Đặc điểm của vi khuẩn lam phân nhánh thật từ các địa điểm địa nhiệt và suối nước nóng ở Costa Rica

Wiley - Tập 10 Số 2 - Trang 460-473 - 2008
Karin Finsinger1, Ingeborg Scholz1, Aurelio Serrano2, Saylen Morales3, Lorena Uribe‐Lorío3, Marielos Mora3, Ana Sittenfeld3, J. Weckesser1, Wolfgang R. Hess1
1University of Freiburg, Faculty of Biology, Schänzlestr. 1, D-79104 Freiburg, Germany
2Instituto de Bioquimica Vegetal y Fotosíntesis, CSIC-Universidad de Sevilla Seville, Spain.
3Center for Research in Cell and Molecular Biology (CIBCM), University of Costa Rica, San José, Costa Rica.

Tóm tắt

Tóm tắt

Costa Rica nằm ở trung tâm của điểm nóng đa dạng sinh học Mesoamerican. Đến nay, rất ít thông tin được biết đến về vi khuẩn lam từ khu vực này. Bài báo này đã tiến hành đặc trưng bốn mẫu tách chiết thuộc bộ Stigonematales (phân đoạn V) theo phương pháp đa pha. Tất cả các chủng đều được tách chiết từ các địa điểm địa nhiệt và suối nước nóng của Costa Rica. Tuy nhiên, một trong số đó, được xác định là Westiellopsis sp. Ar73, không phát triển ở nhiệt độ cao hơn 40°C. Dựa trên trình tự 16S rRNA giống hệt với nhiều chủng Westiellopsis sp. đã được tách chiết trước đó và Fischerella muscicola, có thể suy luận rằng chúng có sự phân bố rộng rãi ở các khu vực nhiệt đới và á nhiệt đới. Ngược lại, các mẫu MV9, MV11 và RV14 phát triển tốt ở nhiệt độ lên đến 50–55°C. Dựa trên dữ liệu hình thái học, siêu cấu trúc, phân tử và sinh lý học, MV9, MV11 và RV14 đã được xác định thuộc về chi Fischerella. Hai loại không gian phiên mã giữa gene (ITS) khác nhau, có hoặc không có gene tRNA, đã được phát hiện cho tất cả các Stigonematales được phân tích ở đây, cho thấy sự đa dạng ITS là đặc trưng của vi khuẩn lam có heterocyst. Trong các cây phát sinh chủng loại, các loài Fischerella này hình thành một nhánh mới và khác biệt trong dòng dõi rộng hơn của Fischerella nhiệt thống (Mastigocladus cf. laminosus), điều này có thể đại diện cho một dòng dõi địa lý. Do đó, sự cách ly địa lý có thể là một khía cạnh chưa được đánh giá đúng của tiến hóa vi sinh vật. Các chủng được trình bày ở đây thích hợp để trở thành những mô hình mới trong việc nghiên cứu nhóm vi khuẩn lam này.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1128/JB.186.9.2629-2635.2004

10.1093/nar/25.17.3389

Anagnostidis K., 1990, Modern approach to the classification system of cyanophytes 5 Stigonematales, Algol Stud, 59, 1

10.1007/PL00006363

10.1016/0022-2836(89)90002-8

Bourrelly P., 1986, Les Algues Bleues et Rouges, les Eugléniens, Peridiniens et Cryptomonadines

10.1093/oxfordjournals.molbev.a003877

10.1128/MMBR.33.4.476-504.1969

10.1111/j.0022-3646.1992.00737.x

10.1128/mr.59.4.623-645.1995

10.1093/bioinformatics/19.2.299

10.1126/science.289.5480.756

10.1006/jmbi.1997.1566

Frémy M.P., 1936, Remarques sur la morphologie et la biologie de l'Hapalosiphon laminosus Hansg, Annales Protistol, 5, 175

10.1016/S0014-5793(03)01124-4

García‐Martinez J., 1996, Comparison of the small 16S to 23S intergenic spacer region (ISR) of the RNA operons of some Escherichia coli strains of the ECOR collection and E. coli K12, J Bacteriol, 178, 6374, 10.1128/jb.178.21.6374-6377.1996

10.1023/A:1006545303412

Geitler L., 1932, Kryptogamenflora Von Deutschland, Oesterreich und der Schweiz, 1

10.1128/jb.170.8.3584-3592.1988

10.1146/annurev.arplant.48.1.327

10.1007/BF00429627

10.1099/ijs.0.02744-0

10.1099/ijs.0.02270-0

10.1128/AEM.71.2.1097-1100.2005

10.1007/s00299-001-0399-7

Hayes J.M., 1983, Earth's Earliest Biosphere: Its Origin and Evolution, 291

Hoffmann L., 2001, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 589

10.1127/1864-1318/2005/0117-0095

10.1098/rstb.2006.1838

Ionescu D., 2007, Algae and Cyanobacteria in Extreme Environments, 413

10.1099/00221287-146-6-1275

10.1016/S1369-5274(00)00074-6

10.1007/s00792-005-0456-1

10.1127/1864-1318/2003/0109-0305

10.1093/bib/5.2.150

10.1139/w05-038

10.1093/nar/25.5.955

10.1006/jmbi.1999.2700

10.1128/AEM.70.2.736-744.2004

10.1128/AEM.66.10.4222-4229.2000

10.1128/AEM.72.4.2793-2800.2006

10.1128/AEM.02945-06

10.1038/35002501

10.1093/dnares/9.4.123

10.1128/jb.157.2.514-525.1984

10.1099/ijs.0.03008-0

10.1046/j.1462-2920.2003.00460.x

10.1128/AEM.66.3.1038-1049.2000

Rippka R., 1992, Catalogue of Strains, 103

Rippka R., 1979, Generic assignments, strain history and properties of pure culture of cyanobacteria, J Gen Microbiol, 111, 1

10.1128/AEM.68.3.1180-1191.2002

10.1093/bioinformatics/18.3.502

10.1126/science.149.3690.1365

10.1007/BF02502530

10.2323/jgam.49.191

10.1016/j.femsec.2004.12.007

10.1073/pnas.0507513103

Stevens S.E., 1985, Effect of nitrogen starvation on the morphology and ultrastructure of the cyanobacterium Mastigocladus laminosus, J Bacteriol, 161, 1215, 10.1128/jb.161.3.1215-1218.1985

10.1029/96PA03934

10.1093/nar/25.24.4876

10.1073/pnas.0600999103

10.1111/j.1550-7408.1999.tb04612.x

Yock‐Fung A.(1998)Chemical and isotopic studies in the Miravalles geothermal field Costa Rica.United Nations University: Geothermal Training Programme Iceland; Reports 1998 pp.461–499.

10.1093/molbev/msh075

10.1093/nar/gkg595