Trải Nghiệm Lâm Sàng và Tư Vấn của Những Người Tiên Phong Sử Dụng Giải Mã Toàn Bộ Exome

Nonie S. Arora1, Eden Haverfield2, Gabriele Richard2, Susanne B. Haga1, Rachel Mills1
1Center for Applied Genomics & Precision Medicine, Duke University, Box 90141, 304 Research Drive, Durham, NC, 27708 USA
2GeneDx, 207 Perry Parkway, Gaithersburg, MD, 20877 USA

Tóm tắt

Tóm tắtHiện tại, có rất ít dữ liệu liên quan đến thực hành tư vấn di truyền cho giải mã toàn bộ exome (WES). Việc hiểu biết tốt hơn về cách thức mà các nhà tư vấn di truyền và các nhà cung cấp khác đang giáo dục, tư vấn và truyền đạt kết quả có thể xác định các xu hướng thực hành và nhu cầu của bệnh nhân hoặc nhà cung cấp. Giữa tháng 4 năm 2013 và tháng 12 năm 2014, chúng tôi đã khảo sát các nhà cung cấp đã yêu cầu làm xét nghiệm WES từ GeneDx, một phòng thí nghiệm được chứng nhận CLIA. Có 49 người tham gia đã hoàn thành khảo sát; 41% số người tham gia báo cáo đã có chứng nhận hội đồng về tư vấn di truyền. Tư vấn trước và sau thử nghiệm đã được hoàn thành trong tất cả nhưng một trường hợp. Tư vấn trước thử nghiệm kéo dài dưới 1 giờ cho 53% số trường hợp và từ 1 đến 2 giờ cho 43%. Các chủ đề được thảo luận với tất cả bệnh nhân bao gồm sự đồng ý cho xét nghiệm và các phát hiện vô tình; các chủ đề khác thì rất đa dạng. Ngược lại với tư vấn trước thử nghiệm, 59% báo cáo rằng tư vấn sau thử nghiệm kéo dài từ 1 đến 2 giờ và 33% ít hơn một giờ; tư vấn sau thử nghiệm có thời gian dài hơn đáng kể ở những trường hợp có chẩn đoán xác định so với những trường hợp không có (p = 0.0129). Các phát hiện từ khảo sát cho thấy có sự biến đổi nhất định về thời gian dành cho tư vấn và các chủ đề được thảo luận trong tư vấn trước thử nghiệm. Việc khám phá thêm, các tài nguyên giáo dục cho bệnh nhân và nhà cung cấp, và có thể là các hướng dẫn cụ thể hơn về tư vấn cho WES là cần thiết.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1038/gim.2013.94

10.1016/S0140-6736(10)60452-7

Atwal P. S. Brennan M. L. Cox R. Niaki M. Platt J. Homeyer M. Kwan A. Parkin S. Schelley S. Slattery L. Wilnai Y. Bernstein J. A. Enns G. M. &Hudgins L.(2014).Clinical whole‐exome sequencing: are we there yet?Genetics in Medicine.doi:10.1038/gim.2014.10.

10.1097/GIM.0b013e318220aaba

10.1056/NEJMra1312543

10.1073/pnas.0910672106

10.1001/jama.2014.1717

Farwell K. D. Shahmirzadi L. El‐Khechen D. Powis Z. Chao E. C. Davis B. T. Baxter R. M. Zeng W. Mroske C. Parra M. C. Gandomi S. K. Lu I. Li X. Lu H. Lu H. M. Salvador D. Ruble D. Lao M. Fischbach S. Wen J. Lee S. Elliott A. Dunlop C. L. &Tang S.(2014).Enhanced utility of family‐centered diagnostic exome sequencing with inheritance model‐based analysis: results from 500 unselected families with undiagnosed genetic conditions.Genetics in Medicine.doi:10.1038/gim.2014.154.

10.1126/scitranslmed.3006468

10.1001/jamainternmed.2013.12048

10.1007/s00439-011-0964-2

Lee H. Deignan J. L. Dorrani N. Strom S. P. Kantarci S. Quintero‐Rivera F. Das K. Toy T. Harry B. Yourshaw M. Fox M. Fogel B. L. Martinez‐Agosto J. A. Wong D. A. Chang V. Y. Shieh P. B. Palmer C. G. Dipple K. M. Grody W. W. Vilain E. &Nelson S. F.(2014).Clinical exome sequencing for genetic identification of rare Mendelian disorders.JAMA.doi:10.1001/jama.2014.14604.

Machini K. Douglas J. Braxton A. Tsipis J. &Kramer K.(2014).Genetic counselors' views and experiences with the clinical integration of genome sequencing.Journal of Genetic Counseling.doi:10.1007/s10897‐014‐9709‐4.

10.1126/scitranslmed.3005785

10.1097/GIM.0b013e318182206f

Neidich J. Scacheri C. Bale S. Retterer K. Smaoui N. Vitazka P. …Haverfield E.(2014).Diagnostic laboratory experience with clinical exome sequencing: 788 probands over one year.Annual ACMG Clinical Genetics Meeting Abstrac 567.

NSGC. (2013).Incidental findings in genetic testing.http://nsgc.Org/p/bl/et/blogid=47&blogaid=30.

10.1007/s10897-014-9732-5

10.1155/1999/140498

10.1038/gim.2013.183

Taylor J. C. Martin H. C. Lise S. Broxholme J. Cazier J. B. Rimmer A. Kanapin A. Lunter G. Fiddy S. Allan C. Aricescu A. R. Attar M. Babbs C. Becq J. Beeson D. Bento C. Bignell P. Blair E. Buckle V. J. Bull K. Cais O. Cario H. Chapel H. Copley R. R. Cornall R. Craft J. Dahan K. Davenport E. E. Dendrou C. Devuyst O. Fenwick A. L. Flint J. Fugger L. Gilbert R. D. Goriely A. Green A. Greger I. H. Grocock R. Gruszczyk A. V. Hastings R. Hatton E. Higgs D. Hill A. Holmes C. Howard M. Hughes L. Humburg P. Johnson D. Karpe F. Kingsbury Z. Kini U. Knight J. C. Krohn J. Lamble S. Langman C. Lonie L. Luck J. McCarthy D. McGowan S. J. McMullin M. F. Miller K. A. Murray L. Németh A. H. Nesbit M. A. Nutt D. Ormondroyd E. Oturai A. B. Pagnamenta A. Patel S. Y. Percy M. Petousi N. Piazza P. Piret S. E. Polanco‐Echeverry G. Popitsch N. Powrie F. Pugh C. Quek L. Robbins P. A. Robson K. Russo A. Sahgal N. vanSchouwenburg P. A. Schuh A. Silverman E. Simmons A. Sørensen P. S. Sweeney E. Taylor J. Thakker R. V. Tomlinson I. Trebes A. Twigg S. R. Uhlig H. H. Vyas P. Vyse T. Wall S. A. Watkins H. Whyte M. P. Witty L. Wright B. Yau C. Buck D. Humphray S. Ratcliffe P. J. Bell J. I. Wilkie A. O. Bentley D. Donnelly P. &McVean G.(2015).Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders.Nature Genetics.doi:10.1038/ng.3304.

Tomlinson A. N. Skinner D. Perry D. L. Scollon S. R. Roche M. I. &Bernhardt B. A.(2015).“Not tied up neatly with a bow”: professionals' challenging cases in informed consent for genomic sequencing.Journal of Genetic Counseling.doi:10.1007/s10897‐015‐9842‐8.

10.1007/s10689-010-9326-9

10.1056/NEJMoa1306555

Yang Y. Muzny D. M. Xia F. Niu Z. Person R. Ding Y. Ward P. Braxton A. Wang M. Buhay C. Veeraraghavan N. Hawes A. Chiang T. Leduc M. Beuten J. Zhang J. He W. Scull J. Willis A. Landsverk M. Craigen W. J. Bekheirnia M. R. Stray‐Pedersen A. Liu P. Wen S. Alcaraz W. Cui H. Walkiewicz M. Reid J. Bainbridge M. Patel A. Boerwinkle E. Beaudet A. L. Lupski J. R. Plon S. E. Gibbs R. A. &Eng C. M.(2014).Molecular findings among patients referred for clinical whole‐exome sequencing.JAMA.doi:10.1001/jama.2014.14601.