Sanchis-Gomar F, Henry BM. Clinical and demographic characteristics of patients dying from COVID-19 in Italy versus China. J Med Virol. 2020. https://doi.org/10.1002/jmv.25860.

Li LQ, Huang T, Wang YQ, Wang ZP, Liang Y, Huang TB, Zhang HY, Sun W, Wang Y. COVID-19 patients' clinical characteristics, discharge rate, and fatality rate of meta-analysis. J Med Virol. 2020;92(6):577–83.

Clancy CJ, Nguyen MH. COVID-19, superinfections and antimicrobial development: What can we expect? Clin Infect Dis. 2020. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa524.

Dudoignon E, Caméléna F, Deniau B, Habay A, Coutrot M, Ressaire Q, et al. Bacterial Pneumonia in COVID-19 critically ill patients: a case series. Clin Infect Dis. 2020:ciaa762. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa762.

Papazian L, Klompas M, Luyt CE. Ventilator-associated pneumonia in adults: a narrative review. Intensive Care Med. 2020;46:888–906.

Richardson S, Hirsch JS, Narasimhan M, Crawford JM, McGinn T, Davidson KW, et al. Presenting characteristics, comorbidities, and outcomes among 5700 patients hospitalized with COVID-19 in the New York City area. JAMA - J Am Med Assoc. 2020;323:2052–9.

Rutsaert L, Steinfort N, Van Hunsel T, Bomans P, Naesens R, Mertes H, et al. COVID-19-associated invasive pulmonary aspergillosis. Ann Intensive Care. 2020;10:71.

Alanio A, Dellière S, Fodil S, Bretagne S, Mégarbane B. High prevalence of putative invasive pulmonary aspergillosis in critically ill COVID-19 patients. Lancet Respir Med. 2020;8(6):e48–9. https://doi.org/10.1016/S2213-2600(20)30237-X.

Fekkar A, Poignon C, Blaize M, Lampros A. Fungal infection during COVID-19: does Aspergillus mean secondary invasive aspergillosis? Am J Respir Crit Care Med. 2020. https://doi.org/10.1164/rccm.202005-1945LE.

Blyth CC, Webb SAR, Kok J, Dwyer DE, van Hal SJ, Foo H, et al. The impact of bacterial and viral co-infection in severe influenza. Influenza Other Respir Viruses. 2013;7:168–76.

Martín-Loeches I, Sanchez-Corral A, Diaz E, Granada RM, Zaragoza R, Villavicencio C, et al. Community-acquired respiratory coinfection in critically III patients with pandemic 2009 influenza A(H1N1) virus. Chest. 2011;139:555–62.

Rice TW, Rubinson L, Uyeki TM, Vaughn FL, John BB, Miller RR, et al. Critical illness from 2009 pandemic influenza A virus and bacterial coinfection in the United States. Crit Care Med. 2012;40:1487–98.

Chertow DS, Memoli MJ. Bacterial coinfection in influenza: a grand rounds review. JAMA - J Am Med Assoc. 2013;309:275–82.

Wauters J, Baar I, Meersseman P, Meersseman W, Dams K, De Paep R, et al. Invasive pulmonary aspergillosis is a frequent complication of critically ill H1N1 patients: A retrospective study. Intensive Care Med. 2012;38:1761–8.

Beumer MC, Koch RM, van Beuningen D, OudeLashof AM, van de Veerdonk FL, Kolwijck E, et al. Influenza virus and factors that are associated with ICU admission, pulmonary co-infections and ICU mortality. J Crit Care. 2019;50:59–65.

Thông tin
Thông tin xuất bản

Springer Science and Business Media LLC

Tập 9 Số 1

Thông tin tác giả